Tox套件概述
毒性终点的预测值和计算器
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从结构预测: 急性毒性* 水生生物毒性* 内分泌系统紊乱 致突变性* 对器官的不良影响 hERG抑制* 刺激 理化性质 P(P) ,*log D类 ,*pK 一 *水溶性*等。
评估预测值的可靠性 搜索选定模型的内部实验数据库 用实验数据训练预测模型,以更好地反映新的化学空间 包括定制模型和内部预测算法
好处
毒性预测中所需的一切
易于使用
只需绘制/导入您的结构即可进行预测,医药、合成和研究化学家即可轻松使用 你不需要成为软件工程师或程序员来训练模型
快速、准确、可靠的结果
快速计算单个化合物或数万个化合物的属性 预测基于精心管理的实验数据数据库 通过可靠性指数、类似结构的显示以及原始实验数据的文献参考,轻松评估结果的可靠性
方便的可视化
用结构上的颜色映射可视化子结构/原子对属性值的贡献(选择模块) 使用电子表格视图中用户定义的结果颜色编码,快速识别库中的有利和不利化合物
更深入的见解
识别趋势并对化合物进行优先排序-创建散点图,浏览、筛选、排序和排列化合物库 在一个地方利用分子的完整特性做出自信的决定
可使用内部数据进行自定义
从商业产品中获得内部模型的准确性。 使用自己的实验数据扩展可培训模块的适用范围
可扩展到第三方模型
通过包括第三方和内部模型为预测数据创建单一环境
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1 绘制/导入结构 -
2 选择感兴趣的属性 -
三 审查结果并作出决定 -
4 方便地将结果复制/粘贴或报告为PDF
客户评论
产品特点
毒性终点计算器功能
从结构中计算有机分子的毒性终点(在应用程序中绘制,或从第三方绘图包复制/粘贴); SMILES字符串; InChI代码; 导入的MOL、SK2、SKC或CDX文件; 或在内置词典中按名称搜索 结构高亮显示以指示子结构/原子贡献(出现在某些模块中) 计算化合物组或库的毒性终点,并使用内置工具对结果进行排序、筛选、绘图和排序 设置用户定义的标签颜色 以数字方式过滤结果 按升序/降序值对结果进行排序
检索活动历史记录中以前计算的值的结果 将结果报告为PDF或复制/粘贴到您选择的应用程序 下载致突变性(艾姆斯测试)模块的QMRF和QMRF文档 用选定模块中的实验数据训练算法——急性毒性、水生毒性、致突变性、hERG抑制、对数 P(P) ,日志 D类 ,和pK 一 通过使用XML协议或DLL(仅在瘦客户端部署中可用)连接到现有web服务,添加自定义模型/算法和内部预测算法
深入了解结构-性能关系 了解并修改先导化合物的药代动力学特征 Lipinksi五法则、铅相似性和毒性终点的良好/不良指标
识别负责危险活动的结构片段-hERG抑制和致突变性 使用交互式优化工具修改结构集 基于最佳属性配置文件生成具有取代基修改的类似物库 根据所需的属性配置文件对数百个结构类比进行排序、筛选和优先级排序 创建和使用自定义片段库 使用内置的逆向合成工具瞄准可合成的碎片
劳埃德 50
计算LD 50 小鼠口服、腹腔内、静脉内和皮下给药(mg/kg); 口服和腹腔给药的大鼠 预测精度估算 用实验LD预测和显示内部库中5个最相似结构的可靠性 50 值
用实验数据训练模型
急性毒性类别
预测LD的概率 50 口服后会表现出不同程度的急性毒性(基于啮齿动物数据) 根据OECD(经济合作与发展组织)的定义,将化合物归类为“口服急性毒性危害” 将鼠标悬停在标签上查看详细信息
预测精度估算 用实验值显示内部库中5个最相似的结构
危害
识别可能导致高急性毒性的碎片 结构上的彩色地图 标签结果提供了每个片段的详细信息
了解不同给药途径(静脉注射、口服和腹腔注射)如何影响毒性 分布密度图说明: 具有不同LD的化合物的频率 50 训练集中的范围 包含突出显示片段的化合物 T检验结果,证明突出显示片段的存在是否导致毒性显著增加
与完整训练集相比,含有危险碎片的化合物的方框图和胡须图 显示内部库中5个最相似的结构,以及带有实验值的选定危险碎片
预测LC 50 肥头鱼的数值(mg/L)( 黑头呆鱼 )和水蚤( 大型溞 ) 预测IGC 50 值(mg/L) 纤毛虫原生动物 ( 梨形四膜虫 ) 预测精度估算 用实验值预测和显示内部库中5个最相似结构的可靠性
用实验数据训练模型
预测雌激素受体结合亲和力超过两个不同阈值的概率 基于LogRBA,通过与雌二醇相比对雌激素受体的相对结合亲和力对化合物进行分类
预测精度估算 使用实验LogRBA值和文献参考预测和显示内部库中5个最相似结构的可靠性
预测艾姆斯试验阳性的概率 结构中有助于致突变潜力的原子/官能团的颜色映射
预测精度估算 用整体实验Ames测试结果预测和显示内部库中5个最相似结构的可靠性
浏览致突变性数据库以了解: 关于每种化合物的研究信息 测试菌株 代谢活化的存在与否以及其他实验条件
用实验数据训练模型
估计血液、心血管系统、胃肠系统、肾脏、肝脏和肺部的不良反应概率(治疗剂量) 导致不良影响的结构碎片的颜色图 预测精度估算 在内部库中显示5个最相似的结构,包括路线、物种和临床观察到的毒性作用列表。
预测临床相关浓度(K)下人类乙醚相关基因(hERG)通道抑制的可能性 我 <10μM))使用两种不同的模型——一种基于结构描述符,另一种基于物理化学性质 模拟不同的实验分析(例如,传统或自动补丁灯、配体替换等)如何影响hERG抑制电位的测量值 探索物理化学和分子特性对hERG抑制电位的影响
探索物理化学性质(酸/碱pK 一 ,日志 P(P) )和分子量影响hERG抑制 彩色“热图”显示hERG抑制的相互依赖性,pK 一 、和日志 P(P)
预测精度估算 用实验结果(抑制剂、非抑制剂)和文献参考预测和显示内部库中5个最相似结构的可靠性
用实验数据训练模型
眼睛刺激
计算100mg和500mg标准Draize(兔子)眼睛刺激的概率 导致眼睛刺激的适用规则声明和功能组描述 突出贡献的结构碎片
预测精度估算 在内部库中显示多达5个最相似的结构,具有实验值和文献参考
皮肤刺激
计算100mg和500mg标准Draize(兔子)皮肤刺激的概率 有助于皮肤刺激的适用规则声明和功能组描述 突出贡献的结构碎片
预测精度估算 在内部库中显示多达5个最相似的结构,并提供实验值和文献参考