Eppiq1号机组A/J公司
QTL变量细节
总结
QTL变体: Eppiq1号机组A/J公司
姓名: 脉冲前抑制QTL 1升高;A/J公司
MGI编号: 管理编号:3612494
数量限制: Eppiq1号机组  位置:未知遗传位置:Chr16,突触
变体
起源
试样应变:  A/J公司
变体
描述
通道类型:    QTL(数量限制)
继承:    其他(见注释)
表型
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笔记
Eppiq1表现出过度使用。与纯合子动物相比,杂合子动物表现出更高的脉冲前抑制。

该QTL的定位和表型信息,其变体和相关标记

J: 104045个

影响声惊吓反应脉冲前抑制(PPI)的QTL定位于染色体替代品系中的小鼠16号染色体。C57BL/6J-色谱16A/J公司/Na在C57BL/6J遗传背景上携带一对a/J衍生的16号染色体,与C57BL/6J相比,在70 dB和80 dB预脉冲强度下表现出明显更高的PPI。

为了定位QTL,对来自(C57BL/6J-Chr16)的87只雄性动物进行了连锁分析A/J公司/Na×C57BL/6J)F2杂交。分析中使用了41个单核苷酸多态性(SNPs),在16号染色体上间隔约1 cM。确定了两个位点,分别为Eppiq1(升高的预脉冲抑制QTL 1)和Eppiq 2(升高的前脉冲抑制QTL 2)。近端位点Eppiq1映射到40 Mb-51.5 Mb(LOD=3.9)(通过MGI Curators约29 cM)之间的区间,远端位点Eppi q2映射到78.6 Mb-83.9 Mb(LOD=4.7)(通过MGI Curator约55 cM)。Eppiq1和Eppiq 2是独立的位点,不相互作用。与A/J-或C57BL/6J-衍生等位基因纯合的动物相比,Eppiq1的杂合性导致PPI升高(遗传过度模型)。该基因座解释了F2代动物19%的变异。序列变异在A/J和C57BL/6J之间的Eppiq1的潜在候选基因为Drd3(23.3 cM)、Lsamp、Gap43(29.5 cM),Zbtb20(28.9 cM)和Tagln3。Eppiq2的A/J衍生等位基因赋予PPI升高的隐性遗传模式。该基因座解释了F2代动物23%的变异。Btg3是本研究中确定的Eppiq2唯一一个在A/J和C57BL/6J之间存在序列变异的潜在候选基因。

工具书类
原件:  J: 104045个Petryshen TL等,使用染色体替代菌株在小鼠16号染色体上鉴定出两个用于脉冲前抑制惊吓的数量性状位点。遗传学。2005年12月;171(4):1895-904
全部:  1个参考

参与项目:
小鼠基因组数据库(MGD)、基因表达数据库(GXD)、人类癌症小鼠模型数据库(MMHCdb)(前身为小鼠肿瘤生物学(MTB))、基因本体(GO)
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