• 作者：Lauren Hallett[lauren.m.hallett@gmail.com]梅根·阿沃利奥[meghan.avolio@jhu.edu]，伊恩·T·卡罗尔[carroll.ian@gmail.com]，悉尼·K·琼斯[syd@sevilleta.unm.edu]安德鲁·麦克唐纳[a.a.m.macdonald@gmail.com]，Dan F.B.Flynn[flynn@fas.harvard.edu]，彼得·斯劳特[屠宰@nceas.ucsb.edu]，朱莉·里普林格[julie.rippling@asu.edu]斯科特·柯林斯[scollins@sevilleta.unm.edu]科琳娜·格里斯[cgries@wisc.edu]，马修·琼斯[jones@nceas.ucsb.edu]
• 1.x版：doi:10.5063/F1542KJB
• 2.x版：doi:10.5063/F1N877Z6
• 许可证:阿帕奇2
• Github上的包源代码
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分析长期生态群落数据集的包。

单变量和多变量时间和空间多样性指数，秩-丰度曲线和群落稳定性指标。功能实现显式暂时的度量，并包括在多个复制中计算它们的选项，或空间和包含在多个时间点计算它们的选项。功能分为五类：静态多样性指数、时间多样性指数，空间多样性指数、秩-丰度曲线与群落稳定性韵律学。多样性指数在时间和空间上与传统多样性指数。具体来说，该包包括函数计算给定点的群落丰富度、均匀度和多样性空间和时间。此外，它还包含计算物种的函数更替、平均等级变动和两者之间社区相似性的滞后时间点。

有关的概述可待因，请参见：

• Hallett LM、Jones SK、MacDonald AAA、Jones MB、Flynn DFB、Ripplinger J、Slaugter P、Gries C、Collins SL（2016）codyn：社区动态指标的R包。生态学与进化方法，7（10）：1146–1151。https://doi.org/10.1111/2041-210X.12569

有关中较新的空间方法的描述可待因版本2.x：

• Avolio ML、Carroll IT、Collins SL、Houseman GR、Hallett LM、Isbell F、Koerner SE、Komatsu KJ、Smith MD、Wilcox KR（2019）使用秩-丰度曲线分析群落动态的综合方法。生态圈，10（10）：e02881。https://doi.org/10.1002/ecs2.2881

通过CRAN，可以使用标准工具安装软件包：

安装.包("可待因")

简化运行过程R CMD检查在包上，可以使用这个罗布包裹。使用rhub:：平台（）获取可用于构建和测试的平台列表。

图书馆(罗布)chks公司 <-检查(平台 =c（c）("debian-gcc-水平","费多拉gcc-devel"),显示状态（_S） = 错误的)

并且可以使用rhub以及docker容器在本地运行检查：

图书馆(罗布)本地检查列表(形象="rhub/fedora-gcc-devel公司")

该一揽子计划的工作得到了美国国家科学基金会ABI向C.Gries、M.Jones和S.Collins提供的1262458号赠款的支持。国家生态分析与合成中心、加利福尼亚大学圣巴巴拉分校和加利福尼亚州资助的中心以及美国科学与发展协会SESYNC合成博士后奖学金为工作组合作提供了额外支持。