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.2008年9月26日；321(5897):1801-6.
doi:10.1126/science.1164368。 Epub 2008年9月4日。

全球基因组分析揭示人类胰腺癌的核心信号通路

Sián Jones先生 1, 张晓松, D威廉姆斯·帕森斯, 吉米·程浩林, 丽贝卡·李里, 菲利普·安根恩特, 帕敏德·曼库, 汉娜·卡特, 神山博彦, 安东尼奥·吉梅诺, Seung-Mo Hong先生, 保金付, 林明哲, 埃里克·卡尔霍恩, 神山美和子, 金伯利·沃尔特, 塔蒂亚娜·尼科尔斯卡娅, 尤里·尼科尔斯基, 詹姆斯·哈蒂根, 道格拉斯·史密斯, 曼努埃尔·伊达尔戈, 史蒂文·德利奇, 艾莉森·P·克莱恩, 伊丽莎白·贾菲, 迈克尔·戈金斯, 阿尼尔班·迈特拉, 克里斯汀·亚科布齐奥·多纳休, 詹姆斯·埃斯勒曼, 斯科特·科恩, 拉尔夫·赫鲁班, 雷切尔·卡钦, 尼克拉斯·帕帕佐普洛斯, 乔瓦尼·帕尔米吉亚尼, 贝尔特·福格尔斯泰因, 维克托·维库列斯库, 肯尼思·金兹勒
附属公司

全球基因组分析揭示人类胰腺癌的核心信号通路

Sián Jones先生等。 科学类. .

摘要

目前胰腺癌患者的治疗选择很少，迫切需要对这种致命疾病的发病机制有新的认识。为此，我们对24例胰腺癌进行了全面的基因分析。我们首先确定了这些样本中代表20661个蛋白编码基因的23219个转录本的序列。然后，我们使用含有约10（6）个单核苷酸多态性探针的微阵列来搜索肿瘤DNA中的纯合子缺失和扩增。我们发现胰腺癌平均包含63种基因改变，其中大多数是点突变。这些改变定义了一组由12个细胞信号通路和过程组成的核心，这些通路和过程在67%到100%的肿瘤中都发生了基因改变。利用新一代序列合成技术对这些肿瘤的转录组进行分析，为这些途径和过程的重要性提供了独立证据。我们的数据表明，基因改变的核心途径和调控过程只有在深入分析基因组编码区后才变得明显。通过突变对这些核心途径和过程的失调可以解释胰腺肿瘤发生的主要特征。

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数字

图1
图1
突变结构模型的例子。(一个). 蛋白激酶Cγ（PKCG）C2结构域的x射线晶体结构[蛋白质数据库识别号（PDBID）2UZP]。R252（41）显示为黄色的太空填充物；钙2+离子显示为红色球体。配体1,2-乙二醇和吡哆醇-5-磷酸分别以白色和紫色的球状和棒状表示。R252→H252（R252H）突变可降低PRKCG C2结构域的膜结合，从而影响功能。(B类)人类KLF5（PDBID 2EBT）zf-C2H2结构域三个串联重复序列的核磁共振溶液结构。H389显示为黄色太空填充物；锌2+离子显示为氰球。含有C2H2基团的残基与附近的Zn配位2+离子以球状和棒状表示，H393和H397以绿色和白色显示，而C380和C375以橙色和红色显示。389位（H389N）的突变可能会破坏锌指或附近锌配位位点的结构。(C类)SMAD3（两个亚基显示为蓝色条带）和SMAD4（一个亚基表示为粉红色条带）异源三聚体（PDBID 1U7F）的x射线晶体结构。对应于链A中两个突变位置（F260S和S422F，分别显示为红色和黄色空间填充）的残基位于界面处，可能干扰Smad3-Smad3或Smad3-Smad4相互作用。在链B中，F260显示为青色空间填充，S422显示为绿色空间填充。(D类)人类DPP6胞外区的x射线晶体结构为同型二聚体（PDBID 1XFD）。本研究中发现的两个突变残基T409I（显示为红色空格填充）和D475N（显示为黄色空格填充）在空间上很接近，并且靠近其中一个糖基化位点N471（显示为白色空格填充）。这些突变位于蛋白质的β-螺旋桨结构域（残基142-322和351-581），被认为与蛋白质相互作用有关。A778T突变（显示为蓝色空格填充物）位于*/β水解酶结构域（残基127至142和581至849），接近蛋白质的同二聚体区域，并可能扰乱同二聚物关联。带有糖基化位点的碳水化合物以棒状表示。使用UCSF Chimera 1.2422版Linux（42）创建的图像。
图2
图2
通过测序和拷贝数分析在24种癌症中检测到的基因改变数量。
图3
图3
信号通路和过程。(一个)在大多数胰腺癌中，其组成基因发生遗传改变的12条途径和过程。(B类和C类)两种胰腺癌（Pa14C和Pa10X）及其突变的特定基因。（B）和（C）中圆圈周围的位置对应于（A）中的路径和过程。BMPR2突变可能破坏了Pa10X中的SMAD4和Hedgehog信号通路，这说明了几个通路成分重叠。此外，并非所有胰腺癌中的12个过程和通路都发生了改变，例如在Pa10X中没有观察到影响DNA损伤控制的突变。常开表示未观察到。
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    1. Parkin DM、Bray FI、Devesa SS。《欧洲癌症杂志》。2001;37（补充）：S4。-公共医学
    1. Jemal A等人。加州癌症临床杂志。2008;58:71.-公共医学
    1. Koorstra JB、Hustinx SR、Offerhaus GJ、Maitra A.胰腺科。2008;8:110.-项目管理咨询公司-公共医学
    1. Efthimiou E、Crnogorac-Jurcevic T、Lemoine NR.胰腺学。2001;1:571.-公共医学
    1. Mimeault M，Brand RE，Sasson AA，Batra SK.胰腺。2005;31时301分。-公共医学

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