系统发生树的根推断

系统发生树可以通过许多标准生根。在这里，我们介绍了一种贝叶斯方法，通过使用以下几个标准之一推断系统发生树的根：外群、分子时钟和DNA替代的不可逆模型。我们进行模拟分析，以检查这三个标准正确识别树根的相对能力。外群和分子时钟标准最能识别树根，而不可逆模型只能在替换过程高度不可逆时识别树根。我们还检查了拓扑结构和根位置得到很好支持的四个物种的树的标准的性能。这些数据的分析结果与仿真结果一致。