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引用CPTAC分析门户时,请包括以下声明
我们感谢美国国家癌症研究所临床蛋白质组肿瘤分析联盟(CPTAC)分析门户网站(assesss.Cancer.gov)用于开发分析并建立本出版物中所述分析的标准。

概述数据来源:UniProt

官方基因符号 其他别名
第二层 Bek,Ect1公司
序列长度(AA) 分子量(Da)
821 91984
蛋白质名称
成纤维细胞生长因子受体2
来源
UniProt公司
磷化SitePlus®
基因卡
人类蛋白质阿特拉斯

蛋白质序列悬停以查看完整序列

10 20 30 40 50
MVSWGRFICL公司 VLVTMATLSL公司 ARPSFSSLVED公司 TTLEPEEPPT公司 凯奇斯佩
60 70 80 90 100
VVAPGESLEL公司 QCMLKDAAVI公司 SWTKDGVHLG公司 PNNRTVLIGE系列 YLQIKGATPR公司
110 120 130 140 150
DSGLYACTAA公司 RTVD设置WIF MVNVTDAIS公司 GDDEDDTDSS系统 EDVVSENRSN公司
160 170 180 190 200
QRAPYWTNTE公司 KMEKRLHACP公司 AANTVKFRCP公司 AGGNPTSTMR公司 WLKNGKEFKQ公司
210 220 230 240 250
EHRIGYKVR公司 NQHWSLIMES公司 VVPSDKGNYT公司 CLVENEYGSI公司 NHTYHLDVVE公司
260 270 280 290 300
RSPHRPILQA公司 GLPANASTVV公司 GGDVEFVCKV YSDAQPHIQW公司 IKHVEKNGSK公司
310 320 330 340 350
N个G公司D类G公司L(左)Y(Y)L(左)K(K) VLKAAGVNTT公司 DKEIEVLYIR公司 无发票发票 TCLAGNSIGI公司
360 370 380 390 400
SFHSAWLTVL公司 帕夫雷基特 ASPDYLEAI公司 YCIGVFLIAC公司 MVVTVIFCRM公司
410 420 430 440 450
KTTTKK公司D类F类S公司 S公司A类V(V)H(H)K(K)LTK公司 RIPLRRQVTV型 SAESSSMNS公司 NTPLVRITTR公司
460 470 480 490 500
LSSTADTPML公司 AGVSEYELPE公司 DPKWEFPRDK公司 LTLGKPLGEG公司 CFGQVVMAEA公司
510 520 530 540 550
VGIDKDKPKE公司 AVTVAVKMLK DDATEKDLSD公司 LVSEMEMMKM公司 IGKHKNIINL公司
560 570 580 590 600
LGACTQDGPL公司 伊维维亚斯克 NLREYLRAR公司 PPGMEYSYDI公司 NRVPEEQMTF公司
610 620 630 640 650
KDLVSCTYQL ARGMEYLASQ公司 KCIHRDLAAR公司 NVLVTENVM公司 基亚德福拉德
660 670 680 690 700
INNIDYKKT公司 TNGRLPVKWM公司 APEALFDRVY公司 THQSDVWSFG公司 VLMWEIFTLG公司
710 720 730 740 750
GSPYPGIPVE公司 ELFKLLKEGH公司 RMDKPTNCTN公司 ELYMMMRDCW公司 HAVPSQR项目
760 770 780 790 800
昆士兰维德德里 LTLTTNEEYL公司 DLTQPLEQYS公司 PSYPDTSSC公司 SSGDDSVFSP软件
810 820 821
DPMPYEPCLP公司 QYPHINGSVK公司 T型

数据来源:UniProt


蛋白质图谱 折叠蛋白图

靶向肽分析物相对于SNP、异构体和PTM的位置

Uniprot公司数据库登录 磷网站+®

单击节点上的点
查看下面的详细化验信息
所有其他点链接到 UniProt公司



磷酸化 乙酰化 泛素化 其他

加载

装载机

非CPTAC-3806的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
第二层
顺序
PDFSSQPAVHK公司
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽开始
407
肽末端
417
CPTAC标识
非CPTAC-3806
肽分子质量
1,211.5935
物种
穆斯 肌肉 (鼠标)
分析类型
直接MRM
矩阵
等离子
提交实验室
UVic-Genome BC蛋白质组学中心
提交实验室PI
克里斯托夫·博切尔斯

出版物

查看详细信息 (在新窗口中打开)

使用500多反应监测质谱血浆分析对实验室小鼠菌株进行分子表型分析。Michaud SA、Sinclair NJ、PetrošováH、Palmer AL、Pistawka AJ、Zhang S、Hardie DB、Mohammed Y Eshghi A1、Richard VR、Sickmann A、Borchers CH.Commun Biol。2018年6月27日;1分78秒。doi:10.1038/s42003-018-0087-6。2018年eCollection。


分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
安捷伦6490/6495 QQQ
内部标准
合成肽
肽标准纯度
>80%
肽标准标签类型
C端子K处的13C和15N
液晶显示器
1290 LC(安捷伦)
色谱柱填料
Zorbax Eclipse Plus C18,1.8µm
立柱尺寸
2.1 x 150毫米
流速
400µL/min

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
b3(1+) 12 15.4 15 13.9 15.7 14.6 18.4 22 20.9 15 15 15
b2(1+) 8 5.5 5.5 10.1 11.5 9.2 12.9 12.7 10.7 15 15 15
y5(2+) 10.5 5.4 11.2 19.3 13.2 14.4 22 14.3 18.2 15 15 15
y2(1+) 12.2 11.1 10.7 8.3 11.9 13 14.8 16.3 16.8 15 15 15
y5(1+) 8.7 5.9 6.7 9 7.6 6 12.5 9.6 9 15 15 15
总和 3.2 3.2 4.3 6.5 6.4 4.9 7.2 7.2 6.5 15 15 15


其他资源和评论

评论

CPTAC-3175的含量测定细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
FGFR2型
顺序
YGPDGLPYLK公司
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽开始
301
肽末端
310
CPTAC标识
CPTAC-3175型
肽分子质量
1,121.5757
物种
人类 智者
分析类型
直接MRM
矩阵
肿瘤消化
提交实验室
圣路易斯华盛顿大学
提交实验室PI
里德·汤森

分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
赛默飞世尔,Q-Exactive
内部标准
柱上25 fmol
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
C端子K处的13C和15N
液晶显示器
Easy-nLC 1000 Thermo Scientific公司
色谱柱填料
第18号
立柱尺寸
75微米x 50厘米
流速
300 nL/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
y4(1+) 10.5 13.7 7.9 17.8 12.9 12 20.7 18.8 14.4 15 15 15
7岁(1+) 10.9 12.5 7.6 17.4 12.2 11.4 20.5 17.5 13.7 15 15 15
y6(1+) 9.6 12.3 9.3 17.6 11.7 12.5 20 17 15.6 15 15 15
总和 10.2 12.9 8 17.4 12.3 11.9 20.2 17.8 14.3 15 15 15


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