岩性3A/J公司
QTL变量细节
总结
QTL变体: 岩性3A/J公司
姓名: 致石基因3;A/J公司
MGI编号: MGI:3052787
数量限制: 岩性3  位置:Chr17:9194337-9194456基点遗传位置:Chr17,同步
变体
起源
试样应变:  A/J公司
变体
描述
通道类型:    QTL(数量限制)
笔记

该QTL的定位和表型信息,其变体和相关标记

J: 80014个

对来自(a/J x AKR/J)F1 x AKR/J回交的225只动物进行连锁分析,以确定与胆石敏感性性状相关的基因座。对平均间距为16 cM的99个微卫星位点进行了基因分型。8周龄时,将动物置于造石饮食中,持续20周龄。两种亲本菌株都表现出粘蛋白凝胶积聚和胆汁中胆固醇过饱和,但只有亲本菌株AKR/J易患胆固醇结石,发生率为20%。12周时,雄性A/J胆囊容积与雄性AKR/J动物相比显著增加。

之前确定的Lith基因(Lith1和Lith2)在此杂交中未检测到。在小鼠17号染色体上发现了一个新的位点,命名为Lith3,在D17Mit247处LOD=3.5。95%置信区间为0-7 cM。AKR/J提供了易感等位基因。与杂合性相比,Lith3的AKR/J等位基因纯合性可显著提高成石分数。Lith3的置信区间为0 cM-7 cM。Lith3还显示出与胆固醇一水合物晶体形成的暗示联系(LOD=1.4)。潜在候选基因Slc22a1在Lith3层段内绘制地图。Slc22a1 mRNA的Northern blot分析未显示A/J和AKR/J之间转录物大小或表达的差异。Slc22al1 cDNA的序列分析检测到3个不导致氨基酸变化的多态性。Lith3区间与人类染色体6q25-27同步。

在D4Mit315附近的小鼠4号染色体上,与胆结石易感性的潜在关联映射到2.2 cM(LOD=1.2),在D6Mit201附近的小鼠6号染色体上映射到60.4 cM(LOD=1.5)。AKR/J衍生的等位基因使D4Mit315的胆结石易感性增强,A/J衍生的等位基因则使D6Mit201的胆石易感性增强。D4Mit315基因座也暗示与胆甾醇单水合物晶体的形成有关(LOD=1.5)。

小鼠15号染色体上73.5 cM的一个位点显示与D15Mit16(LOD=4.2)的胆汁粘蛋白积累有关,命名为Bmca(胆汁粘素积累)。Bmca的置信区间跨越69 cM-77 cM。与杂合动物相比,Bmca AKR/J衍生等位基因的动物纯合性表现出显著增加的粘蛋白得分。该基因座还显示出与胆固醇一水合物晶体形成的暗示联系(LOD=2.3)。粘蛋白基因Glycam1(63 cM)映射到Bmca区间,被认为是一个候选基因。免疫组织化学证实了Glycam1在胆囊上皮和胆囊胆汁中的表达,但没有发现A/J和AKR/J之间的表达差异或饮食导致的表达差异。

与胆汁粘蛋白积累的潜在联系分别映射到D2Mit345附近小鼠第2染色体上的89.2 cM(LOD=1.9)、D4Mit23附近小鼠第4染色体上的36.4 cM和46.4 cM(LOD=2.3)、小鼠第15染色体上的5.5cM和25.5 cM(两个标记上的LOD=1.7)以及D16Mit19附近小鼠第16染色体上的38.7 cM(LOD=1.6)。D15Mit11基因座也显示出与胆固醇一水合物晶体形成的提示性联系(LOD=1.4)。

工具书类
原件:  J: 80014个Lammert F等人,Lith基因控制A/J和AKR/J近交系小鼠的粘蛋白积累、胆固醇结晶和胆结石形成。肝病学。2002年11月;36(5):1145-54
全部:  1个参考

参与项目:
小鼠基因组数据库(MGD)、基因表达数据库(GXD)、人类癌症小鼠模型数据库(MMHCdb)(前身为小鼠肿瘤生物学(MTB))、基因本体(GO)
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