显示导航
引用CPTAC分析门户时,请包括以下声明
我们要感谢美国国家癌症研究所的临床蛋白质组肿瘤分析联盟(CPTAC)检测门户网站(assays.cance.gov)用于开发分析并建立本出版物中所述分析的标准。

概述数据来源:UniProt

官方基因符号 其他别名
Igfbp3 Igfbp-3
序列长度(AA) 分子量(Da)
292 31687
蛋白质名称
胰岛素样生长因子结合蛋白3
来源
UniProt公司
PhosphoSitePlus®
基因卡
人类蛋白质阿特拉斯

蛋白质序列悬停以查看完整序列

10 20 30 40 50
MHPARPALWA公司 AALTALTLLR公司 GPPVARAGAG公司 AVGAGPVVRC公司 EPCDARALSQ公司
60 70 80 90 100
CAPPPTAPAC公司 TELVREPGCG公司 CCLTCALREG公司 DACGVYTERC公司 GTGLRCQPRP公司
110 120 130 140 150
AEQYPLRALL公司 NGRGFCANAS公司 AAGSLSTYLP公司 方格纸 SEEEHNAGSV公司
160 170 180 190 200
ESQVVPSTHR系统 VTDSK公司F类H(H)P(P)L(左)H(H) A类K(K)MDVIKGH公司 ARDSQRYKVD公司 YESQSTDTQN公司
210 220 230 240 250
FSSESKRETE公司 YGPCRREMED公司 TLNHLKFLNV公司 LSPRGVHIPN公司 CDKKGFYKKK公司
260 270 280 290 292
QCRPSKGRKR公司 GFCWCVDKYG公司 QPLPGYDTKG公司 KDDVHCLSVQ公司 SQ公司

数据来源:UniProt


蛋白质图谱 折叠蛋白图

靶向肽分析物相对于SNP、异构体和PTM的位置

Uniprot公司数据库登录 磷网站+®

单击节点上的点
查看下面的详细分析信息
所有其他点链接到 UniProt公司



磷酸化 乙酰化 泛素化 其他

加载

装载机

非CPTAC-3300的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
Igfbp3
序列
FHPLHAK公司
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽开始
166
肽末端
172
CPTAC标识
非CPTAC-3300
肽分子质量
848.4657
物种
穆斯 肌肉 (鼠标)
分析类型
直接MRM
矩阵
等离子体
提交实验室
UVic-Genome BC蛋白质组学中心
提交实验室PI
克里斯托夫·博切尔斯

出版物

查看详细信息 (在新窗口中打开)

使用500多反应监测质谱血浆分析对实验室小鼠菌株进行分子表型分析。Michaud SA、Sinclair NJ、PetrošováH、Palmer AL、Pistawka AJ、Zhang S、Hardie DB、Mohammed Y Eshghi A1、Richard VR、Sickmann A、Borchers CH.Commun Biol。2018年6月27日;1分78秒。doi:10.1038/s42003-018-0087-6。2018年eCollection。


分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
安捷伦6490/6495 QQQ
内部标准
合成肽
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
C端子K处的13C和15N
液晶显示器
1290 LC(安捷伦)
色谱柱填料
Zorbax Eclipse Plus C18,1.8µm
立柱尺寸
2.1 x 150毫米
流速
400微升/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均批间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
y4(1+) 11.7 11.1 13.3 22.9 28.3 12.6 25.7 30.4 18.3 15 15 15
y6(2+) 15.6 8.7 7.2 15.8 10.9 8.9 22.2 13.9 11.4 15 15 15
b2(1+) 12.5 11.5 11.5 15.1 13.2 13.2 19.6 17.5 17.5 15 15 15
b6(3+) 12 10.9 15 15.3 22.3 26.8 19.4 24.8 30.7 15 15 15
y2(1+) 7.9 9.6 14 16.5 13.2 13.5 18.3 16.3 19.4 15 15 15
总和 5.9 5 5.2 10.9 9.5 7.3 12.4 10.7 9 15 15 15


其他资源和评论

评论