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.2012年1月至4月;3(1):77-87.
doi:10.4161/nucl.18825。

内核膜蛋白Man1和Ima1连接到葡萄球菌核外周的两种不同类型的染色质

附属公司

内核膜蛋白Man1和Ima1连接到葡萄球菌核外周的两种不同类型的染色质

巴贝特·斯特利奇等。 . 2012年1月至4月.

摘要

核外围的后生动物染色质通常以低表达基因和抑制性染色质标记为特征,并呈现出与核内部不同的亚区。为了测试葡萄球菌核外周是否表现出类似的行为,我们使用DNA腺嘌呤甲基转移酶鉴定(DamID)来定位两种内核膜蛋白Ima1和Man1的靶位点。我们发现,外周染色质显示出低水平的RNA-聚合酶II和核小体占有率,这两者都是染色质受抑制区域的特征。一贯地,低表达基因优先与外围相关,而高表达基因则从中耗竭。当观察外围基因间区域(IGR)时,我们发现,与收敛型IGR相比,发散型IGR更丰富,这表明转录优先指向外围而非外围。有趣的是,我们发现Ima1和Man1在基因组中有共同但又分离的靶区。对RNAi成分Dcr1和Rdp1的Ima1相互作用位点进行了富集。这与之前的发现一致,即Dcr1位于核外围。相比之下,Man1靶基因座被异染色质蛋白Swi6结合,尤其是在粒下区域。亚减数分裂染色质形成了一种独特的染色质类型,缺乏抑制性和活性染色质特征,并且含有低水平的组蛋白变体H2A。因此,我们发现分裂酵母的核外围与后生动物细胞的核外围表现出相似的特性,尽管没有核片。我们的结果指出了核膜蛋白在组织染色质结构域和环中的作用。

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