跳到主页内容
美国国旗

美国政府的官方网站

Dot政府

政府意味着它是官方的。
联邦政府网站通常以.gov或.mil结尾。之前分享敏感信息，确保你在联邦政府网站。

Https公司

网站是安全的。
这个https（https）：//确保您连接到官方网站，并且您提供的任何信息都是加密的并安全传输。

访问密钥 NCBI主页 MyNCBI主页 主要内容 主导航
.2007年2月27日；104(9):3095-100.
doi:10.1073/pnas.0610548104。

Parkin中间环结构域的结构为常染色体隐性遗传帕金森病中的E3-气体功能障碍提供了见解

史蒂文·比斯利 1, Ventzislava A Hristova公司, 加里·S·肖
附属公司

Parkin中间环结构域的结构为常染色体隐性遗传帕金森病中的E3-气体功能障碍提供了见解

史蒂文·比斯利等。 美国国家科学院程序. .

摘要

Parkin突变是常染色体隐性遗传青少年帕金森综合征患者的主要遗传因素之一。Parkin是E3泛素连接酶家族的一员，该家族由三部分中间环（IBR）-RING2基序定义。在Parkin中，IBR结构域被证明可以增强E2蛋白UbcH7和UbcH8的结合，以及随后的蛋白联合体-1、9月5日和SIM2的泛素化。为了便于我们理解Parkin函数，使用核磁共振波谱求解了Parkin IBR结构域的溶液结构。IBR结构域（残基M327-S378）的折叠被发现是锌依赖性的，其结构揭示了该结构域形成一对独特的剪刀状和GAG节状锌结合位点，不同于其他锌结合基序，如RING、LIM、PHD或B-box基序。IBR结构域的N端残基E307-E322是非结构化的。致病突变T351P导致整体去折叠，而突变R334C导致结构域的一些结构重排。相反，含有突变G328E的蛋白质似乎被正确折叠。Parkin IBR结构域的结构，结合突变数据，可以提出一个模型，其中IBR结构域促进相邻RING1和RING2结构域的紧密排列，以促进蛋白质相互作用和随后的泛素化。

PubMed免责声明

利益冲突声明

作者声明没有利益冲突。

数字

图1。
图1。
所示为600 MHz1H（H）-15Parkin IBR的N HSQC光谱307–384(一)折叠0.2 mM IBR307–384在25 mM磷酸盐缓冲液（pH 6.95）中，100 mM NaCl，1 mM DTT，25°C。(b条)IBR光谱307–384从一添加EDTA后，蛋白质开始展开。由先导序列（克隆过程中的伪影）产生的峰值用星号表示。
图2。
图2。
Parkin IBR的结构307–384域。(一)CYANA目标功能最低的20个结构的主干叠加。叠加使用了残基G329–C332、C337–C352和C360–S377，得出骨架rmsd为0.41±0.09Å. 锌结合位点I包括延伸环区域L1（蓝色）和L2（绿色），锌结合位点II显示为红色(b条)Parkin IBR的带状图，显示了配合锌残留物的位置。未显示非结构化N-（307–319）和C-末端（378–384）区域。
图3。
图3。
保留了IBR域的锌配位和核心区域。(一)带状结构显示Parkin中保守的核心疏水残基的堆积。该结构显示残基V330、A339和L341（L1）与残基V350和F364（L2）堆积，形成剪刀状排列。两个外围残基P343和R366提供辅助相互作用，而Y372有助于将位点II稳定到位点I(b条)根据ClustalW（43）和Jalview（44）构建的几个人类Paralog对IBR域进行多序列比对。下划线蛋白与人UbcH7和UbcH8相互作用，而RNF14仅与UbcH7.相互作用。突出显示了保守的金属结合配体（黄色）和疏水核心残基（绿色）。指出了在ARJP（开放星）中发现突变并在本研究中发生突变的残基（填充星）。
图4。
图4。
选定的600 MHz区域1Parkin IBR的核磁共振氢谱307–384和在ARJP患者中发现的错义突变。残基标记为下游酰胺区(一)，芳香族区域(b条)，和upfield脂肪族甲基质子区(c（c）). 对光谱进行缩放，以提供近似相等的峰值强度。内部标准DSS的残余峰用星号表示。
图5。
图5。
提议的Parkin相互作用以及IBR和RING域的安排。IBR结构的表面表示显示了ARJP突变（G328E、R334C、V380L）的位置，显示为红色。其中两个突变（G328E、R334C）和保守残基L331（蓝色）位于L1环上，导致底物如亲蛋白-1和p38的结合和泛素化降低。其他底物根据指示与RING1–IBR或IBR–RING2结构域对相互作用的生化实验列出。拟进行S-亚硝基化（C323）或磷酸化（S378）的残留物以黄色显示。这些残基以及错义突变位点V380位于IBR结构域的顶部，其中N和C末端在空间上非常接近，使得RING1和RING2结构域彼此和IBR结构区非常接近。
请参阅PMC中的此图像和版权信息

类似文章

查看所有类似文章

引用人

查看所有“引用者”文章

工具书类

    1. 华纳TT，夏皮拉AH。作者：Ann Neurol。2003年，第S16–S23页。讨论S23–S25。-公共医学
    1. Betarbet R、Sherer TB、Greenamyre JT。实验神经学。2005;191（补充1）：S17–S27。-公共医学
    1. Shimura H、Hattori N、Kubo S、Mizuno Y、Asakawa S、Minoshima S、Shimizu N、Iwai K、Chiba T、Tanaka K、Suzuki T.Nat Genet。2000年；25:302–305.-公共医学
    1. Zhang Y、Gao J、Chung KK、Huang H、Dawson VL和Dawson TM。美国国家科学院院刊，2000年；97:13354–13359.-项目管理咨询公司-公共医学
    1. Tanaka K、Suzuki T、Hattori N、Mizuno Y、Biochim Biophys Acta。2004;1695:235–247.-公共医学

出版物类型

关联数据

LinkOut-更多资源