剂量 swMATH ID: 16933 软件作者: 于刚、王力、闫刚、何强 描述: DOSE:用于疾病本体语义和丰富分析的R/Bioconductor包。摘要:疾病本体论(DO)在疾病背景下注释人类基因。DO是将高通量数据的分子发现转化为临床相关性的重要注释。DOSE是一个R包,提供DO术语和基因之间的语义相似性计算,允许生物学家从疾病角度探索疾病和基因功能的相似性。还实现了包括超几何模型和基因集富集分析在内的富集分析,以支持发现高通量生物数据的疾病关联。这使得生物学家能够在生物实验中验证疾病相关性,并确定意外的疾病关联。还支持基因簇之间的比较。可用性和实现:DOSE是根据Artistic-2.0许可证发布的。源代码和文档可通过Bioconductor免费获得(http://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/html/DOSE.html). 主页: http://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/html/DOSE.html 依赖项: 对 相关软件: GOSemSim公司;阿波罗;DBAli工具;MATRAS公司;NUCPLOT公司;LIGPLOT公司;EMBOS公司;焦耳(Jmol);PhenomeNET公司;智能GO;Ontobee公司;FUNC公司;Aber-OWL公司;工厂TFDB;鸡蛋NOG;ELM公司;数据库CAN;抗SMASH;解剖HMMER;HPMV(高压中压) 引用于: 2文件 全部的 前5名6位作者引用 1 卡鲁戈语、奥利维埃罗语 1 戴、蔡 1 弗兰克·艾森哈伯 1 雷秀娟 1 潘毅 1 吴方祥 2篇连载文章中引用 1 信息科学 1 分子生物学方法 在4个字段中引用 2 生物学和其他自然科学(92-XX) 1 统计学(62-XX) 1 计算机科学(68至XX) 1 运筹学、数学规划(90-XX) 按年份列出的引文