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比较研究
.2003年12月12日;19(18):2461-4。
doi:10.1093/bioinformatics/btg357。

SAGE分析中使用可信度区间代替假设检验

附属公司
比较研究

SAGE分析中使用可信度区间代替假设检验

里卡多·Z·N·Véncio等。 生物信息学. .

摘要

动机:通常用于执行基因表达序列分析(SAGE)分析的统计方法基于假设检验。他们回答了生物学家的问题:“哪些基因的差异表达大于r,P值小于P?”。另一个有用但尚未探索的问题是:“基因差异表达率的不确定性是什么?”。

结果:我们使用SAGE差异基因表达率的贝叶斯模型作为假设检验的更具信息量的替代方案,因为它提供了可信度区间。

可利用性:该模型是用R统计语言脚本实现的,可在补充网站的GNU/GLP copyleft下获得。

补充信息:网址:http://www.ime.uspbr/~rvencio/SAGEci公司/

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