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.2013年2月;6(1):106-17.
doi:10.1161/CIRCGENETICS.112.964452。 Epub 2012年12月19日。

人血管基质金属蛋白酶底物的蛋白质组学鉴定

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人血管基质金属蛋白酶底物的蛋白质组学鉴定

克里斯汀·斯特格曼等。 循环心血管基因. 2013年2月.

摘要

背景:基质金属蛋白酶(MMPs)在心血管疾病中起着关键作用,尤其是在动脉瘤形成和斑块破裂中。令人惊讶的是,人们对血管系统中的基质金属蛋白酶底物知之甚少。

方法和结果:我们使用蛋白质组学方法鉴定了3种基质金属蛋白酶的血管底物,即3大类基质金属蛋白酶中的每一类:人类动脉与基质金属蛋白酶-3(基质溶素的一种)、基质金属蛋白酶-9(明胶酶)和基质金属蛋白酶-14(胶原酶和膜结合基质金属蛋白酶)共同孵育。基于消化时动脉组织释放的增加、凝胶分离后蛋白水解降解的光谱证据以及非加密裂解位点的鉴定,通过质谱法鉴定候选底物。使用这种方法,确定了新的候选蛋白,包括与基底膜相关的细胞外基质蛋白、弹性纤维(emilin-1)和其他细胞外蛋白(骨膜蛋白、tenascin-X)。检测到74个非密码性切割位点,其中许多在不同的MMP之间共享。蛋白质组学研究结果通过免疫印迹和用外源性MMPs消化重组/纯化蛋白质进行验证。作为基本原理的证明,通过在人主动脉组织中搜索具有不同水平内源性MMP-9的相应降解产物,结果与体内病理学相关。

结论:应用蛋白质组学确定MMP靶点是心血管研究的新前沿。我们目前基于少量底物对基质金属蛋白酶的分类过于简单化了生物学的一个复杂领域。这项研究对血管系统中潜在的基质金属蛋白酶底物进行了更全面的评估,为未来的研究提供了宝贵的资源。

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