HDStIM公司 该软件包的目标是确定对刺激物的反应通过标记响应细胞进行CyTOF/流式细胞术刺激试验或者不是基于无监督的高维方法。从开始注释的细胞群通过自动聚类作为FlowSOM或传统单元格门控，主要功能HDStIM（）采用启发式方法将单元格标记为响应或没有回应。 对于细胞群和刺激类型的组合（例如CD127+T辅助细胞和干扰素α），HDStIM（）从执行开始受激和受激细胞组合集上的k-means聚类未模拟样品。对表达式数据执行K-means聚类所有状态标记的组合。使用权变进行聚类时表中，Fisher精确测试确定了影响大小和分区的统计显著性。单元格构成组合通过费舍尔精确测试的被标记为响应。 安装 您可以从安装发布版本的stimcellselectorCRAN（起重机）具有： 安装.包("HDStIM公司") 以及来自的开发版本github具有： #install.packages（“devtools”） 开发工具::安装github("鸟苷酸/HDStIM") 联系人 罗希特·法默（Rohit Farmer）：rohit.farmer@nih.gov,rohit.farmer@gmail.com
