Tumor-specific and proliferation-specific gene expression typifies murine transgenic B cell lymphomagenesis

doi:10.1074/jbc.M605870200

比较研究

.2007年2月16日；282(7):4803-4811.

doi:10.1074/jbc。M605870200。 Epub 2006年12月13日。

肿瘤特异性和增殖特异性基因表达是小鼠转基因B细胞淋巴瘤的典型特征

马克·伦伯格¹, 阿努帕马·辛哈², 道格拉斯·V·法勒², 杰拉尔德·V·丹尼斯^三

附属公司

¹马萨诸塞州波士顿市波士顿大学医学院遗传学与基因组学系，邮编：02118。
²马萨诸塞州波士顿市波士顿大学医学院癌症研究中心，邮编：02118。
^三波士顿大学医学院癌症研究中心，马萨诸塞州波士顿02118。电子地址：gdenis@bu.edu。

PMID： 17166848
预防性维修识别码：项目经理2819333
内政部： 10.1074/jbc。M605870200型

比较研究

肿瘤特异性和增殖特异性基因表达是小鼠转基因B细胞淋巴瘤的典型特征

马克·伦伯格等。生物化学杂志. 2007.

.2007年2月16日；282(7):4803-4811.

doi:10.1074/jbc。M605870200。 Epub 2006年12月13日。

作者

马克·伦伯格¹, 阿努帕马·辛哈², 道格拉斯·V·法勒², 杰拉尔德·丹尼斯^三

附属公司

¹马萨诸塞州波士顿市波士顿大学医学院遗传学与基因组学系，邮编：02118。
²马萨诸塞州波士顿市波士顿大学医学院癌症研究中心，邮编：02118。
^三马萨诸塞州波士顿市波士顿大学医学院癌症研究中心，邮编：02118。电子地址：gdenis@bu.edu。

PMID： 17166848
预防性维修识别码：项目经理2819333
内政部： 10.1074/jbc。M605870200型

摘要

双溴主蛋白Brd2与基础转录因子TAF（II）250密切相关，该转录因子对细胞周期蛋白A反式激活和哺乳动物细胞周期进展至关重要。在转基因小鼠中，Brd2的组成性淋巴表达引起的恶性肿瘤与人类弥漫性大B细胞淋巴瘤最为相似。我们将这些淋巴瘤的全基因组转录表达谱与增殖和静止的正常B细胞的转录表达谱进行了比较。转基因肿瘤可重复显示大量对细胞周期控制和淋巴细胞生物学重要的基因的差异表达；表达模式要么是肿瘤特异性的，要么是增殖特异性的。他们的一些人类直系亲属与人类淋巴腺病有关。其他与人类疾病生存时间相关。BRD2在人类淋巴瘤的某些亚型中表达不足，并且这些亚型与BRD2介导的小鼠肿瘤显示出许多相似性。我们高度详细地说明了癌症不仅仅是细胞增殖猖獗，还涉及许多基因的额外转录动员，其中一些基因的特征很差，显示了肿瘤特异性的基因表达模式。

PubMed免责声明

数字

**图1。恶性B细胞分析；正常、初级、静止和激活的B-2细胞**
一个流式细胞术检测正常和淋巴瘤小鼠脾细胞。前进(*金融稳定委员会*)与侧面(*子系统控制器*)散点图显示淋巴瘤小鼠脾脏中有较大的淋巴细胞。B细胞身份标记(*CD5、sIgM*)和激活(*B7-1、B7-2*)，每个耦合到PE(*y轴；FL2通道，对数刻度*)，用于双色流式细胞术分析，以对抗与FITC偶联的泛B细胞标记B220(*x轴；FL1通道，对数刻度*).B类，刺激来自非Tg小鼠的纯化正常脾B-2细胞*在体外*使用所述的抗IgM、抗CD40和白细胞介素-4，然后检测B细胞活化标记物(*CD25、CD69、B7-1、B7-2*). (*打开直方图*，休眠细胞；*闭合直方图*，刺激48小时后的细胞）。以前曾发表过同位素对照（6）。

**图2。Tg淋巴瘤期间基因表达的全球差异**
一个，对Tg和非Tg小鼠中序列特异性杂交强度的所有基因进行基因表达测量的PCA，表明Tg在休息时不会显著干扰基因表达(*第1页*)并激活(*第2页*)B细胞；但B细胞激活和Tg介导的淋巴腺病导致了类似的基因表达变化模式。B类，3342个问题的基因表达测量的主成分分析，这些问题在静息B细胞之间有显著差异(*第1页*)和侵袭性Tg淋巴瘤(*第5页*)显示在淋巴结肿大时和在B细胞活化时激活的基因表达模式既有相似之处也有不同之处。中的数字*圆括号*在每个轴上是由每个主成分解释的基因表达总变异的分数。

**图3。基因表达模式**
一个，侵袭性Tg淋巴瘤中差异表达的基因的不同表达模式。P1和P5之间杂交强度不同的3342探针由顶部到底部通过层次聚类。基因表达组内模式最一致的七组探针被标记为C1–C7。相对于每个探针的平均杂交强度的折变显示在从蓝色到红色. The条形图到左边每一组中的代表该组中所有基因相对于其他四个病理组中每一组静止B细胞的平均折叠变化。正如PCA所预期的那样（图2B），P2和P5之间大多数簇中的基因表达相似。两个显著的例外是C2和C7，P2中观察到的基因表达水平与P1比P5更相似。B类在侵袭性Tg淋巴瘤中差异表达的一些基因的人类同源基因与人类淋巴瘤有关。研究人员检测了已报道用于区分不同类别人类淋巴瘤的小鼠基因直系图与3342个探针的重叠，这些探针在静止B细胞和侵袭性Tg淋巴瘤之间存在差异。侵袭性Tg淋巴瘤中不同的基因与人类淋巴瘤相关，这些基因根据其区分的人类淋巴瘤亚型进行彩色编码。在Tg淋巴瘤中不同的基因中，与人类淋巴瘤相关的基因密度最高的是C3，主要由区分高度增殖的人类淋巴瘤的基因组成（大致为*氧磷化合物*在蒙蒂等。（32）和*增殖的*在Alizadeh等。(5)). 蒙蒂岛的基因等。(32)*业务连续性审查*类别和Alizadeh等。(5)*GB（英国）*范畴粗略区分生发中心(*GC公司*)B细胞样人类淋巴瘤。蒙蒂岛的基因等。（32）标签类别免疫区分具有宿主反应表型的人类淋巴瘤。托运人等。（3）类别是指在较低水平表达的基因(*向下处于活动状态*)或更高级别(*向上处于活动状态*)在高度增殖的人类淋巴瘤中。

**图4。人淋巴瘤中Tg淋巴瘤基因的差异表达**
Monti的数据集等。（32）通过对176例临床人类淋巴瘤样本的基因表达测量，根据基因表达模式（32）将其分为三个不同的DLCL类别，以检测Tg淋巴癌基因的差异表达。一个，人工日志方框图₁₀ *巴西雷亚尔2*OP、BCR和HR淋巴瘤的表达水平。B类人类淋巴瘤中827个探针的表达水平因人类淋巴瘤亚型而异，并询问与侵袭性Tg淋巴瘤中不同探针同源的基因，通过Tg淋巴瘤的表达模式的层次聚类从上到下进行组织(*图4A*).C类OP亚型和侵袭性Tg淋巴瘤中表达更高，或OP亚型中表达更低，侵袭性Tg淋巴瘤中表达更低。

**图5。与人类生存时间相关的Tg淋巴瘤基因的差异表达**
我们在蒙蒂发现了120个问题等。（32）与淋巴瘤生存时间显著正相关或负相关的数据集，发现其中20个数据集询问与休眠B细胞和侵袭性Tg淋巴瘤之间差异的基因同源的基因表达。人类淋巴瘤的表达见左边样本组织自*从左到右*通过生存时间。小鼠静息B细胞(*第1页*)和侵袭性Tg淋巴瘤(*第5页*)表达式显示在*正确的*.问题是从以下方面组织的*从上到下*通过人类基因表达模式的层次聚类。

**图6。在淋巴细胞生物学中特别重要的肿瘤特异性基因**
侵袭性淋巴瘤中上调的淋巴细胞生物学中特别重要的基因(*第5页*)相对于静止和激活的正常B细胞(*第1页、第2页*)来自集群C2的数据在上部块中标识。与来自集群C7的静止和激活的正常B细胞相比，侵袭性淋巴瘤中下调的基因在下区被发现。中级病理淋巴瘤样本(*第3页，第4页*)显示了这些基因的中等表达水平。

请参阅PMC中的此图像和版权信息

类似文章

Eμ-BRD2转基因小鼠发展为B细胞淋巴瘤和白血病。
Greenwald RJ、Tumang JR、Sinha A、Currier N、Cardiff RD、Rothstein TL、Faller DV、Denis GV。 Greenwald RJ等人。鲜血。2004年2月15日；103（4）：1475-84。doi:10.1182/bloud-2003-06-2116。Epub 2003年10月16日。鲜血。2004 PMID：14563639 免费PMC文章。
双溴主蛋白Brd2促进B细胞扩张和有丝分裂。
Belkina AC、Blanton WP、Nikolajczyk BS、Denis GV。 Belkina AC等人。白细胞生物学杂志。2014年3月；95(3):451-60. doi:10.1189/jlb.1112588。Epub 2013年12月6日。白细胞生物学杂志。2014 PMID：24319289 免费PMC文章。
周期蛋白A Brd2依赖性转录激活的溴化酶分析。
Sinha A、Faller DV、Denis GV。 Sinha A等人。《生物化学杂志》2005年4月1日；387（第1部分）：257-69。doi:10.1042/BJ20041793。《生物化学杂志》，2005年。 PMID：15548137 免费PMC文章。
针对B细胞肿瘤中CK2驱动的非癌基因成瘾。
Mandato E、Manni S、Zaffino F、Semenzato G、Piazza F。 Mandato E等人。致癌物。2016年11月24日；35(47):6045-6052. doi:10.1038/onc.2016.86。Epub 2016年4月4日。致癌物。2016 PMID：27041560 审查。
【淋巴瘤中的分子异常】。
德尔索尔G。德尔索尔G。牛癌。2010年11月；97(11):1347-64. doi:10.1684/bdc.2010.1214。牛癌。2010 PMID：21084243 审查。法国人。

查看所有类似文章

引用人

Brd2单倍体充足延长了C57B6/J小鼠的寿命和健康寿命。
Pathak S、Stewart WCL、Burd CE、Hester ME、Greenberg DA。 Pathak S等人。公共科学图书馆一号。2020年6月19日；15（6）：e0234910。doi:10.1371/journal.pone.0234910。eCollection 2020。公共科学图书馆一号。2020 PMID：32559200 免费PMC文章。
小鼠单细胞RNA-seq揭示了细胞同一性和组织特定的衰老轨迹。
Kimmel JC、Penland L、Rubinstein ND、Hendrickson DG、Kelley DR、Rosenthal AZ。 Kimmel JC等人。基因组研究2019年12月；29(12):2088-2103. doi:10.1101/gr.253880.119。Epub 2019年11月21日。 2019年基因组研究。 PMID：31754020 免费PMC文章。
蛋白精氨酸甲基转移酶5（PRMT5）通过激活WNT/β-catenin和AKT/GSK3β增殖信号促进淋巴瘤细胞的存活。
Chung J、Karkhanis V、Baiocchi RA、Sif S。 Chung J等人。生物化学杂志。2019年5月10日；294(19):7692-7710. doi:10.1074/jbc。RA119.007640。Epub 2019年3月18日。生物化学杂志。2019 PMID：30885941 免费PMC文章。
BET抑制剂的临床试验领先于科学。
Andrieu G、Belkina AC、Denis GV。 Andrieu G等人。今日药物研发技术。2016年3月；19:45-50. doi:10.1016/j.ddtec.2016.06.004。Epub 2016年7月21日。今日药物研发技术。2016 PMID：27769357 免费PMC文章。审查。
复发/难治性弥漫性大B细胞淋巴瘤个性化精确药物的新靶点：一项全面综述。
Camcia R、Winkler HC、Hassa PO。 Camcia R等人。摩尔癌症。2015年12月11日；14:207. doi:10.1186/s12943-015-0474-2。摩尔癌症。2015 PMID：26654227 免费PMC文章。审查。

查看所有“引用者”文章

工具书类

1. Edwards BK、Brown ML、Wingo PA、Howe HL、Ward E、Ries LAG、Schrag D、Jamison PM、Jemal A、Wu XC、Friedman C、Harlan L、Warren J、Anderson RN、Pickle LW。《美国国家癌症研究所杂志》，2005年；97:1407–1427.-公共医学
1. Hennessy BT、Hanrahan EO、Daly PA、Lancet Oncol。2004;5:341–353.-公共医学
1. Shipp MA、Ross KN、Tamayo P、Weng AP、Kutok JL、Aguiar RC、Gaasenbeek M、Angelo M、Reich M、Pinkus GS、Ray TS、Koval MA、Last KW、Norton A、Lister TA、Mesirov J、Neuberg DS、Lander ES、Aster JC、Golub TR.Nat.Med.2002；8:68–74.-公共医学
1. Godwin JE，Fisher RI.临床。淋巴瘤。2001;2:155–163.-公共医学
1. Alizadeh AA、Eisen MB、Davis RE、Ma C、Lossos IS、Rosenwald A、Boldrick JC、Sabet H、Tran T、Yu X、Powell JI、Yang L、Marti GE、Moore T、Hudson J，Jr.、Lu L、Lewis DB、Tibshirani R、Sherlock G、Chan WC、Greiner TC、Weisenburg DD、Armitage JO、Warnke R、Levy R、Wilson W、Grever MR、Byrd JC、Botstein D、Brown PO、Staudt LM。自然。2000年；403:503–511.-公共医学

出版物类型

行动
行动
行动

MeSH术语

行动
行动
行动
行动
行动
行动
行动
行动
行动
行动
行动
行动
行动
行动
行动
行动
行动
行动
行动

物质

行动
行动
行动
行动
行动

赠款和资金

LinkOut-更多资源

[1] Edwards BK、Brown ML、Wingo PA、Howe HL、Ward E、Ries LAG、Schrag D、Jamison PM、Jemal A、Wu XC、Friedman C、Harlan L、Warren J、Anderson RN、Pickle LW。《美国国家癌症研究所杂志》，2005年；97:1407–1427.-公共医学

[2] Edwards BK、Brown ML、Wingo PA、Howe HL、Ward E、Ries LAG、Schrag D、Jamison PM、Jemal A、Wu XC、Friedman C、Harlan L、Warren J、Anderson RN、Pickle LW。《美国国家癌症研究所杂志》，2005年；97:1407–1427.-公共医学

[3] Hennessy BT、Hanrahan EO、Daly PA、Lancet Oncol。2004;5:341–353.-公共医学

[4] Hennessy BT、Hanrahan EO、Daly PA、Lancet Oncol。2004;5:341–353.-公共医学

[5] Shipp MA、Ross KN、Tamayo P、Weng AP、Kutok JL、Aguiar RC、Gaasenbeek M、Angelo M、Reich M、Pinkus GS、Ray TS、Koval MA、Last KW、Norton A、Lister TA、Mesirov J、Neuberg DS、Lander ES、Aster JC、Golub TR.Nat.Med.2002；8:68–74.-公共医学

[6] Shipp MA、Ross KN、Tamayo P、Weng AP、Kutok JL、Aguiar RC、Gaasenbeek M、Angelo M、Reich M、Pinkus GS、Ray TS、Koval MA、Last KW、Norton A、Lister TA、Mesirov J、Neuberg DS、Lander ES、Aster JC、Golub TR.Nat.Med.2002；8:68–74.-公共医学

[7] Godwin JE，Fisher RI.临床。淋巴瘤。2001;2:155–163.-公共医学

[8] Godwin JE，Fisher RI.临床。淋巴瘤。2001;2:155–163.-公共医学

[9] Alizadeh AA、Eisen MB、Davis RE、Ma C、Lossos IS、Rosenwald A、Boldrick JC、Sabet H、Tran T、Yu X、Powell JI、Yang L、Marti GE、Moore T、Hudson J，Jr.、Lu L、Lewis DB、Tibshirani R、Sherlock G、Chan WC、Greiner TC、Weisenburg DD、Armitage JO、Warnke R、Levy R、Wilson W、Grever MR、Byrd JC、Botstein D、Brown PO、Staudt LM。自然。2000年；403:503–511.-公共医学

[10] Alizadeh AA、Eisen MB、Davis RE、Ma C、Lossos IS、Rosenwald A、Boldrick JC、Sabet H、Tran T、Yu X、Powell JI、Yang L、Marti GE、Moore T、Hudson J，Jr.、Lu L、Lewis DB、Tibshirani R、Sherlock G、Chan WC、Greiner TC、Weisenburg DD、Armitage JO、Warnke R、Levy R、Wilson W、Grever MR、Byrd JC、Botstein D、Brown PO、Staudt LM。自然。2000年；403:503–511.-公共医学

将引文保存到文件

电子邮件引文

添加到集合

添加到我的书目

您保存的搜索

为外部引文管理软件创建文件

你的RSS订阅源

肿瘤特异性和增殖特异性基因表达是小鼠转基因B细胞淋巴瘤的典型特征

附属公司

肿瘤特异性和增殖特异性基因表达是小鼠转基因B细胞淋巴瘤的典型特征

作者

附属公司

摘要

数字

类似文章

引用人

工具书类

出版物类型

MeSH术语

物质

赠款和资金

LinkOut-更多资源

全文源

分子生物学数据库

其他

摘要

数字

类似文章

引用人

工具书类

出版物类型

MeSH术语

物质

相关信息

赠款和资金

LinkOut-更多资源

全文源

分子生物学数据库

其他