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QTL变体: |
第19页A/J公司 |
姓名: |
肺腺瘤敏感性19;A/J公司 |
MGI编号: |
MGI:3036102 |
数量限制: |
第19页 位置:Chr17:29711164-34754437基点遗传位置:Chr17,同步 |
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该QTL的定位和表型信息,其变体和相关标记
利用(A/J x C57BL/6)高级杂交系(AIL)在F11代确认并精细定位了先前鉴定的QTL Pas1和Pas2。父母株A/J易患肺肿瘤,而父母株C57BL/6具有耐药性。 在Kras附近的小鼠6号染色体上,Pas1被解析为1 cM-1.3 cM的区间,在D6Mit57(71.7 cM)处LOD得分>150。1.7.2016-策展人注释:由于Pas1最初是在J:17778中绘制的,在1997年使用(C57BL/6J x A/J)F2交叉,其方向与此处使用的交叉不同,因此我们认为当前研究是一个单独的定位实验,并将此QTL Pas15命名为。Pas15区域中的候选基因包括Lrmp、4933403M22Rik、4930469P12Rik、Bcat1(Eca39)、5133400D11Rik(mHoj-1)和Sspn(Krag)。这些候选基因的SNP分析显示Lrmp、4933403M22Rik和4930469P12Rik中存在编码区多态性,但Bcat1(Eca39)、5133400D11Rik(mHoj-1)或Sspn(Krag)中没有。候选基因4933403M22Rik与Pas15高度相关,作者称其为Pas1c1(Pas1候选基因1)。4933403M22Rik的半定量RT-PCR分析显示C57BL/6和A/J中存在不同的亚型转录物。Pas2定位于小鼠17号染色体D17Mit23和D17Mit131之间的7.6Mb区域,在D17Mis16(17.4cM)具有最强的相关性(LOD=3.0)。Pas1和Pas2之间可能存在相互作用。1.4.2016-策展人注:由于Pas2最初在J:21801中使用(C57BL/6JOlaHsd x A/JOlaHsd)F2杂交和回交群体进行了定位,这与此处使用的杂交方向不同,因此我们认为当前研究是一个单独的定位实验,并将QTL命名为Pas19。在使用高级杂交系的研究中,未检测到Pas3。
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原件: |
J: 83970个Wang M,et al.,使用高级交叉系精细定位和鉴定候选肺腺瘤易感基因1。癌症研究,2003年6月15日;63(12):3317-24 |
全部: |
1个参考 |
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