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将结构引入生物学
示例:
血红蛋白
,
BRCA1_人类
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PDBe公司
›
6jxr型
电子显微镜
3.7Ω分辨率
人T细胞受体CD3复合物的结构
发布日期:
2019年9月11日
内政部:
10.2210/pdb6jxr/pdb
源生物:
智人
主要出版物:
人类T细胞受体CD3复合物组装的结构基础。
郑
L(左)
,
林
J型
,
张
B类
,
朱
年
,
锂
N个
,
谢
S公司
,
王
年
,
高
N个
,
黄
Z轴
自然
573
546-552 (2019)
项目管理标识号:31461748
相关结构:
EMD-9895
功能与生物学
细节
生化功能:
跨膜信号受体活性
生物过程:
细胞表面受体信号通路
蜂窝组件:
薄膜
序列域:
磷酸化免疫受体信号ITAM
免疫球蛋白样结构域超家族
免疫球蛋白样折叠
免疫球蛋白V-set结构域
CD3蛋白,ε/γ/δ亚基
免疫球蛋白亚型2
免疫球蛋白C1-set
T细胞受体α链,恒定结构域
还有5个域
结构分析
细节
组件组成:
异八聚体(
首选
)
PDBe复合体ID:
PDB-CPX-100921型
(首选)
录入内容:
6种不同的多肽分子
大分子(6种不同):
T细胞表面糖蛋白CD3 zeta链
链条:a、b
分子细节›
链:
a、 b条
长度:
164个氨基酸
理论重量:
18.72千达
源生物:
智人
表达式系统:
智人
UniProt公司:
标准:
第20963页
(残留物:1-164;覆盖率:100%)
基因名称:
CD247型
,
CD3Z基因
,
T3Z机场
,
TCRZ公司
序列域:
T细胞表面糖蛋白CD3 zeta链
免疫受体酪氨酸基激活基序
T细胞表面糖蛋白CD3δ链
链条:d
分子细节›
链条:
d日
长度:
171个氨基酸
理论重量:
18.95千达
源生物:
智人
表达式系统:
智人
UniProt公司:
标准:
P04234号
(残留物:1-171;覆盖率:100%)
基因名称:
CD3D系统
,
T3D型
序列域:
免疫受体酪氨酸基激活基序
T细胞表面糖蛋白CD3δ链
T细胞表面糖蛋白CD3ε链
链条:e、f
分子细节›
链:
e、 (f)
长度:
207种氨基酸
理论重量:
23.17千达
源生物:
智人
表达式系统:
智人
UniProt公司:
标准:
P07766号
(残留物:1-207;覆盖率:100%)
基因名称:
CD3E公司
,
T3E型
序列域:
免疫受体酪氨酸基激活基序
T细胞表面糖蛋白CD3ε链上的Ig样结构域
T细胞表面糖蛋白CD3γ链
链条:g
分子细节›
链条:
克
长度:
182个氨基酸
理论重量:
20.49千达
源生物:
智人
表达式系统:
智人
UniProt公司:
标准:
P09693号
(残留物:1-182;覆盖率:100%)
基因名称:
CD3G
,
T3G公司
序列域:
免疫受体酪氨酸基激活基序
T细胞表面糖蛋白CD3δ链
可能的J 11基因片段;
T细胞受体α链常数;
T细胞受体α变量12-3
链条:m
分子细节›
链条:
米
长度:
252个氨基酸
理论重量:
28.31千达
源生物:
智人
表达式系统:
智人
UniProt公司:
标准:
A0A0B4J271型
(残留物:22-114;覆盖率:100%)
标准:
A0N4Z6型
(残留物:4-20;覆盖率:85%)
标准:
P01848号
(残留物:1-140;覆盖率:100%)
基因名称:
TCRA公司
,
TRAC公司
,
TRAV12-3型
,
Tcr-α
序列域:
免疫球蛋白V-set结构域
未知功能域(DUF1968)
M1特异性T细胞受体β链;
T细胞受体β变量6-5
链:n
分子细节›
链条:
n个
长度:
291个氨基酸
理论重量:
32.5千达
源生物:
智人
表达式系统:
智人
UniProt公司:
标准:
P0DSE2型
(残留物:22-22119-310;覆盖率:67%)
标准:
A0A0K0K1A5
(残留物:23-112;覆盖率:97%)
基因名称:
TRB公司
,
TRBV6-5型
序列域:
免疫球蛋白V-set结构域
免疫球蛋白C1-set结构域
配体和环境
无结合配体
无改良残留物
实验和验证
细节
分辨率:
3.7Å
EMDB相关卷:
EMD-9895
表达式系统:
智人
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功能与生物学
配体和环境
实验和验证
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引文
36条评论引文
小鼠和人类动脉粥样硬化中的载脂蛋白B特异性CD4+T细胞。
Marchini等人(2021年)
还有35个
31次未被引用
结构免疫学50年。
Wilson等人(2021年)
还有30个