ADME套件概述
ADME属性的计算器和预测器
从结构预测: 血脑屏障穿透 细胞色素P450*抑制和底物特异性 分发* 人体临床试验的最大推荐日剂量 口服生物利用度-其对logP和生物利用度的依赖性-剂量依赖性 被动吸收 P-糖蛋白特异性* 理化性质 P(P) ,*log D类 ,*pK 一 *水溶性*等。 代谢部位
评估预测值的可靠性 搜索选定模型的内部实验数据库 用实验数据训练预测模型,以更好地反映新的化学空间 包括定制模型和内部预测算法
好处
ADME属性计算器中所需的一切
易于使用
简单地画出你的结构以进行预测——这对于药物、合成和研究化学家来说足够容易使用 训练模型不需要成为软件工程师、程序员或计算化学家
快速、准确、可靠的结果
快速计算单个化合物或数万个化合物的属性 预测基于精心管理的实验数据数据库 通过可靠性指数、数据库中类似结构的显示以及原始实验数据的文献参考,轻松衡量结果质量
方便的可视化
用结构上的颜色映射可视化子结构/原子对属性值的贡献(选择模块) 使用电子表格中用户定义的结果颜色编码,快速识别库中的有利和不利化合物
更深入的见解
通过创建散点图、浏览、筛选、排序和排序库的工具,轻松识别趋势并对化合物进行优先级排序 在一个地方用每个分子的完整属性剖面自信地做出决定
可使用内部数据进行自定义
从商业产品中获得内部模型的准确性。 使用您自己的实验数据来扩展可培训模块的适用范围。
可扩展到第三方模型
通过包括第三方和内部模型为预测数据创建单一环境
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1 绘制/导入结构 -
2 选择感兴趣的属性 -
三 审查结果并作出决定 -
4 方便地以PDF格式报告或复制/粘贴
客户评论
产品特点
ADME属性计算器功能
根据结构计算有机分子的ADME特性(在应用程序中绘制,或从第三方绘图包中复制/粘贴); SMILES字符串; InChI代码; 导入的MOL、SK2、SKC或CDX文件; 或在内置词典中按名称搜索 互变异构体的自动检测(适用于适用的预测模块) 选择规范或主要形式
结构高亮显示以指示子结构/原子贡献(选择模块) 计算化合物组或库的属性,并使用内置工具对结果进行排序、筛选、绘图和排序 设置用户定义的标签颜色 以数字方式过滤结果 按升序/降序值对结果进行排序
检索活动历史记录中以前计算的值的结果 将结果报告为PDF或复制/粘贴到您选择的应用程序 使用选定模块中的实验数据训练算法-CYP450抑制、分布、日志 P(P) ,日志 D类 ,pK 一 和P-gp特异性 通过使用XML协议或以DLL的形式连接到现有web服务(仅在瘦客户端部署中可用),添加自定义模型/算法和内部预测算法
深入了解结构-性能关系 了解并修改先导化合物的药代动力学特征 利宾斯基5法则、铅相似性、细胞通透性、血浆蛋白结合、中枢神经系统渗透、代谢稳定性和CYP抑制的良好/不良指标
使用交互式优化工具修改结构集 基于最佳属性配置文件生成具有取代基修改的类似物库 根据所需的属性配置文件对数百个结构类比进行排序、筛选和优先级排序 创建和使用自定义片段库 使用内置的逆向合成工具瞄准可合成的碎片
定量预测血脑屏障(BBB)通透性。 大脑穿透率(log PS(聚苯乙烯) ) 大脑穿透程度(对数 BB公司 ) 脑/血浆平衡率(log( PS(聚苯乙烯) * (f) u、 大脑 ))
改变基本物理化学性质的值 P(P) ,pK 一 血浆中未结合组分对BBB渗透性的影响 可视化结果 “红绿灯”渗透性指标 用已知的中枢神经系统活性药物和外周活性药物研究的化合物血脑屏障穿透图
通过BBB进行促进扩散或主动流出的化合物警报 日志子模块 PS(聚苯乙烯) 和日志 BB公司 提供详细的预测结果 内部图书馆提供了多达3个最相似的结构,具有实验值和文献参考
计算化合物显示“一般”(IC)的概率 50 <50μM)或“有效”(IC 50 <10μM)抑制5种主要的人类细胞色素P450亚型:3A4、2D6、2C9、2C19、1A2 结果显示为带置信区间的条形图
每个结果的预测精度估计 具有实验值和文献参考的内部图书馆中5种最相似结构的可靠性指数和显示
用实验数据训练算法
计算化合物被细胞色素P450(亚型3A4、2D6、2C9、2C19、1A2)代谢的概率 结果显示为带置信区间的条形图
每个结果的预测精度估计 具有实验值和文献参考的内部图书馆中5种最相似结构的可靠性指数和显示
用实验数据训练算法
血浆蛋白结合
预测血浆蛋白结合(PPB) 与人血浆蛋白结合的百分比(%PPB) 血清白蛋白亲和力常数(log K(K) 一 HSA公司 )
参与结合的血浆蛋白列表 预测精度估算 具有实验值和文献参考的内部图书馆中5种最相似结构的可靠性指数和显示
使用实验数据进行训练
配送量
计算组织结合程度和分布体积(V d日 )基于生理学ie-Tozer模型 更改关键基础属性的值-log P(P) 和血浆中的未结合组分,以研究其对组织分布的影响 预测精度估算 展示内部图书馆中5个最相似的结构,以及实验值和文献参考
计算人类口服的最大建议每日剂量(mg/kg/天) 预测精度估算 具有实验值和文献参考的内部图书馆中5种最相似药物的可靠性指数和显示
对器官不利影响的指示 小鼠毒性指示(口服和静脉给药) 不可靠预测警报
主动运输
预测化合物是否可能是寡肽转运蛋白(PepT1)或胆汁酸转运蛋白(ASBT)的底物 预测载体通过其他系统介导的转运:单羧酸转运蛋白MCT1、氨基酸载体等。 类似结构的参考数据
生物可用性
预测口服后到达体循环的药物百分比(% F类 ) 探索剂量依赖性 查看影响口服生物利用度的终点的贡献:溶解度、稳定性(pH<2)、被动吸收、一次通过代谢、P-gp流出、主动转运 结果以彩色编码显示,表明生物利用度良好或较差
预测精度估算 在内部图书馆中显示多达5个具有实验值和文献参考的类似结构
吸收
基于对数预测空肠上皮被动通透性 P(P) 和pK 一 输入实验测量值以改进预测 更改日志 P(P) 和pK 一 亲脂性和电离对肠道渗透速率限制作用的模型值
计算口腔吸收程度(%HIA) 估计跨细胞和旁细胞路径对总HIA的相对贡献 提供对Absorption DB的访问,这是一个完全可浏览和搜索的数据库,其中包含用于开发HIA模型的实验数据以及相应的文献参考 内部集合中最多3个类似结构的相关特性的实验值
Caco-2型
根据对数计算在指定pH值和搅拌条件下Caco-2细胞单层的被动渗透率 P(P) 和pK 一 值或日志 D类 在特定pH下 调整pH值和搅拌速度 更改日志 D、, 或日志 P(P) 和pK 一 模拟亲油性和电离对Caco-2渗透速率限制作用的值
关于跨细胞和副细胞途径对Caco-2通透性的相对贡献的信息 预测精度估算 在内部图书馆中展示多达3个类似结构,并提供实验信息和文献参考
P-gp抑制剂
估计一种化合物抑制P-糖蛋白并且是一种有效抑制剂的可能性 根据结构特征和物理化学性质将化合物分类为P-糖蛋白抑制剂或非抑制剂 预测精度估算 具有实验值和文献参考的内部图书馆中5个最相似结构的预测和显示的可靠性
用实验数据训练
P-gp基板
估计化合物是P-糖蛋白底物和高亲和力底物的概率 根据电离、分子大小和化合物类别(肽、生物碱、蒽环类等)将化合物分类为P-糖蛋白的底物或非底物 预测精度估算 具有实验值和文献参考的内部库中5种最相似结构的预测和显示的可靠性
用实验数据训练
可视化以下参数对剂量的依赖性,log P、, 和pK 一 (结果以图形图形式提供。使用预测值或输入实验得出的日志值 P(P) 和pK 一 ): %F–日志 P(P) (口服生物利用度对log的依赖性 P(P) 以规定剂量) Cp(最大值)–对数 P(P) (最大可达到药物浓度对log的依赖性 P(P) 以规定剂量) %F–剂量(生物利用度-剂量关系) Cp(Max)–剂量(不同剂量下可达到的最大药物血浆水平) Cp–时间(模拟口服和静脉给药的血浆浓度-时间曲线)
估算吸收量( k个 一 ),总车身间隙( k个 e(电子) ),在胃肠道中的溶解度( 溶胶 GI公司 ),分销量( V(V) d日 )以及基于输入的物理化学特性值的肠道和肝脏的体前代谢(一次通过清除) 更改这些值以重新计算 选择忽略一次通过许可
计算口服和静脉给药后最大可达到血浆水平(Cp(Max))和相应时间(Tmax)、浓度-时间曲线下面积(AUC)以及口服生物利用度(%F)
预测人类肝微粒体(HLM)和五种主要细胞色素P450酶(1A2、2C19、2C9、2D6、3A4)的代谢软点,以帮助: 识别新化学实体上的代谢位点 指导合成具有改进代谢特性的化合物 识别并阐明可能的代谢物结构
结构上的颜色映射表示每个原子的新陈代谢概率 每个原子作为可能的代谢位点的概率得分(0-1) 查看每个原子的预期代谢反应类型:脂肪族或芳香族羟基化、N-脱烷基、O-脱烷基或S-氧化 预测精度估算 内部库中5个最相似结构的预测和显示的可靠性。 代谢部位和实验结果的相似性指示(代谢或未代谢)