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引用CPTAC化验门户时,请包括以下声明
我们感谢美国国家癌症研究所临床蛋白质组肿瘤分析联盟(CPTAC)分析门户网站(assesss.Cancer.gov)用于开发分析并建立本出版物中所述分析的标准。

概述数据来源:UniProt

官方基因符号 其他别名
编号1 非注册会计师
序列长度(AA) 分子量(Da)
923 103000
蛋白质名称
神经毛蛋白-1
来源
UniProt公司
磷化SitePlus®
基因卡
人类蛋白质阿特拉斯

蛋白质序列悬停以查看完整序列

10 20 30 40 50
MERGLPLLCA公司 TLALALAG公司 AFRSDKCGGT公司 IKIENPGYLT公司 SPGYPHSYHP公司
60 70 80 90 100
SEKCEWLIQA公司 吡喹啉 FNPHFDLEDR公司 DCKYDYVEVI公司 DGENEGRLW公司
110 120 130 140 150
GKFCGK公司一个P(P)S公司 P(P)S公司S公司G公司P(P)F类L(左)F类 K(K)FVSDYETH公司 GAGFSIRYEI公司 FKRGPECSQN公司
160 170 180 190 200
YTAPTGVIKS公司 PGFPEKYPNS公司 LECTYIIFAP公司 哈萨克斯坦 SFDLEQDSNP公司
210 220 230 240 250
PGGMFCRYDR公司 LEIWDGFPEV公司 GPHIGRYCGQ公司 KTPGRIRSS公司 gvlsvfytd公司
260 270 280 290 300
SAIAKEGFSA公司 眼球痉挛 EDFKCMEALG公司 MESGEIHSDQ信息 ITASSQYGTN公司
310 320 330 340 350
WSVERSRLNY公司 彭格沃德 SYKEWIQVDL公司 GLLRFVTAVG(GLLRFV平均值) TQGAISKETK公司
360 370 380 390 400
KKYYVKTYRV公司 DISSNGEDWI公司 SLKEGNKAII公司 FQGNTNPTDV公司 VLGVFSKPLI公司
410 420 430 440 450
TRFVRIKPVS公司 WETGISMRFE公司 VYGCKITDYP公司 CSGMLGMVSG公司 利斯奇塔斯
460 470 480 490 500
NQADRNWMPE公司 NIRLVTSRTG公司 步行球 TNEWLQVDLG公司 DEKIVRGVII公司
510 520 530 540 550
克格赫伦千伏 FMRKFKIAYS公司 NNGSDWKTIM公司 DDSKRKAK公司S公司F类 E类G公司N个N个N个Y(Y)T型P(P)E类
560 570 580 590 600
L(左)R(右)TFSPLSTR公司 消防队员 HSGLGLRMEL公司 LGCEVEAPTA公司 GPTTPNGNPV公司
610 620 630 640 650
DECDDDQANC公司 HSGTGDDFQL语言 TGGTTVLATE公司 KPTIIDSTIQ公司 SEFPTYGFNC公司
660 670 680 690 700
EFGWGSHKTF公司 CHWEHDSHAQ公司 LRWSVLTSKT公司 GPIQDHTGDG公司 NFIYSQADEN公司
710 720 730 740 750
QKGKVARLVS公司 PVVYSQSSAH公司 CMTFWYHMSG公司 SHVGTLRVKL公司 RYQKPEEYDQ公司
760 770 780 790 800
LVWMVVHHQG公司 DHWKEGRVLL公司 HKSLKLYQVI公司 FEGEIGKGNL公司 GGIAVDDIS公司
810 820 830 840 850
NNHISQEDCA公司 KPTDLDKKNT公司 EIKIDETGST公司 PGYEGEGEGD公司 KNISRKPGNV公司
860 870 880 890 900
LKTLDPILIT公司 国际AMSALGVL LGAVCGVVLY公司 CACWHNGMSE公司 RNLSALENYN公司
910 920 923
FELVDGVKLK公司 KDKLNPQSNY公司 东南亚

数据来源:UniProt


蛋白质图谱 折叠蛋白图

靶向肽分析物相对于SNP、异构体和PTM的位置

Uniprot公司数据库登录 磷网站+®

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查看下面的详细分析信息
所有其他点链接到 UniProt公司



磷酸化 乙酰化作用 泛素化 其他

装载

装载机

非CPTAC-3661的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
编号1
顺序
IAPSPVVSSGPFLFIK
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽开始
107
肽末端
122
CPTAC标识
非CPTAC-3661
肽分子质量
1,657.9443
物种
Mus公司 肌肉 (鼠标)
分析类型
直接MRM
矩阵
等离子
提交实验室
UVic-Genome BC蛋白质组学中心
提交实验室PI
克里斯托夫·博切尔斯

分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
安捷伦6490/6495 QQQ
内部标准
合成肽
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
C末端K处的13C和15N
信用证
1290 LC(安捷伦)
色谱柱填料
Zorbax Eclipse Plus C18,1.8µm
立柱尺寸
2.1 x 150毫米
流速
400微升/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间简历)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
y12(2+) 10 13 9.6 19.1 15 14.4 21.6 19.8 17.3 15 15 15
y14(2+) 6 5.8 4.1 15.7 9.8 7.4 16.8 11.4 8.5 15 15 15
y15(2+) 23.9 25.9 14.1 35.6 33.1 23.7 42.9 42 27.6 15 15 15
9岁(1+) 11.4 12.2 7.9 19.6 13.4 10.6 22.7 18.1 13.2 15 15 15
y10(1+) 28.3 23.9 15.4 34.5 27.9 21.8 44.6 36.7 26.7 15 15 15
总和 3.9 6.5 4 14.2 8.9 6.9 14.7 11 8 15 15 15


其他资源和评论


非CPTAC-3597的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
编号1
顺序
SFEGNNNYDTPELR公司
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽开始
539
肽末端
552
CPTAC标识
非CPTAC-3597
肽分子质量
1,654.7223
物种
Mus公司 肌肉 (鼠标)
分析类型
直接MRM
矩阵
等离子
提交实验室
UVic-Genome BC蛋白质组学中心
提交实验室PI
克里斯托夫·博切尔斯

出版物

查看详细信息 (在新窗口中打开)

使用500多反应监测质谱血浆分析对实验室小鼠菌株进行分子表型分析。Michaud SA、Sinclair NJ、PetrošováH、Palmer AL、Pistawka AJ、Zhang S、Hardie DB、Mohammed Y Eshghi A1、Richard VR、Sickmann A、Borchers CH.Commun Biol。2018年6月27日;1:78. doi:10.1038/s42003-018-0087-6。2018年eCollection。


分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
安捷伦6490/6495 QQQ
内部标准
合成肽
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
C端子R处的13C和15N
信用证
1290 LC(安捷伦)
色谱柱填料
Zorbax Eclipse Plus C18,1.8µm
立柱尺寸
2.1 x 150毫米
流速
400微升/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间简历)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
b2(1+) 10.7 11.8 9.9 12.7 10.9 9.1 16.6 16.1 13.4 15 15 15
y2(1+) 9.4 11.2 13 10.6 15 15.2 14.2 18.7 20 15 15 15
y4(1+) 10.3 9.1 5 12.6 11 10.4 16.3 14.3 11.5 15 15 15
y5(1+) 14.9 5.2 9.9 18 6.7 9.7 23.4 8.5 13.9 15 15 15
y6(1+) 11.4 10.9 9 13.9 9.2 12 18 14.3 15 15 15 15
总和 5.7 5.2 5.2 8.3 6.8 7.6 10.1 8.6 9.2 15 15 15


其他资源和评论