阿勒2NOD/ShiLtJ公司
QTL变量细节
总结
QTL变体: 阿勒2NOD/ShiLtJ公司
姓名: 年龄相关性听力损失2例;NOD/ShiLtJ公司
MGI编号: MGI:2662446
数量限制: 阿勒2  位置:Chr5:79650568-79650688基点遗传位置:Chr5,cM峰相关区/等位基因位置:42.22 cM
QTL注: 基于与LOD峰值评分相关的标记的基因组坐标
变体
起源
试样应变:  NOD/ShiLtJ公司
变体
描述
通道类型:    QTL(数量限制)
突变:    未定义
    与C57BL/6J相比,该等位基因导致听力损失。(J: 81197个)
继承:    隐性的
表型
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笔记

该QTL的定位和表型信息,其变体和相关标记

J: 81197个

对110只(NOD/LtJ x C57BL/6J)F1 x NOD/LtJ回交动物进行90个微卫星标记的分型,以确定与年龄相关听力损失相关的基因座。根据听觉脑干反应(ABR)阈值测量,父母菌株NOD/LtJ在6个月大时表现出严重的听力损失。一个QTL定位于小鼠5号染色体上的44 cM,在D5Mit309处LOD得分为5.5。NOD/LtJ衍生的等位基因在这个名为Ahl2的基因座导致隐性遗传性听力损失。

作者还分析了一个(CAST/Ei x NOD/LtJ)F1 x NOD/LtJ回交群体,并在D5Mit235定位了一个LOD=4到42 cM的显著QTL。这很可能代表同一个基因座Ahl2。同样,NOD/LtJ衍生的等位基因在该位点导致隐性遗传性听力损失。

2015年12月10日策展人注:由于Ahl2最初是使用(NOD/LtJ x C57BL/6J)F1 x NOD/LtJ回交绘制的,这与第二个杂交不同,我们认为第二个交叉是一个单独的作图实验,并将该QTL命名为Ahl7。

工具书类
原件:  J: 81197个Johnson KR等人,Ahl2,影响小鼠年龄相关性听力损失的第二个基因座。基因组学。2002年11月;80(5):461-4
全部:  1个参考

贡献项目:
小鼠基因组数据库(MGD)、基因表达数据库(GXD)、人类癌症小鼠模型数据库(MMHCdb)(前身为小鼠肿瘤生物学(MTB))、基因本体论(GO)
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