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2007年8月1日;40(第4部分):658-674。
doi:10.1107/S0021889807021206。 Epub 2007年7月13日。

相位晶体学软件

相位晶体学软件

艾莉·麦考伊等。 应用结晶仪

摘要

Phaser是一个通过分子替换和实验定相方法对大分子晶体结构进行定相的程序。使用最大似然法和多元统计法开发了在Phaser中实现的新型相位算法。对于分子替换,新算法在区分正确解和噪声方面明显优于传统方法,对于单波长反常色散实验相位,新算法考虑了F(+)和F(-)之间的相关性,与使用平均F和异常差值DeltaF的相位相比,相位更好(相对于精细结构给出的相位,平均相位误差更低)。Phaser的设计理念之一是能够实现高度自动化。为此,可以直接从Python调用Phaser(用C++编写),尽管也可以使用传统的CCP4关键字类型输入调用它。相位器是一个平台,用于改进相位方法的未来开发及其向晶体学界发布的版本(包括源代码)。

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数字

图1
图1
自动分子替换流程图相位器
图2
图2
自动化实验阶段化流程图相位器

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引用人

工具书类

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