Origins of the E. coli strain causing an outbreak of hemolytic-uremic syndrome in Germany

doi:10.1056/NEJMoa1106920

.2011年8月25日；365(8):709-17.

doi:10.1056/NEJMoa1106920。 Epub 2011年7月27日。

导致德国溶血性尿毒症爆发的大肠杆菌菌株的来源

附属公司

PMID： 21793740
预防性维修识别码：项目经理3168948
内政部： 10.1056/NEJMoa1106920

导致德国溶血性尿毒症爆发的大肠杆菌菌株的来源

大卫·A·拉斯科等。 N英格兰J医学. 2011.

.2011年8月25日；365(8):709-17.

doi:10.1056/NEJMoa1106920。 Epub 2011年7月27日。

附属

¹马里兰大学医学院、基因组科学研究所和微生物学系，美国巴尔的摩。

PMID： 21793740
预防性维修识别码：项目经理3168948
内政部： 10.1056/NEJMoa1106920

摘要

背景：2011年5月，德国爆发了由一种不寻常的产志贺毒素大肠杆菌（O104:H4）血清型引起的腹泻和溶血性腹泻综合征。截至7月22日，已报告了大量由产志贺毒素大肠杆菌引起的腹泻病例，其中3167例未出现溶血性尿毒症综合征（16例死亡），908例出现溶血-尿毒症综合症（34例死亡）。这表明该菌株的毒力明显高于大多数产志贺毒性大肠杆菌菌株。暴发菌株的初步遗传特征表明，与大多数这些菌株不同，它应该被归类为大肠杆菌的肠聚集性病理类型。

方法：我们使用第三代单分子实时DNA测序法测定了德国暴发菌株的完整基因组序列，以及七株非洲腹泻相关肠聚集性大肠杆菌血清型O104:H4菌株和四株其他血清型肠聚集性参考菌株的基因组序列。使用这些肠聚集性大肠杆菌基因组以及40个先前测序的大肠杆菌分离物基因组进行全基因组比较。

结果：肠聚集性大肠杆菌O104:H4菌株密切相关，在大肠杆菌和肠聚集性菌株之间形成了一个独特的分支。然而，德国暴发菌株的基因组可以与其他O104:H4菌株的基因组区分开来，因为它包含编码志贺毒素2的前噬菌体，以及一组独特的附加毒力和抗生素抗性因子。

结论：我们的研究结果表明，水平遗传交换导致了导致德国疫情爆发的高毒性产志贺毒素肠聚集性大肠杆菌O104:H4菌株的出现。更广泛地说，这些发现突显了细菌基因组的可塑性促进新病原体出现的方式。

PubMed免责声明

数字

**图1。八种肠聚集性的基因组比较*大肠杆菌*O104:H4隔离**
在面板A中，八个圆形带代表不同企业聚集的轨迹*大肠杆菌*（EAEC）O104:H4分离株在我们的研究中测序（从内到外：55989、C227-11、C734-09、C35-10、C682-09、C760-09、C754-09和C777-09）。这些不同的带代表参照基因组TY2482绘制的覆盖图，蓝色或绿色表示高度覆盖，黄色表示中度覆盖，橙色或红色表示很少或没有覆盖。C227-11覆盖图表明与TY2482基因组的近完全序列一致。染色体图外部的注释突出了已知毒力因子基因的位置以及先前在AA质粒上表征的基因在*大肠杆菌*O42菌株。质粒的带序和颜色编码与染色体图中描述的相同。pAA图中的细红线显示55989和C227-11之间的内部重复，突出了这些元素在质粒序列周围的洗牌。在B组中，参考基因组为55989。C组显示了暴发菌株C227-11（左半圆）和55989基因组（右半圆）的基因组之间的比较，这两个基因组分别对应于55989基因和暴发菌株TY2482的基因组。最内层轨道（蓝色、粉红色和紫色）内的彩带表示两个基因组C227-11和55989之间的同源映射，表明这些基因组之间存在高度相似性。红线显示重复元件的染色体定位，如插入序列和其他移动元件，这表明基因组之间的异质性比同源性绘图区域明显。

**图2。53的系统发育比较*大肠杆菌*和志贺菌分离物**
如Sahl等人所述，基因组序列与100个bootstrap计算进行了比较。基于物种的系统发育是通过使用2.56 Mbp的保守核心基因组推断出来的。O104:H4分离物显示为橙色，即参考肠聚集性*大肠杆菌*（EAEC）蓝色分离物和肠出血性*大肠杆菌*绿色隔离物。（其他菌株的分类如补充附录中的图4和表4所示。）O104:H4菌株聚集成单个分支（深灰色）；相比之下，参考EAEC分离株差异很大，在整个系统发育过程中都有代表性。

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中的注释

关于：导致德国爆发溶血性尿毒症综合征的大肠杆菌菌株的起源。
谢弗EM。谢弗EM。乌洛尔杂志。2012年2月；187(2):514-5. doi:10.1016/j.juro.2011.10.081。Epub 2011年12月15日。乌洛尔杂志。2012 PMID：22237328 没有可用的摘要。

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1. Scheutz F、Nielsen EM、Frimodt-Moller J等。2011年5月至6月，导致德国溶血尿毒综合征暴发的肠聚集性志贺毒素/Verotoxin产生大肠杆菌O104:H4菌株的特征。欧洲监管。2011;16:pii:19869。-公共医学
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[3] Frank C、Werber D、Cramer JP等。德国产志贺毒素大肠杆菌O104:H4暴发疫情的流行病学概况-初步报告。《新英格兰医学杂志》2011-公共医学

[4] Frank C、Werber D、Cramer JP等。德国产志贺毒素大肠杆菌O104:H4暴发疫情的流行病学概况-初步报告。《新英格兰医学杂志》2011-公共医学

[5] Scheutz F、Nielsen EM、Frimodt-Moller J等。2011年5月至6月，导致德国溶血尿毒综合征暴发的肠聚集性志贺毒素/Verotoxin产生大肠杆菌O104:H4菌株的特征。欧洲监管。2011;16:pii:19869。-公共医学

[6] Scheutz F、Nielsen EM、Frimodt-Moller J等。2011年5月至6月，导致德国溶血尿毒综合征暴发的肠聚集性志贺毒素/Verotoxin产生大肠杆菌O104:H4菌株的特征。欧洲监管。2011;16:pii:19869。-公共医学

[7] Mellmann A、Bielaszewska M、Kock R等。溶血性尿毒症综合征相关肠出血性大肠杆菌的采集分析。突发传染病。2008;14:1287–1290.-项目管理咨询公司-公共医学

[8] Mellmann A、Bielaszewska M、Kock R等。溶血性尿毒症综合征相关肠出血性大肠杆菌的采集分析。突发传染病。2008;14:1287–1290.-项目管理咨询公司-公共医学

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