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.2007年10月;39(10):1278-84.
doi:10.1038/ng2135。 Epub 2007年9月23日。

位点可及性在microRNA靶识别中的作用

附属公司

位点可及性在microRNA靶识别中的作用

迈克尔·科特斯等。 自然基因. 2007年10月.

摘要

微RNA是基因表达的关键调节器,但其与mRNA靶点相互作用的确切机制尚不清楚。在这里,我们系统地研究了靶区可及性在microRNA靶识别中的作用,这是由mRNA内的碱基对相互作用决定的。我们的实验表明,减少靶可及性的突变显著降低了microRNA介导的翻译抑制,其效果与破坏序列互补性的突变相当。我们为microRNA-靶相互作用设计了一个无参数模型,该模型计算了从microRNA-靶双重结构的形成中获得的自由能与使其能够被microRNA访问而解除靶的能量消耗之间的差异。该模型解释了我们实验中的可变性,与现有算法相比,预测已验证的目标更准确,并表明基因组通过优先将目标定位在高可访问区域来适应站点可访问性。因此,我们的研究表明,目标可及性是微RNA功能的关键因素。

PubMed免责声明

中的注释

  • microRNA如何选择目标。
    伊利诺伊州霍法克。 伊利诺伊州霍法克。 自然遗传学。2007年10月;39(10):1191-2. doi:10.1038/ng1007-1191。 自然遗传学。2007 采购管理信息:17898777 没有可用的摘要。

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