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.2013年12月;6(6):588-97.
doi:10.1161/CIRCGENETICS.113.000063。 Epub 2013年11月8日。

心脏对病理和生理应激反应的基因网络和蛋白质组分析

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心脏对病理和生理应激反应的基因网络和蛋白质组学分析

伊格纳特·德罗兹多夫等。 循环心血管基因. 2013年12月.

摘要

背景:生理性和病理性左心室肥大(LVH)之间相似性和差异性的分子机制备受关注。以前的大多数工作都涉及对单个信号通路的靶向分析或转录组特征的筛选。我们开发了一种网络生物学方法,使用基因组和蛋白质组数据来研究区分病理性和生理性LVH的分子模式。

方法和结果:使用图论方法对127个体内小鼠LVH全基因组表达阵列进行了基于网络的分析。这揭示了表型特异的病理和生理基因共表达网络。尽管这两个网络中有1650个以上的共同基因,但网络结构有显著差异。这在很大程度上是因为两个网络中差异共存的基因的重新布线;这种新颖的差动接线概念在实验上得到了进一步验证。重新布线网络的功能分析揭示了几个不同的细胞路径和基因集。通过对病理性LVH中线粒体、肌丝和细胞外亚蛋白组的靶向蛋白质组学分析进行了更深入的探索。一个值得注意的发现是,mRNA-蛋白相关性在细胞通路水平上大于单个位点。

结论:LVH的首次基因网络和蛋白质组学联合分析揭示了区分病理表型和生理表型的综合病理机制的新见解。特别是,我们确定差异基因接线是这些表型的主要区别特征。这种方法为研究LVH中潜在的新途径提供了一个平台,并提供了一种可自由访问的协议(http://sites.google.com/site/cardornetworks)用于其他心血管疾病的类似分析。

关键词:计算生物学;遗传学;基因组学;蛋白质组学。

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引用人

  • 通过整合转录组和蛋白质组数据,统一特征关联网络。
    McClure RS、Wendler JP、Adkins JN、Swanstrom J、Baric R、Kaiser BLD、Oxford KL、Waters KM、McDermott JE。 McClure RS等人。 公共科学图书馆计算生物学。2019年9月17日;15(9):e1007241。doi:10.1371/journal.pcbi.1007241。eCollection 2019年9月。 公共科学图书馆计算生物学。2019 PMID:31527878 免费PMC文章。
  • 抑制纤维化前microRNA-21影响血小板及其释放。
    Barwari T、Eminaga S、Mayr U、Lu R、Armstrong PC、Chan MV、Sahraei M、Fernández-Fuertes M、Moreau T、Barallobre-Barreiro J、Lynch M、Yin X、Schulte C、Baig F、Pechlaner R、Langley SR、Zampetaki A、Santer P、Weger M、Plasenzotti R、Schosser M、Grillia J、Kiechl S、Willeit J、Shah AM、Ghevart C、Warner TD、Fernandez-Hernando C、Suárez Y、,迈尔·M·。 Barwari T等人。 JCI洞察力。2018年11月2日;3(21):e123335。doi:10.1172/jci.insight.123335。 JCI洞察力。2018 PMID:30385722 免费PMC文章。
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    Harrington J、Fillmore N、Gao S、Yang Y、Zhang X、Liu P、Stoehr A、Chen Y、Springer D、Zhu J、Wang X、Murphy E。 Harrington J等人。 J Am Heart Assoc.2017年8月19日;6(8):e005838。doi:10.1161/JAHA.117.005838。 美国心脏协会杂志,2017。 PMID:28862954 免费PMC文章。
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