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比较研究
.2003年11月;67(第6部分):580-8。
doi:10.1046/j.1529-8817.2003.00052.x。

使用区间传递/不平衡测试绘制混合物图

附属公司
比较研究

使用区间传递/不平衡测试绘制混合物图

李文昌等。 安·哼·杰奈特. 2003年11月.

摘要

以家族为基础的遗传关联和连锁研究在绘制复杂人类疾病易感基因图谱中发挥着关键作用。最近,基因分化群体之间的混合可能导致高水平的连锁不平衡,即使是在遥远的基因座上。这已被用于减少全基因组关联扫描中的基因分型负担。在这里,作者描述了混合映射的另一种方法。基因组被划分为几个不重叠的区间,同一区间内的标记信息被整合——“区间传递/不平衡检验”(ITDT)。这种方法需要以建立群体中标记等位基因频率的形式提供信息。然而,计算机模拟表明,ITDT的性能几乎不受不精确的等位基因频率信息的影响。模拟还表明,使用ITDT的逐间隔扫描比使用TDT的传统逐标记扫描性能好得多,即使在混合过程发生了多代且混合种群中的个体在混合比例上表现出相当大的差异的情况下也是如此。因此,ITDT是一种很有前途的新的全基因组扫描方法。

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