ON IDENTIFIABILITY OF NONLINEAR ODE MODELS AND APPLICATIONS IN VIRAL DYNAMICS

doi:10.1137/090757009

.2011年1月1日；53(1):3-39.

doi:10.1137/090757009。

非线性常微分方程模型的可辨识性及其在病毒动力学中的应用

苗宏宇¹, 夏晓华, 艾伦·S·佩雷尔森, 胡林武

附属公司

PMID： 21785515
预防性维修识别码： PMC3140286型
DOI（操作界面）： 10.1137/090757009

非线性常微分方程模型的可辨识性及其在病毒动力学中的应用

苗宏宇等。 SIAM Rev Soc工业应用数学. 2011.

.2011年1月1日；53(1):3-39.

doi:10.1137/090757009。

作者

苗宏宇¹, 夏晓华, 艾伦·S·佩雷尔森, 胡林武

隶属关系

¹罗切斯特大学医学和牙科学院生物统计学和计算生物学系，地址：601 Elmwood Avenue，Box 630，Rochester，New York 14642，USA。

PMID： 21785515
预防性维修识别码： PMC3140286型
DOI（操作界面）： 10.1137/090757009

摘要

常微分方程（ODE）是建模动态过程的强大工具，在各种科学领域都有广泛的应用。在过去20年里，ODE也成为了各种生物医学研究领域的一种流行工具，特别是在传染病建模方面。在实际应用中，根据实验数据确定ODE模型中的未知参数是非常重要和必要的。可辨识性分析是确定ODE模型中未知参数的第一步，此类非线性ODE模型分析技术仍在开发中。在本文中，我们回顾了过去一到二十年来发展起来的非线性常微分方程模型的可辨识性分析方法，包括结构可辨识性、实用可辨识性和基于灵敏度的可辨识分析。本文还简要回顾了一些前沿课题和正在进行的研究。最后，给出了一些HIV、流感和肝炎病毒动力学建模的例子，以说明如何在实践中应用这些可识别性分析方法。

PubMed免责声明

类似文章

年龄结构PDE流行病模型的结构可识别性分析。
Renardy M、Kirschner D、Eisenberg M。 Renardy M等人。数学生物学杂志。2022年1月4日；84(1-2):9. doi:10.1007/s00285-021-01711-1。数学生物学杂志。2022 PMID：34982260 免费PMC文章。
mRNA转染后翻译动力学模型的可识别性分析。
Pieschner S、Hasenauer J、Fuchs C。 Pieschner S等人。数学生物学杂志。2022年5月17日；84(7):56. doi:10.1007/s00285-022-01739-x。数学生物学杂志。2022 PMID：35577967 免费PMC文章。
计算ODE模型的所有多参数解以避免生物误解。
Saccomani议员，Thomaseth K。 Saccomani议员等。 Math Biosci Eng.2019年7月11日；16(6):6438-6453. doi:10.3934/mbe.2019322。 2019年数学生物科学工程。 PMID：31698571
回顾：成为或不是一个可识别的模型。这是动物科学建模中的一个相关问题吗？
穆尼奥斯·塔马约（Muñoz-Tamayo R）、普利特（Puillet L）、丹尼尔·巴蒂斯特（Daniel JB）、索万特（Sauvant D）、马丁·O、塔希普尔（Taghipoor M）、布拉维·P。 Muñoz-Tamayo R等人。动物。2018年4月；12(4):701-712. doi:10.1017/S1751731117002774。Epub 2017年11月3日。动物。2018 PMID：29096725 审查。
数值模拟物理化学系统ODE建模的优缺点。
Yasui K。 Yasui K。分子。2022年9月9日；27(18):5860. doi:10.3390/分子27185860。分子。2022 PMID：36144593 免费PMC文章。审查。

查看所有类似文章

引用人

量化恩诺沙星剂量方案在牛体内的疗效和耐药性传播之间的权衡。
Chandra Deb L、Timsina A、Lenhart S、Foster D、Lanzas C。 Chandra Deb L等人。 Res Sq[预打印]。2024年4月9日：rs.3.rs-4166888。doi:10.21203/rs.3.rs-4166888/v1。 Res Sq.2024号。 PMID：38659948 免费PMC文章。预打印。
标准病毒动力学模型中关键参数的估计有多稳健？
Zitzmann C、Ke R、Ribeiro RM、Perelson AS。 Zitzmann C等人。公共科学图书馆计算生物学。2024年4月16日；20（4）：e1011437。doi:10.1371/journal.pcbi.1011437。eCollection 2024年4月。公共科学图书馆计算生物学。2024 PMID：38626190 免费PMC文章。
对住院新型冠状病毒肺炎患者依赖治疗时间的帕克洛韦疗效的回顾性队列研究。
Du Z、Wang L、Bai Y、Liu Y、Lau EHY、Galvani AP、Krug RM、Cowling BJ、Meyers LA。杜Z等。埃利夫。2024年4月16日；13:e89801。doi:10.7554/eLife.89801。埃利夫。2024 PMID：38622989 免费PMC文章。
模拟HIV-1感染者对广泛中和抗体PGT121的耐药性。
Cassidy T、Stephenson KE、Barouch DH、Perelson AS。 Cassidy T等人。公共科学图书馆计算生物学。2024年3月29日；20（3）：e1011518。doi:10.1371/journal.pcbi.1011518。电子收款2024年3月。公共科学图书馆计算生物学。2024 PMID：38551976 免费PMC文章。
具有内生社会风险反应的行为流行病模型中的参数估计。
Osi A，Ghaffarzadegan N。 Osi A等人。公共科学图书馆计算生物学。2024年3月29日；20（3）：e1011992。doi:10.1371/journal.pcbi.1011992。电子收款2024年3月。公共科学图书馆计算生物学。2024 PMID：38551972 免费PMC文章。

查看所有“被引用”文章

工具书类

1. Adams BM、Banks HT、Kwon HD、Tran HT。HIV的动态多药治疗：最佳和STI控制方法。Mathe Biosci Eng.2004；1:223–241.-公共医学
1. Aluru S.Haendbook of Computation Molecular Biology（查普曼与All/Crc Computer and Information Science Series）查普曼&霍尔/Crc；佛罗里达州博卡拉顿：2005年。
1. 安德森DH。分区建模和示踪动力学。作者：Levin S，编辑。生物数学课堂讲稿。第50卷。施普林格；柏林：1983年。
1. Angelova M.博士论文。查尔默斯理工大学和哥德堡大学数学科学系；哥德堡，瑞典：2007年。非线性系统的可观测性和可识别性及其在生物学中的应用。
1. Angelova M，Wennberg B.非线性时滞系统时滞参数的状态消除和可辨识性。自动化。2008;44:1373–1378.

赠款和资金

LinkOut-更多资源

[1] Adams BM、Banks HT、Kwon HD、Tran HT。HIV的动态多药治疗：最佳和STI控制方法。Mathe Biosci Eng.2004；1:223–241.-公共医学

[2] Adams BM、Banks HT、Kwon HD、Tran HT。HIV的动态多药治疗：最佳和STI控制方法。Mathe Biosci Eng.2004；1:223–241.-公共医学

[3] Aluru S.Haendbook of Computation Molecular Biology（查普曼与All/Crc Computer and Information Science Series）查普曼&霍尔/Crc；佛罗里达州博卡拉顿：2005年。

[4] Aluru S.Haendbook of Computation Molecular Biology（查普曼与All/Crc Computer and Information Science Series）查普曼&霍尔/Crc；佛罗里达州博卡拉顿：2005年。

[5] 安德森DH。分区建模和示踪动力学。作者：Levin S，编辑。生物数学课堂讲稿。第50卷。施普林格；柏林：1983年。

[6] 安德森DH。分区建模和示踪动力学。作者：Levin S，编辑。生物数学课堂讲稿。第50卷。施普林格；柏林：1983年。

[7] Angelova M.博士论文。查尔默斯理工大学和哥德堡大学数学科学系；哥德堡，瑞典：2007年。非线性系统的可观测性和可识别性及其在生物学中的应用。

[8] Angelova M.博士论文。查尔默斯理工大学和哥德堡大学数学科学系；哥德堡，瑞典：2007年。非线性系统的可观测性和可识别性及其在生物学中的应用。

[9] Angelova M，Wennberg B.非线性时滞系统时滞参数的状态消除和可辨识性。自动化。2008;44:1373–1378.

[10] Angelova M，Wennberg B.非线性时滞系统时滞参数的状态消除和可辨识性。自动化。2008;44:1373–1378.

将引文保存到文件

电子邮件引文

添加到集合

添加到我的书目

您保存的搜索

为外部引文管理软件创建文件

你的RSS订阅源

非线性常微分方程模型的可辨识性及其在病毒动力学中的应用

隶属关系

非线性常微分方程模型的可辨识性及其在病毒动力学中的应用

作者

隶属关系

摘要

类似文章

引用人

工具书类

赠款和资金

LinkOut-更多资源

全文源

其他文献来源

其他