Symmetry of helicoidal biopolymers in the frameworks of algebraic geometry: α-helix and DNA structures

Samoylovich, M.; Talis, A.

doi:10.1107/S2053273313033822

代数几何框架中螺旋状生物聚合物的对称性：α-螺旋和DNA结构

代数几何和拓扑结构链被映射到一个结构层次上，允许人们挑选出一类特殊的离散螺旋结构。属于这一类的结构是局部周期的，在三维欧几里得空间中拓扑稳定，并对应于分支域。其边界极小曲面的奇点由八维晶格第二配位球对称性决定的变换关联E类₈这些点代表簇顶点，其螺旋面连接决定了线性生物聚合物的拓扑和结构参数。特别是，α-螺旋的结构参数由四面体与E类₈非整数螺旋轴40/11的旋转角为99°，其表面的发展与α螺旋的圆柱形发展一致。此外，还创建了包装模型，用于确定一个,B类和Z轴DNA的形式。

关键词：代数几何;拓扑;八维格E类₈;多面体;螺旋轴40/11;α-螺旋;结构.

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