基因组自同构
计算DNA阿贝尔群表示之间的自同构
生物导体版本：释放（3.19）
这是一个R包，用于计算作为基因组阿贝尔群元素表示的成对排列DNA序列之间的自同构。在一般情况下，从基因组区域到给定种群（来自任何物种或近缘物种）的整个基因组都可以用代数表示为循环群或更具体的阿贝尔p-群的直接和。基本上，我们提出将长度为N bp的多重序列比对表示为由素数幂次的同循环阿贝尔群的直和所创建的有限阿贝尔群元素。
作者：罗伯西·桑切斯[aut，cre]
维护人员：Robersy Sanchez<gmail.com上的基因组数学>
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：
如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：install（“基因自同构”）
对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：
browseVignets（“基因组自变形”）
细节
| 生物视图 |
比较基因组学,功能基因组学,数学生物学,多序列对齐,软件,全基因组 |
| 版本 |
1.6.0 |
| 在生物导体中 |
生物柴油3.16（R-4.2）（1.5年） |
| 许可证 |
艺术-2.0 |
| 取决于 |
R（>=4.4.0） |
| 进口 |
生物串,生物遗传学,生物并行,基因组信息数据库,基因组范围,I范围、矩阵统计、，十六矢量，dplyr，data.table，parallel，doParallel，foreach，方法，S4载体，统计，数字，实用程序 |
| 系统要求 |
|
| 统一资源定位地址 |
https://github.com/genomaths/GenomAutomorphy |
| 错误报告 |
https://github.com/genoaths/GenomAutomorphism/issues |
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拼写、rmarkdown、，仿生风格，测试（>=3.0.0），knitr |
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