|
QTL变体: |
真空4A/J公司 |
姓名: |
自愿饮酒QTL4;A/J公司 |
MGI编号: |
MGI:3590264 |
数量限制: |
真空4 位置:未知遗传位置:峰值相关区/等位基因的Chr2,cM位置:27.37 cM |
QTL注: |
基于与LOD峰值评分相关的标记的基因组坐标 |
|
|
通道类型: |
|
QTL(数量限制) |
突变: |
|
未定义 |
|
|
与C57BL/6J相比,该等位基因导致饮酒量增加。(J: 100637个)
|
|
|
|
该QTL的定位和表型信息,其变体和相关标记
对一系列AXB/BXA(a=a/J;B=C57BL/6J)重组自交系(RI)菌株和17株AcB和23株BcA重组同源株(RC)菌株进行连锁分析,以确定与自愿饮酒(VAC)相关的QTL。动物在8周龄时出现表型。在强迫暴露于10%酒精溶液4天后,动物可以在水和10%酒精溶液之间自由选择3周。一组780个多态性标记用于基因组扫描。 在AXB/BXA RI序列中,在D2Mit74(LOD=6.13)附近的小鼠2号染色体上,与酒精偏好的显著关联映射到107 cM。该基因座占雄性和雌性小鼠变异的30%,命名为Vacq1(自愿饮酒QTL 1)。Vacq1 QTL区间由标记D2Mit148(105 cM)和D2Mit266(109 cM)定义。Vacq1的C57BL/6J-衍生等位基因导致饮酒量增加。Vacq1的潜在候选基因是Ntsr1(107 cM)和Chrna4(108 cM)。Vacq1似乎受小鼠15号染色体上一个名为Vacq2(自愿饮酒QTL 2)的基因座的影响。在Vacq1和Vacq2处C57BL/6J衍生等位基因纯合的动物表现出显著增加的酒精偏好。小鼠15号染色体上的Vacq2与Pdgfb(47 cM)相连。Vacq2的潜在候选基因为Bzrp(43.3 cM)和Cyp2d(47.2 cM)。之前确定的Vacq2附近的QTL定位是Drb7(45 cM)和Lore5(46 cM)。AcB RC系列中D2Mit359附近5 cM的雄性动物与酒精偏好显著相关。该基因座具有雄性特异性效应,命名为Vacq3(自愿饮酒QTL 3)。Vacq3 QTL区间跨越5 cM-31.7 cM。Vacq2的C57BL/6J衍生等位基因导致饮酒量增加。之前在Vacq3附近确定的酒精偏好QTL定位为Etohc1(28 cM)和Etohcta2(23.5 cM)。在BcA-RC序列中,小鼠第2染色体D2Mit241附近30 cM的雄性和雌性动物与酒精偏好有显著关联。该位点被命名为Vacq4(自愿饮酒QTL 4)。Vacq4的QTL区间跨越30 cM-37 cM。在Vacq4A/J衍生的等位基因导致饮酒量增加。之前在Vacq4附近确定的QTL定位为Ap2q(34 cM)、Alcp1(47.5 cM)和Alcw4(37 cM)。AcB-RC系列雄性动物的酒精偏好与D13Mit266附近小鼠13号染色体上的16 cM显著相关。该基因座被命名为Vacq5(自愿饮酒QTL 5)。Vacq5的QTL区间跨越9 cM-30 cM。Vacq6的C57BL/6J-衍生等位基因导致雄性动物饮酒量增加。Vacq5的一个潜在候选基因是Agtr1(16cM)。在BcA-RC序列中,小鼠第10染色体D10Mit80附近的4cM与酒精偏好有显著关联。该基因座命名为Vacq6(自愿饮酒QTL 6),QTL区间跨越4 cM-5 cM。Vacq 6的A/J衍生等位基因使雄性和雌性动物的饮酒量增加。在BcA-RC序列中,小鼠12号染色体上靠近D12Mit37的1 cM与酒精偏好有显著关联。该基因座被命名为Vacq7(自愿饮酒QTL 7)。Vacq7 QTL区间跨越1 cM-5 cM。在Vacq7A/J衍生的等位基因使雄性和雌性动物的饮酒量增加。在AXB/BXA RI序列中,与酒精偏好相关的提示性连锁映射到小鼠11号染色体Pmv22附近的8 cM,小鼠10号染色体D10Mit126附近的21 cM,鼠12号染色体D12Mit37附近的1 cM,以及小鼠16号染色体D16Mit125附近的29 cM。一个提示性雄性特异性基因座在D7Mit105附近的小鼠7号染色体上定位于63.5 cM,一个提示性雌性特异性基因座在D11Mit120附近的小鼠11号染色体上定位于47.5 cM。在AcB RC系列中,与酒精偏好相关的提示性连锁映射到小鼠第5染色体上D5Mit387附近的15 cM,小鼠第7染色体上D7Mit105附近的63.5 cM,鼠第8染色体上D8Mit292附近的19 cM,老鼠第10染色体上D10Mit298附近的3 cM,以及小鼠第15染色体上D15Mit42附近的59.2 cM。在BcA-RC序列中,与酒精偏好的提示性连锁映射到D9Mit281附近小鼠9号染色体上的68 cM。
|
原件: |
J: 100637个Gill K等,来自A/J和C57BL/6J祖细胞的重组自交系和同源株酒精摄入的遗传分析。哺乳动物基因组。2005年5月;16(5):319-31 |
全部: |
1个参考 |
|