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标题化合物[Co(C5H(H)N个2O(运行)2)2(H)2O) ]n个由水热合成制备,与铁同构和镍类似物。不对称单元包含两个键合到钴上的二苯并吡嗪-2-羧酸阴离子在赤道平面上通过一个N原子和一个O原子。公司原子通过其中一个吡嗪-2-羧酸阴离子的第二个N原子与相邻钴的轴向位置结合而成链原子。Co周围轻微扭曲的八面体配位由水分子完成,水分子形成氢键将链连接成三维结构。修正后的Flack参数为0.452(15) 表示反转孪晶。

支持信息

到岸价

结晶信息文件(CIF)https://doi.org/10.107/S1600536807027961/bi2194sup1.cif
包含全局数据块,I

香港特别行政区

结构系数文件(CIF格式)https://doi.org/10.107/S1600536807027961/bi2194Isup2.hkl
包含数据块I

CCDC参考:1225689

关键指标

  • 单晶X射线研究
  • T型=298千
  • 平均值[西格玛](C-C)=0.004º
  • R(右)系数=0.024
  • 水风险系数=0.055
  • 数据与参数之比=11.6

检查CIF/PLATON结果

未发现语法错误
警报级别C STRVA01_警报4_CFlack测试结果不明确。来自CIF:_refine_ls_abs_structure_Flack 0.452来自CIF:_refine_ls_abs_structure_Flack_su 0.015板033_ LERT_2_CFlack参数值与零偏差2*su。0.45PLAT094_警报_2_C最大/最小残余密度比。。。。3.59PLAT369_铭牌_2_C长C(sp2)-C(sp2”)键C1-C2。。。1.55角度。PLAT369_铭牌_2_C长C(sp2)-C(sp2”)键C8-C9。。。1.55角度。PLAT731_警报_1_C债券计算0.82(3),代表0.820(10)。。。。。。3.00 su-RaO5-H52 1.555 1.555PLAT735_警报_1_CD-H计算值0.82(3),代表值0.820(10)。。。。。。3.00 su-RaO5-H52 1.555 1.555PLAT736_警报_1_CH…A计算值1.89(3),代表值1.880(10)。。。。。。3.00 su-RaH52-氧气1.555 4.456
警报级别G 参考03_图纸_4_G请检查Friedel对数量的估计值是否为对的。如果不是,请在_提交的CIF的publ_section_exptl_refinement部分。来自CIF:_diffrn_reflns_theta_max 26.02来自CIF:_reflns_number_total 2198对称唯一refns计数1318完整性(总计/计算)166.77%测试3:检查Friedels的非中心结构弗里德尔对测量值估计值880Friedel对分数测量值为0.668是否存在重原子类型Z>Si是PLAT794_ALERT_5_G检查Co1(2)2.06的预测键价板860_ LERT_3_G注:租赁平方限制数量。。。。。。。
0A级警报=一般情况:严重问题0B级警报=潜在的严重问题8C级警报=检查并解释G级警报=一般警报;检查3警报类型1 CIF结构/语法错误,数据不一致或缺失4警报类型2结构模型可能错误或有缺陷的指示器1警报类型3结构质量可能较低的指示器2警报类型4改进、方法、查询或建议1警报类型5信息性消息,检查

注释顶部

标题化合物[Co(C5H(H)N个2O(运行)2)2(H)2O) ]n个,是同构的含铁和镍类似物(Hao&Liu,2007;Hao,Mu&Liu,2007)。

公司原子由两个O和两个N原子以双齿形式配位来自两个独立的吡嗪-2-羧酸阴离子。扭曲的八面体配位由第三个原子中的另一个N原子完成吡嗪-2-羧酸配体和水分子的O原子(图1)。Co-N和Co-O键长在2.057(2)–2.104(2)和分别为2.0384(17)–2.0723(18)欧。

一个吡嗪-2-羧酸配体与相邻钴配位原子通过它的第二个N原子,导致了具有之字形的聚合物结构平行于b条轴(图2)。氢键在水分子之间稳定结构。

相关文献顶部

对于同构铁和镍类比,参见:郝和刘(2007);等。(2007).

实验顶部

所有化学品都是从济南恒华科技有限公司购买的氯化镍混合物2.6小时2O(0.5 mmol),KOH(0.5 mmol/),2-吡嗪羧酸酸(0.5 mmol)、EtOH(8 ml)和H2O(8 ml),置于25 ml聚四氟乙烯衬里中将不锈钢高压釜加热至413K,持续2d。冷却至室温温度、红色晶体的产率为36%。元素分析计算值:C 37.15,H 3.10,N 17.34,Co 18.27%;发现:C 37.12,H 3.12,N17.38,钴18.19%。

精炼顶部

C原子上的H原子以几何方式放置,并与C-H一起细化=0.93º和U型国际标准化组织(H) =1.2U型等式(C) ●●●●。水的氢原子分子由不同的傅里叶图定位,并用O-H=0.82(1)欧和H··H=1.35(1)奥的距离约束。这个907对Friedel的精细Flack参数(Flack,1983)为0.452(15),指示反转孪晶。

结构描述顶部

标题化合物[Co(C5H(H)N个2O(运行)2)2(H)2O) ]n个,是同构的含铁和镍类似物(Hao和Liu,2007;Hao,Mu和Liu(2007))。

公司原子由两个O和两个N原子以双齿形式配位来自两个独立的吡嗪-2-羧酸阴离子。扭曲的八面体配位是由第三个原子中的另一个N原子完成的吡嗪-2-羧酸配体和水分子的O原子(图1)。Co-N和Co-O键长在2.057(2)–2.104(2)和分别为2.0384(17)–2.0723(18)欧。

一个吡嗪-2-羧酸配体与相邻钴配位原子通过它的第二个N原子,导致了具有之字形的聚合物结构平行于b条轴(图2)。氢键在水分子之间稳定结构。

对于同构铁和镍类比,参见:郝和刘(2007);等。(2007).

计算详细信息顶部

数据收集:智能(布鲁克,2001年);单元格细化:圣普卢斯(布鲁克,2001年);数据缩减:圣普卢斯; 用于求解结构的程序:架子97(谢尔德里克,1997);用于优化结构的程序:SHELXL97型(谢尔德里克,1997);分子图形:SHELXTL公司(布鲁克,2001年);用于准备出版材料的软件:SHELXTL公司.

数字顶部
[图1] 图1。标题化合物的不对称单元展开以显示完整钴的配位范围位移椭球显示为30%非H原子的概率。对称代码(i):1-x个+1/2,-z+ 1/2.
[图2] 图2。[Co(C)视图5H(H)N个2O(运行)2)2(H)2O) ]n个协调聚合物。
-聚[[水(吡嗪-2-羧基)钴(II)]-µ-吡嗪2-羧基]顶部
水晶数据 顶部
[公司(C)5H(H)N个2O(运行)2)2(H)2O) ]F类(000) = 652
M(M)= 323.13D类x个=1.871毫克
正交各向异性,P(P)212121K(K)α辐射,λ= 0.71073 Å
大厅符号:P2ac 2ab2198次反射的细胞参数
= 8.0121 (10) Åθ= 2.5–26.0°
b条= 9.5327 (10) ŵ=1.52毫米1
c(c)= 15.023 (2) ÅT型=298千
V(V)= 1147.4 (2) Å方块,红色
Z轴= 40.10×0.10×0.10毫米
数据收集 顶部
Bruker SMART CCD区域探测器
衍射仪
2064次反射> 2σ()
辐射源:精细聚焦密封管R(右)整数=0.026
石墨单色仪θ最大值= 26.0°,θ最小值= 2.5°
ω扫描小时=89
5916次测量反射k个=1110
2198次独立反射=189
精炼 顶部
优化于F类2二次原子位置:差分傅里叶映射
最小二乘矩阵:完整氢站点位置:从邻近站点推断
R(右)[F类2> 2σ(F类2)] = 0.024用独立和约束精化的混合物处理H原子
水风险(F类2) = 0.055 w个= 1/[σ2(F类o个2) + (0.0323P(P))2]
哪里P(P)= (F类o个2+ 2F类c(c)2)/3
S公司= 1.04(Δ/σ)最大值< 0.001
2198次反射Δρ最大值=0.80埃
190个参数Δρ最小值=0.22埃
3个约束绝对结构:Flack(1983),有907对Friedel对
主原子位置定位:结构-变量直接方法绝对结构参数:0.452(15)
水晶数据 顶部
[公司(C)5H(H)N个2O(运行)2)2(H)2O) ]V(V)= 1147.4 (2) Å
M(M)= 323.13Z轴= 4
正交各向异性,P(P)212121K(K)α辐射
= 8.0121 (10) ŵ=1.52毫米1
b条= 9.5327 (10) ÅT型=298千
c(c)= 15.023 (2) Å0.10×0.10×0.10毫米
数据收集 顶部
Bruker SMART CCD区域探测器
衍射仪
2064次反射> 2σ()
5916次测量反射R(右)整数= 0.026
2198次独立反射
精炼 顶部
R(右)[F类2> 2σ(F类2)] = 0.024用独立和约束精化的混合物处理H原子
水风险(F类2) = 0.055Δρ最大值=0.80埃
S公司= 1.04Δρ最小值=0.22埃
2198次反射绝对结构:Flack(1983),有907对Friedel对
190个参数绝对结构参数:0.452(15)
3个约束
特殊细节 顶部

几何图形.所有e.s.d.(两个l.s.平面之间二面角的e.s.d.除外)使用全协方差矩阵进行估计在估计e.s.d.的距离、角度时单独考虑和扭转角;e.s.d.细胞内参数之间的相关性仅为当它们由晶体对称性定义时使用。近似(各向同性)细胞e.s.d.的处理用于估计涉及l.s.的e.s.d。飞机。

精炼.改进F类2对抗所有反射。加权R(右)-因子水风险和贴合度S公司基于F类2,常规R(右)-因素R(右)基于F类,使用F类设置为零消极的F类2。的阈值表达式F类2>σ(F类2)仅用于计算R(右)-因子(gt).并且与选择反射进行细化无关。R(右)-因素基于F类2从统计上看大约是两倍大作为那些基于F类、和R(右)-基于所有数据的系数将为甚至更大。

分数原子坐标和各向同性或等效各向同性位移参数2) 顶部
x个zU型国际标准化组织*/U型等式
二氧化碳0.42683 (4)0.36583 (3)0.409285 (19)0.01727(9)
C1类0.6433(3)0.5285 (3)0.51916 (18)0.0279 (6)
指挥与控制0.4620 (3)0.5736 (3)0.54104 (17)0.0279(6)
C3类0.4253 (4)0.6652 (3)0.60858 (18)0.0388 (7)
H3A型0.51220.70300.64190.047*
补体第四成份0.1419 (3)0.6488 (3)0.57852 (19)0.0363 (6)
H4A型0.03200.67420.59020.044*
C5级0.1760 (3)0.5570 (3)0.51064 (18)0.0311 (6)
H5A型0.08900.52080.47670.037*
C6级0.6842 (3)0.0674 (3)0.23679 (18)0.0291 (6)
H6A型0.79130.04070.22000.035*
C70.3951(3)0.0422 (3)0.22755 (17)0.0251 (6)
早上7点0.30240.00400.20460.030*
抄送80.1943(3)0.1916 (3)0.31693 (16)0.0229 (5)
C9级0.3723 (3)0.1454 (3)0.28905 (15)0.0226 (5)
C10号机组0.6630 (3)0.1690 (3)0.29927 (18)0.0274 (6)
H10A型0.75550.21170.32490.033*
N1型0.3349 (3)0.5187 (2)0.49264 (13)0.0254 (5)
氮气0.2661 (3)0.7025 (3)0.62837 (17)0.0447 (7)
N3号机组0.5503 (3)0.0048 (2)0.19881 (13)0.0253 (5)
4号机组0.5061 (3)0.2085 (2)0.32447 (14)0.0239(5)
O1公司0.7625(2)0.5798 (3)0.55879 (15)0.0487 (6)
氧气0.6535 (2)0.43497 (18)0.45923 (11)0.0270(4)
臭氧0.1939 (2)0.29727 (18)0.36884 (11)0.0268 (4)
O4号机组0.0688 (2)0.13059 (19)0.29097 (11)0.0356 (4)
O5公司0.4188 (3)0.23496 (19)0.51651 (12)0.0333 (4)
H51型0.501 (2)0.219 (3)0.5471 (17)0.041 (10)*
H52型0.344 (3)0.179 (3)0.527 (2)0.067 (13)*
原子位移参数(2) 顶部
U型11U型22U型33U型12U型13U型23
二氧化碳0.01816 (14)0.01545 (14)0.01821 (14)0.00010 (13)0.00071 (13)0.00059 (13)
C1类0.0271 (13)0.0267(14)0.0297 (14)0.0013(11)0.0016 (11)0.0032 (11)
指挥与控制0.0294 (16)0.0273 (13)0.0271 (13)0.0015 (11)0.0007 (11)0.0022 (11)
C3类0.0341(15)0.0380 (16)0.0443 (18)0.0030 (14)0.0049 (14)0.0150 (12)
补体第四成份0.0303 (13)0.0336(15)0.0449 (16)0.0038 (12)0.0041 (12)0.0077 (14)
C5级0.0264 (14)0.0285 (14)0.0384 (16)0.0029 (11)0.0033 (12)0.0001 (11)
C6级0.0240 (14)0.0298 (14)0.0333 (15)0.0011 (11)0.0001 (11)0.0042 (12)
C70.0265 (15)0.0234 (12)0.0253 (12)0.0009 (10)0.0018 (11)0.0023 (10)
抄送80.0221 (13)0.0243 (12)0.0222 (13)0.0001 (10)0.0014 (10)0.0025 (10)
C9级0.0263 (12)0.0220 (12)0.0196 (11)0.0010 (11)0.0008 (9)0.0026(10)
C10号机组0.0229(13)0.0283 (15)0.0309 (14)0.0003 (11)0.0014 (11)0.0033 (11)
N1型0.0261 (11)0.0218 (11)0.0281(11)0.0007 (9)0.0004 (9)0.0001 (9)
氮气0.0410 (15)0.0440 (15)0.0492 (15)0.0038 (12)0.0048 (12)0.0184 (12)
N3号机组0.0282 (12)0.0228 (10)0.0248 (10)0.0014 (10)0.0011 (9)0.0007 (8)
4号机组0.0246 (11)0.0221 (11)0.0251 (12)0.0006 (9)0.0011 (9)0.0032 (9)
O1公司0.0305 (11)0.0535 (13)0.0620 (14)0.0047 (10)0.0088 (10)0.0188 (11)
氧气0.0270 (9)0.0237 (9)0.0303 (10)0.0020 (8)0.0022 (8)0.0017 (8)
臭氧0.0246(9)0.0272(10)0.0285 (9)0.0015 (8)0.0031 (7)0.0033 (8)
O4号机组0.0255 (9)0.0383 (10)0.0432 (10)0.0059 (11)0.0014 (9)0.0096 (9)
O5公司0.0331 (10)0.0326(10)0.0341 (10)0.0102 (10)0.0081 (10)0.0126 (8)
几何参数(λ,º) 顶部
二氧化碳-O52.0384 (17)C5-H5A型0.930
二氧化碳-N12.057 (2)C6-N3型1.354 (3)
二氧化碳-N42.068 (2)C6-C10型1.359 (4)
钴-O32.0687 (17)C6-H6A型0.930
二氧化碳2.0723 (18)C7-C91.362 (4)
二氧化碳-N32.104 (2)C7-N3号机组1.364 (3)
C1-O1型1.227 (3)C7-H7A型0.930
C1-O2型1.270 (3)C8-O4型1.226 (3)
C1-C2类1.550 (4)C8-O31.274 (3)
C2-N1型1.357 (3)C8-C9型1.550(3)
C2-C3型1.371 (4)C9-N41.339(3)
C3-N2型1.357 (4)C10-N4号机组1.366 (3)
C3-H3A型0.930C10-H10A型0.930
C4-N2型1.346(4)N3-Co1号机组ii(ii)2.104 (2)
C4-C5型1.371 (4)O5-H51型0.82(1)
C4-H4A型0.930O5-H52型0.82 (1)
C5-N1型1.352 (3)
O5-Co1-N186.63 (8)编号3-C6-C10120.4 (2)
O5-Co1-N493.02 (8)N3-C6-H6A型119.8
N1-Co1-N4型176.88 (9)C10-C6-H6A型119.8
O5-Co1-O390.59 (8)C9-C7-N3型121.7 (2)
N1-Co1-O3型94.56 (8)C9-C7-H7A119.1
N4-Co1-O382.34 (7)N3-C7-H7A型119.1
O5-Co1-O286.35 (8)O4-C8-O3124.6 (2)
N1-Co1-O282.42 (8)O4-C8-C9122.3(2)
N4-Co1-O2100.65(8)O3至C8至C9113.1 (2)
O3-Co1-O2175.81 (7)N4-C9-C7119.1 (2)
O5-Co1-N3176.49 (9)N4-C9-C8型120.1 (2)
N1-Co1-N3型93.15 (8)C7-C9-C8号120.8 (2)
N4-Co1-N3型87.39 (8)C6-C10-N4型120.2 (2)
O3-Co1-N392.92 (8)C6-C10-H10A119.9
O2-Co1-N390.15 (8)N4-C10-H10A型119.9
O1-C1-O2125.0 (3)C5-N1-C2119.7 (2)
O1-C1-C2型121.0 (2)C5-N1-Co1130.57 (18)
氧气-C1-C2113.9 (2)C2-N1-Co1型109.32 (17)
N1-C2-C3型118.8 (2)C4-N2-C3118.3 (2)
N1-C2-C1型118.9 (2)C6-N3-C7118.3 (2)
C3-C2-C1122.3(2)C6-N3-Co1ii(ii)122.25(17)
N2-C3-C2气体122.0 (3)C7-N3-Co1号机组ii(ii)119.24 (16)
N2-C3-H3A气体119C9-N4-C10120.2 (2)
C2-C3-H3A型119C9-N4-Co1型108.97(16)
N2-C4-C5气体120.6 (3)C10-N4-Co1型130.79 (17)
N2-C4-H4A气体119.7C1-O2-Co1型115.09 (16)
C5-C4-H4A119.7C8-O3-Co1115.28 (15)
N1-C5-C4120.6 (3)钴-O5-H51122.1 (19)
N1-C5-H5A型119.7钴-O5-H52125 (2)
C4-C5-H5A型119.7H51-O5-H52型111.4 (17)
O1-C1-C2-N1型177.0 (2)C10-C6-N3-C72.7 (4)
O2-C1-C2-N1型4.0 (3)C10-C6-N3-Co1型ii(ii)172.10 (19)
O1-C1-C2-C34.1 (4)C9-C7-N3-C63.8 (4)
O2-C1-C2-C3174.8 (2)C9-C7-N3-Co1ii(ii)171.17 (18)
N1-C2-C3-N20.0 (4)C7-C9-N4-C100.3 (4)
C1-C2-C3-N2178.9 (3)C8-C9-N4-C10179.3 (2)
N2-C4-C5-N1型0.1 (4)C7-C9-N4-Co1型176.90 (18)
N3-C7-C9-N42.3(4)C8-C9-N4-Co1型2.1 (3)
N3-C7-C9-C8176.6 (2)C6-C10-N4-C91.3 (4)
O4-C8-C9-N4174.9 (2)C6-C10-N4-Co1型175.16 (18)
O3-C8-C9-N44.9 (3)O5-Co1-N4-C989.80 (17)
O4-C8-C9-C76.2 (4)O3-Co1-N4-C90.39 (16)
O3-C8-C9-C7174.1 (2)O2-Co1-N4-C9176.64 (16)
编号3-C6-C10-N40.2 (4)N3号机组-钴-N4-C993.69 (16)
C4-C5-N1-C2型1.3 (4)O5-Co1-N4-C1093.4 (2)
C4-C5-N1-Co1型170.45 (19)O3-Co1-N4-C10176.4 (2)
C3-C2-N1-C5型1.3 (4)O2-Co1-N4-C106.6 (2)
C1-C2-N1-C5179.9 (2)N3号机组-钴-N4-C1083.1 (2)
C3-C2-N1-Co1型172.1(2)O1-C1-O2-Co1型177.7(2)
C1-C2-N1-Co1型6.8 (3)C2-C1-O2-Co1型1.2 (3)
O5-Co1-N1-C591.2 (2)O5-Co1-O2-C183.30(18)
O3-Co1-N1-C50.9 (2)N1-Co1-O2-C13.78 (18)
O2-Co1-N1-C5178.0 (2)N4-Co1-O2-C1175.68 (18)
N3号机组-钴-N1-C592.3 (2)N3号机组-二氧化碳-O2-C196.94 (18)
O5-Co1-N1-C281.21 (17)O4-C8-O3-Co1174.82 (19)
O3-Co1-N1-C2171.53 (16)C9-C8-O3-Co14.9 (3)
O2-Co1-N1-C25.55 (16)O5-Co1-O3-C889.72 (18)
N3号机组-二氧化碳-N1-C295.29 (16)N1-Co1-O3-C8176.38 (17)
C5-C4-N2-C31.1 (5)N4-Co1-O3-C83.24(17)
C2-C3-N2-C4型1.2 (4)N3号机组-辅酶1-O3-C890.22 (18)
对称代码:(i)x个+1,+1/2,z+1/2;(ii)x个+1,1/2,z+1/2。
氢键几何形状(λ,º) 顶部
D类-H(H)···一个D类-H(H)H(H)···一个D类···一个D类-H(H)···一个
O5-H52··O20.82 (1)1.88 (1)2.697 (3)172 (3)
O5-H51···O30.82 (1)2.00 (1)2.814 (3)172 (3)
对称代码:(iii)x个1/2,+1/2,z+1; (iv)x个+1/2,+1/2,z+1.

实验细节

水晶数据
化学配方[公司(C)5H(H)N个2O(运行)2)2(H)2O) ]
M(M)323.13
晶体系统,空间组正交各向异性,P(P)212121
温度(K)298
b条c(c)(Å)8.0121 (10), 9.5327 (10), 15.023 (2)
V(V))1147.4 (2)
Z轴4
辐射类型K(K)α
µ(毫米1)1.52
晶体尺寸(mm)0.10 × 0.10 × 0.10
数据收集
衍射仪布吕克智能CCD区域探测器
吸收校正
测量、独立和
观察到的[> 2σ()]反射
5916, 2198, 2064
R(右)整数0.026
(罪θ/λ)最大值1)0.617
精炼
R(右)[F类2> 2σ(F类2)],水风险(F类2),S公司0.024, 0.055, 1.04
反射次数2198
参数数量190
约束装置数量
氢原子处理用独立和约束精化的混合物处理H原子
Δρ最大值,Δρ最小值(eó))0.80,0.22
绝对结构Flack(1983),与907对Friedel配对
绝对结构参数0.452 (15)

计算机程序:智能(布鲁克,2001),圣普卢斯(布鲁克,2001),圣普卢斯架子97(谢尔德里克,1997),SHELXL97型(谢尔德里克,1997),SHELXTL公司(布鲁克,2001),SHELXTL公司.

氢键几何形状(λ,º) 顶部
D类-H(H)···一个D类-H(H)H(H)···一个D类···一个D类-H(H)···一个
O5-H52··O20.82 (1)1.88 (1)2.697 (3)172 (3)
O5-H51···O3ii(ii)0.82 (1)2.00 (1)2.814 (3)172 (3)
对称代码:(i)x个1/2,+1/2,z+1; (ii)x个+1/2,+1/2,z+1.
 

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