我们的使命

我们的 视野 所有生物医学知识和数据都使用原则本体在互联网上传播,知识和数据在语义上互操作,有助于促进生物医学科学和临床护理。

我们的 使命 是为生物医学科学和临床护理中原则本体的应用创建软件和支持服务,从应用程序开发人员的工具到最终用户的软件。

我们的团队

我们的 团队 在斯坦福大学生物医学信息研究中心(BMIR)已经支持BioPortal软件(包括其可部署选项OntoPortal虚拟设备)超过15年。在Mark Musen博士的领导下,开发和系统操作团队为BioPortal执行所有修改、系统操作、用户支持和外联工作。

我们的 合作者 整个生物医学和语义社区通过他们的软件贡献、他们对公共和私人虚拟设备的许多部署以及他们对我们工作的支持和建议参与进来。

如何引用BioPortal

生物门户

Whetzel PL、Noy NF、Shah NH、Alexander PR、Nyulas C、Tudorache T、Musen MA。生物门户:通过国家生物医学本体中心的新Web服务增强功能,以在软件应用程序中访问和使用本体。核酸研究,2011年7月;39(Web服务器问题):W541-5。Epub 2011年6月14日。

本体推荐程序

Martínez-Romero,M.、Jonquet,C.、O'Connor,M.J.、Graybeal,J.、Pazos,A.、Musen,M.A.(2017)。NCBO本体推荐器2.0:一种增强的生物医学本体推荐方法。生物医学语义学杂志,8(21),1-22(https://jbiomedsem.biomedcentral.com/articles/10.1186/s13326-017-0128-y).

SPARQL端点

Salvadores M、Horridge M、Alexander PR、Fergerson RW、Musen MA和Noy NF。使用SPARQL查询BioPortal本体论和元数据。国际语义网络会议。美国波士顿,LNCS 7650,第180195页,2012年。

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约翰·格雷贝尔
jgraybeal@stanford.edu

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