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生态空间:利用生态空间框架模拟社区聚集和生态多样性的R包

生态空间是一个R包,用于实现社区的随机模拟使用可定制的生态空间框架进行组装(生态多样化)(功能特征空间)。仿真模拟了“中性”、“冗余”、,Bush和Novack-Gottshall(2012)的“分割”和“扩张”模型,以及Novack-Gottshall(2016a,b)。该包提供了一个包装器来计算公共生态差异与功能生态学统计动力学物种丰富度。编写的函数将在并行计算环境。

该软件包还包含一个样本数据集,Late的功能特性Kope和Waynesville奥陶纪(辛辛那提类型)化石物种编队。

最新的代码公开发布在CRAN上:

http://cran.r-project.org/web/packages/ecospace

您可以使用以下命令在R中安装最新的公共发布版本:

install.packages(“ecospace”)

最新的预发布版本可以在GitHub上找到:

https://github.com/pnovack-gottshall/ecospace网站

或直接在R中下载,使用:

库(devtools)devtools::install_github(“pnovack-gottshall/ecospace”)图书馆(生态空间)

工具书类

Novack-Gottshall,P.M.2016a。生态多样化的一般模型。一、概念综合。古生物学42:185-208。

诺瓦克·戈特沙尔,P.M.2016 b。生态多样化的一般模型。二、。模拟和经验应用。古生物学42:209-239。

Bush,A.和P.M.Novack-Gottshall。2012.生态功能建模海洋后生动物在地质时间尺度上的多样性。生物学快报8:151-155.

重印本可在https://www.researchgate.net/profile/Filip_Novack-Gottshall/contributions网站.

最近的提交当前为:Travis-CI构建状态(特拉维斯CI)

本软件包由Phil Novack-Gottshall编写(邮件收件人:pnovack-gottshall@ben.edu)并根据CC0提供。

从RStudio下载ecospace包的当前总次数CRAN镜子是:下载次数

关于

利用生态空间框架模拟社区聚集和生态多样性的R包

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