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gi|46452254|gb|AY585334.1|Sus scrofa囊性纤维化跨膜电导调节器 (CFTR)mRNA,完整cds 长度=4449 分数=5453位(2751),期望值=0.0 同一性=4036/4449(90%),差距=6/4449(0%) 绞线=正/正 CDS:假设11 M Q R S P L E K A S V S K L F S W T 查询 133 ATGCAGAGGGTCGCCTGGAAAAGGCCAGCGTTGTCTCCAAACnnnnnCAGCTGGACC 192 |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 ATGCAGGTCGCGCTCTGGAAGCCAGCATTCCAAACTTTTTCAGCTGGACC 60号 CDS:囊性纤维化1 M Q R S P L E K A S 我 F S K L F S W T系列 CDS:假设1 21 R P I L R K G Y R Q R L E L S D I Y Q I 查询193 AGACAATTGAGGAGACAGACAGCGCGCGCGTCAGATACACAATC 252 |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 61 AGACAATTTTGAGAAAGAGATAGACAGCGCGTGAATGTCAGATACATACATC 120号 CDS:囊性纤维化21 R P I L R K G Y R Q R L E L S D Y 小时 我 CDS:假设1 41 P S V D S A D N L S E K L E R E W D R E 查询253 CCTTCTGTATTCTGACAATCTATCTGAAAAAATTGGAAGAGAGAGAATGGAGAG 312 ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 121 TCTTCTTCTGACTCTCTGACTGACAATCTGTGGAAAAATTGGAAGAGAGAGAAAGAGAA180号 CDS:囊性纤维化41 S公司 S公司 S公司 数据A D N L S E K L E R E W D R E
掩蔽 ¶
掩蔽字符 X或N 在X中显示蛋白质的屏蔽区域,在N中显示核苷酸的屏蔽区域。 小写 以小写字母显示标记区域。
遮罩颜色 屏蔽区域可以用灰色或红色字体“突出显示”。
说明 ¶
路线视图 ¶
成对 数据库对齐显示为查询和主题序列之间的匹配对。 查询和主题序列之间的中间线显示信件的状态。 对于蛋白质 对齐(例如,BLASTP/BLASTX/TBLASTN)、标识表示字母、保守替换 表示“+”,其他什么都不表示。 对于核苷酸比对(例如BLASTN和megaBLAST),使用“|” 显示匹配项,不显示不匹配项。 这是默认视图。 与点成对标识 数据库对齐以成对方式锚定(相对于)到查询序列 用红色表示不匹配。 上海捷运 将以红色和粗体显示 如果对齐中的一行包含不匹配项,则使用字体。 请参见 例子 如下所示。 用点查询身份 标识显示为点(.),不匹配显示为单个字母 缩写。 使用字母查询身份 标识显示为单字母核苷酸缩写。 平面查询-用点标记身份 “平面”显示在查询中将插入显示为删除。 标识显示为点(.), 不匹配显示为单字母缩写。 平面查询-用字母标记身份 “平面”显示在查询中将插入显示为删除。 标识显示为单字母缩写。
gi|21536448|参考|NM_002622.3| 智人预折叠蛋白1(PFDN1),mRNA 长度=1296 分数=392位(212),期望值=2e-107 身份=220/223(98%),差距=3/223(1%) 绞线=正/正 查询107 TCCTACCTTGGAGCGAAG-GTTANAGGAAGCGTGAGGAACATCCGGGAGTGTGGATGGC 165 上海捷运 300 ................. C类 .... - ..................................... 358 查询166 ACGAAGGG-CCAGTAGGGCCTCTGGGAGCTTCCTCCTGCCCCCCATTCG 224 上海捷运 359 ........ C类 ................................................... 418 查询225 GTGGGGGCAGGAGTGTGTGCCAGGGAACGCTTCTCCTCTGCCGATGGATGCTTA 284 Sbjct 419。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。 478 查询285 TTTGGATGGCGCAACATCACATTTCTGCATCACCCTGAG 327 Sbjct 479。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。 521