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.2017年6月;1865(6):664-673.
doi:10.1016/j.bbapap.2017.03.010。 Epub 2017年3月21日。

细胞质YB-1和NSUN2是唯一识别外显体丰富的mRNA中存在的特定模体的蛋白质

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细胞质YB-1和NSUN2是唯一识别外显体丰富的mRNA中存在的特定模体的蛋白质

Olga A Kossinova公司等。 Biochim生物物理学报蛋白质组. 2017年6月.

摘要

外显体是由各种细胞分泌的膜泡,参与细胞间通讯,携带大量RNA和蛋白质。目前对介导RNA分选进入外泌体的过程知之甚少。利用生物信息学方法,发现三个结构基序ACCAGCCU、CAGUGAGC和UAAUCCCA在外泌体mRNA和长非编码RNA中富集。在这里,我们利用短RNA发夹(每个发夹都包含一个基序)对人类胚胎肾293(HEK293)细胞的细胞溶质提取物进行下拉分析,证明多功能RNA结合蛋白YB-1与所有三个基序特异性相互作用,而甲基转移酶NSUN2仅识别基序CAGUGAGC。除上述外,RNA发夹既不能拔出YB-1也不能拔出NSUN2。这两种蛋白质都存在于HEK293细胞分泌的外泌体中。YB-1被检测为一种电泳迁移率略高于与上述RNA发夹相关的YB-1的形式,假设蛋白质从细胞质转移到外泌体过程中翻译后修饰发生变化。总外体RNA(eRNA)的下一代测序揭示了一大组具有代表性的RNA物种,包括含有上述基序的mRNA。这种mRNA在外显体中的富集程度强烈依赖于mRNA序列中eRNA特异性基序的位置。总之,我们的发现指出,YB-1和NSUN2可能是将特定mRNA转移到外显子的过程中的介体,这使我们可以推测这些蛋白质通过识别上述模体参与mRNA分选。

关键词:外体RNA特异基序;NSUN2;细胞溶质提取物的下拉试验;RNA-蛋白质相互作用;YB-1;mRNA物种富含外显体。

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