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.1998年2月；72(2):1005-12.
doi:10.128/JVI.72.2.1005-1012.1998。

卡波西肉瘤相关疱疹病毒（人类疱疹病毒8）基因组在体腔型淋巴瘤细胞系（BC-1）中的转录定位

R萨里德 1, O弗洛里, R A Bohenzky先生, Y Chang公司, P S摩尔
附属公司

卡波西肉瘤相关疱疹病毒（人类疱疹病毒8）基因组在体腔型淋巴瘤细胞系（BC-1）中的转录定位

R萨里德等。 J维罗尔. 1998年2月.

摘要

使用Northern分析方法，通过DNA探针延伸至病毒基因组，检测BC-1细胞系（KSHV和EB病毒共感染）中卡波西肉瘤相关疱疹病毒（KSHV）基因的转录，但最右边的一个3kb不可克隆区域除外。已鉴定出三大类病毒基因转录。I类基因，如编码v-cyclin、潜伏相关核抗原和v-FLIP的基因，在标准生长条件下组成性转录，不受醋酸十四烷基佛波酯（TPA）诱导的影响，可能代表潜在的病毒转录物。II类基因主要聚集在基因组的非重叠区域，包括小聚腺苷酸RNA（T0.7和T1.1）以及大多数病毒编码的细胞因子和信号转导基因。II类基因在未经TPA处理的情况下转录，但通过TPA处理被诱导到更高的转录水平。III类基因主要是结构和复制基因，仅在TPA治疗后转录，可能负责裂解病毒的产生。这些结果表明，在非诱导（潜伏）病毒培养过程中，BC-1细胞对许多KSHV基因，特别是参与细胞信号转导和调节的非服务基因具有可检测的转录。

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数字

图1
图1
KSHV Northern杂交探针的位置。千位标记上方的箭头框表示已识别的ORF及其指定编号和假定功能。千基标记下方的方框表示用于Northern分析的DNA探针（1到42）。黑盒子代表检测I类转录的探针，带阴影的盒子代表检测II类转录的探测器，空盒子代表检测III类转录的探头。星号表示与多个转录类别杂交的探针。缩写：TR，终端重复；补体结合蛋白；单链结合蛋白；糖蛋白B；Pol，聚合酶；IL-6、IL-6；DHFR，二氢叶酸还原酶；胸腺苷合成酶；巨噬细胞炎性蛋白；被膜蛋白；胸腺嘧啶激酶；MCP，主要衣壳蛋白；尿嘧啶-DNA葡萄糖苷酶；干扰素调节因子；右后S公司，核糖核苷酸还原酶，小；右后L（左），核糖核苷酸还原酶，大；FLIP，FLICE-抑制蛋白；Cyc，细胞周期蛋白；潜伏相关核抗原；Adh，粘附分子；GCR，G蛋白偶联受体；FGARAT公司，N个-甲酰甘氨酸核苷酰胺转移酶。
图2
图2
BC-1、TPA诱导的BC-1和P3HR1细胞系mRNA的北方杂交显示了三类病毒基因转录。在1%琼脂糖-甲醛凝胶上分离信使核糖核酸（每泳道500ng），并转移到尼龙过滤器中。过滤器与四个DNA探针杂交：（A）代表I类转录的v-cyclin D；（B） v-IRF，其代表II类转录；（C） MCP，代表III类转录；和（D）β-肌动蛋白控制RNA完整性和等效负载。
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