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在引用CPTAC分析门户时,请包括以下声明
我们感谢美国国家癌症研究所临床蛋白质组肿瘤分析联盟(CPTAC)分析门户网站(assesss.Cancer.gov)用于开发分析并建立本出版物中所述分析的标准。

概述数据来源:UniProt

官方基因符号 其他别名
地图1 ERK2、PRKM1、PRKM2
序列长度(AA) 分子量(Da)
360 41390
蛋白质名称
有丝分裂原活化蛋白激酶1
来源
UniProt公司
磷化SitePlus®
基因卡
人类蛋白质阿特拉斯

蛋白质序列悬停以查看完整序列

10 20 30 40 50
M(M)A类A类A类A类A类A类G公司A类G公司 P(P)E类M(M)V(V)R(右)GQVFD公司 VGPRYTNLSY公司 IGEGAYGMVC公司 SAYDNVNKVR公司
60 70 80 90 100
瓦基斯菲 HQTYCQRTLR公司 EIKILLRFRH公司 埃尼印第 RAPTIEQMKD公司
110 120 130 140 150
VYIVQDLMET公司 DLYKLLKTQH公司 LSNDHICYFL公司 伊奇拉尔基 HSANVLHRDL公司
160 170 180 190 200
KPSNLLLNTT公司 CDLKICDFGL公司 应收账V(V)A类D类P(P)D类H(H)D类H(H) T型G公司F类L(左)T型E类Y(Y)V(V)A类T型 R(右)WYRAPEIML公司
210 220 230 240 250
NSKGYTKSID公司 IWSVGCILAE公司 MLSNRPIFPG公司 KHYLDQLNHI公司 LGILGSPSQE公司
260 270 280 290 300
DLNCINLKA公司 RNYLLSLPHK公司 NKVPWNRLFP公司 NADSKALDLL公司 丹麦MLTFNPHK
310 320 330 340 350
里韦卡拉 PYLEQYYDPS公司 DEPIAEAPFK公司 FDMELDDLPK公司 EKLK公司E类L(左)F类E类E类
360
T型A类R(右)FQPGYRS年度

数据来源:UniProt


蛋白质图谱 折叠蛋白图

靶向肽分析物相对于SNP、异构体和PTM的位置

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查看下面的详细分析信息
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磷酸化 乙酰化 泛素化 其他

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装载机

CPTAC-1352的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
地图1
肽修饰顺序
VADPDHDHTGFLT[+80.0]EY[+80.0]VATR公司
修改类型
磷(ST)、磷(Y)
蛋白质-修饰位点
185187年
肽-修饰位点
13, 15
肽开始
173
肽末端
191
CPTAC标识
CPTAC-1352型
肽分子质量
2,302.9297
物种
人类 智者 (人类)
分析类型
浓缩PRM
富集方法
不适用
矩阵
消化细胞裂解物
提交实验室
布罗德学院
提交实验室PI
史蒂文·卡尔

出版物

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分子细胞蛋白质组学。2016年5月;15(5):1622-41。doi:10.1074/mcp。M116.058354。Epub 2016年2月24日。通过定量靶向MS捕获细胞状态测量的减少代表性磷酸化,并实现药物诱导表型的大规模比较。Abelin JG1、Patel J1、Lu X1、Feeney CM1、Fagbami L1、Creech AL1、Hu R1、Lam D1、Davison D1、Pino L1、Qiao JW1、Kuhn E1、官员A1、Li J2、Abbatiello S1、Subramanian A1、Sidman R2、Snyder E3、Carr SA1、Jaffe JD4。

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分子细胞蛋白质组学。2014年7月;13(7):1690-704. doi:10.1074/mcp。M113.036392。Epub 2014年4月9日。肿瘤缺血诱导应激激酶途径中早期持续的磷酸化改变,但不影响整体蛋白水平。Mertins P1、Yang F2、Liu T2、Mani DR3、Petyuk VA2、Gillette MA3、Clauser KR3、Chao JW3、Gritsenko MA2、Moore RJ2、Levine DA4、Townsend R5、Erdmann-Gilmore P5、Snider JE5、Davies SR5、Ruggles KV6、Fenyo D6、Kitchens RT5、Li S5、Olvera N4、Dao F4、Rodriguez H7、Chan DW8、Liebler D9、White F10、Rodland KD2、Mills GB11、Smith RD2、Paulovich AG 12、,埃利斯M5,卡尔SA1


分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
匡提瓦
内部标准
光稳定同位素肽
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
C端子R处的13C和15N
信用证
简易NanoLC1000
色谱柱填料
阻垢剂C18,1.9um,200A
立柱尺寸
0.075 x 150毫米
流速
200 nL/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片离子/过渡 医学 医学 医学 医学
y16-98(2+) 7.6 5.7 7.5 14.2 10.5 10.4 16.1 11.9 12.8 15 15 15
y5(1+) 5.2 5 6.4 7.6 10.6 11 9.2 11.7 12.7 15 15 15
7-98岁(1+) 6.3 4.6 6.2 9.4 5.3 8.8 10.5 6.1 15 15 15
总和 5 3.8 3.9 5.6 9.3 7.6 7.5 10 8.5 15 15 15


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CPTAC-1353的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
地图1
肽修饰顺序
VADPDHDHTGFLT[+80.0]护目镜
修改类型
磷(ST)
蛋白质-修饰位点
185
肽-修饰位点
13
肽开始
173
肽末端
191
CPTAC标识
CPTAC-1353型
肽分子质量
2,222.9634
物种
人类 智者 (人类)
分析类型
浓缩PRM
富集方法
不适用
矩阵
消化的细胞裂解物
提交实验室
布罗德学院
提交实验室PI
史蒂文·卡尔

出版物

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分子细胞蛋白质组学。2016年5月;15(5):1622-41. doi:10.1074/mcp。M116.058354。Epub 2016年2月24日。通过定量靶向MS捕获细胞状态测量的减少代表性磷酸化,并实现药物诱导表型的大规模比较。Abelin JG1、Patel J1、Lu X1、Feeney CM1、Fagbami L1、Creech AL1、Hu R1、Lam D1、Davison D1、Pino L1、Qiao JW1、Kuhn E1、官员A1、Li J2、Abbatiello S1、Subramanian A1、Sidman R2、Snyder E3、Carr SA1、Jaffe JD4。

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分子细胞蛋白质组学。2014年7月;13(7):1690-704. doi:10.1074/mcp。M113.036392。Epub 2014年4月9日。肿瘤缺血诱导应激激酶途径中早期持续的磷酸化改变,但不影响整体蛋白水平。Mertins P1、Yang F2、Liu T2、Mani DR3、Petyuk VA2、Gillette MA3、Clauser KR3、Chao JW3、Gritsenko MA2、Moore RJ2、Levine DA4、Townsend R5、Erdmann-Gilmore P5、Snider JE5、Davies SR5、Ruggles KV6、Fenyo D6、Kitchens RT5、Li S5、Olvera N4、Dao F4、Rodriguez H7、Chan DW8、Liebler D9、White F10、Rodland KD2、Mills GB11、Smith RD2、Paulovich AG 12、,埃利斯M5,卡尔SA1


分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
匡提瓦
内部标准
光稳定同位素肽
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
C端子R处的13C和15N
信用证
Easy NanoLC1000
色谱柱填料
阻垢剂C18,1.9um,200A
立柱尺寸
0.075 x 150毫米
流速
200 nL/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
b11(1+) 29.4 16.5 23.7 24.3 16.6 25.8 38.1 23.4 35 12 13 13
y6(1+) 12.4 14 6.5 11.4 12.1 12.7 16.8 18.5 14.3 15 15 15
7-98岁(1+) 8.2 9.4 6.8 11.9 9.2 8.5 14.5 13.2 10.9 15 15 15
总和 7.7 8.8 6.2 9.9 9.3 9.3 12.5 12.8 11.2 15 15 15


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CPTAC-1354的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
地图1
肽修饰顺序
VADPDHDHTGFLTEY[+80.0]VATR公司
修改类型
磷(Y)
蛋白质-修饰位点
187
肽-修饰位点
15
肽起始
173
肽末端
191
CPTAC标识
CPTAC-1354型
肽分子质量
2,222.9634
物种
人类 智者 (人类)
分析类型
浓缩PRM
富集方法
不适用
矩阵
消化细胞裂解物
提交实验室
布罗德学院
提交实验室PI
史蒂文·卡尔

出版物

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分子细胞蛋白质组学。2016年5月;15(5):1622-41. doi:10.1074/mcp。M116.058354。Epub 2016年2月24日。通过定量靶向MS捕获细胞状态测量的减少代表性磷酸化,并实现药物诱导表型的大规模比较。Abelin JG1、Patel J1、Lu X1、Feeney CM1、Fagbami L1、Creech AL1、Hu R1、Lam D1、Davison D1、Pino L1、Qiao JW1、Kuhn E1、官员A1、Li J2、Abbatiello S1、Subramanian A1、Sidman R2、Snyder E3、Carr SA1、Jaffe JD4。

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分子细胞蛋白质组学。2014年7月;13(7):1690-704. doi:10.1074/mcp。M113.036392。Epub 2014年4月9日。肿瘤缺血诱导应激激酶途径中早期持续的磷酸化改变,但不影响整体蛋白水平。Mertins P1、Yang F2、Liu T2、Mani DR3、Petyuk VA2、Gillette MA3、Clauser KR3、Chao JW3、Gritsenko MA2、Moore RJ2、Levine DA4、Townsend R5、Erdmann-Gilmore P5、Snider JE5、Davies SR5、Ruggles KV6、Fenyo D6、Kitchens RT5、Li S5、Olvera N4、Dao F4、Rodriguez H7、Chan DW8、Liebler D9、White F10、Rodland KD2、Mills GB11、Smith RD2、Paulovich AG 12、,埃利斯M5,卡尔SA1


分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
匡提瓦
内部标准
光稳定同位素肽
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
C端子R处的13C和15N
信用证
Easy NanoLC1000
色谱柱填料
阻垢剂C18,1.9um,200A
立柱尺寸
0.075 x 150毫米
流速
200 nL/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
b11(2+) 8.3 5.7 6 8.5 9.1 10.3 11.9 10.7 11.9 15 15 15
y5(1+) 7.5 3.8 5.1 7.6 9.3 9.7 10.7 10 11 15 15 15
7岁(1+) 4.9 2.8 5.3 5.5 7.8 9.8 7.4 8.3 11.1 15 15 15
总和 5.5 2.7 4.8 6 8 9.7 8.1 8.4 10.8 15 15 15


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CPTAC-5809的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
地图1
肽修饰顺序
VADPDHDHTGFLT[+79.996331]电子增值税
修改类型
磷(ST)
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
肽开始
173
肽末端
191
CPTAC标识
CPTAC-5809型
肽分子质量
2,222.9634
物种
人类 智者 (人类)
分析类型
浓缩PRM
富集方法
不适用
矩阵
细胞裂解液
提交实验室
Fred Hutchinson癌症研究中心、H.Lee Moffitt癌症中心和研究所、Broad Institute
提交实验室PI
阿曼达·保罗维奇(Amanda Paulovich)、约翰·库门(John Koomen)、史蒂文·卡尔(Steven A.Carr)

出版物

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基于靶向质谱的分析能够对受体酪氨酸激酶、MAP激酶和AKT信号进行多重量化。Whiteaker JR、Sharma K、Hoffman MA、Kuhn E、Zhao L、Cocco AR、Schoenherr RM、Kennedy JJ、Voytovich U、Lin C、Fang B、Bowers K、Whiteley G、Colantonio S、Bocik W、Roberts R、Hiltke T、Boja E、Rodriguez H、McCormick F、Holderfield M、Carr SA、Koomen JM、Paulovich AG。细胞报告方法doi:10.1016/j.crmeth.2021.100015。


分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
SCIEX 5500/Thermo Quantiva公司
内部标准
稳定同位素标记标准
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
C端子R处的13C和15N
信用证
Dionex旗舰版3000
色谱柱填料
C18肽映射100
立柱尺寸
75微米ID x 25厘米长
流速
300 nL/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
y16(2+) 7.6 7.1 9.2 19.9 20.9 16.3 21.3 22.1 18.7 16 15 16
7岁(1+) 6.3 7.9 8.6 16.4 21.8 16.7 17.6 23.2 18.8 16 15 16
总和 6.5 7.5 8.3 17.7 21.4 15.7 18.9 22.7 17.8 16 15 16


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CPTAC-5810的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
地图1
肽修饰顺序
VADPDHDHTGFLTEY[+79.966331]增值税
修改类型
磷(Y)
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
肽开始
173
肽末端
191
CPTAC标识
CPTAC-5810型
肽分子质量
2,222.9634
物种
人类 智者 (人类)
分析类型
浓缩PRM
富集方法
不适用
矩阵
细胞裂解液
提交实验室
Fred Hutchinson癌症研究中心、H.Lee Moffitt癌症中心和研究所、Broad Institute
提交实验室PI
阿曼达·保罗维奇(Amanda Paulovich)、约翰·库门(John Koomen)、史蒂文·卡尔(Steven A.Carr)

出版物

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基于靶向质谱的分析能够对受体酪氨酸激酶、MAP激酶和AKT信号进行多重量化。Whiteaker JR、Sharma K、Hoffman MA、Kuhn E、Zhao L、Cocco AR、Schoenherr RM、Kennedy JJ、Voytovich U、Lin C、Fang B、Bowers K、Whiteley G、Colantonio S、Bocik W、Roberts R、Hiltke T、Boja E、Rodriguez H、McCormick F、Holderfield M、Carr SA、Koomen JM、Paulovich AG。细胞报告方法doi:10.1016/j.crmeth.2021.100015。


分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
SCIEX 5500/赛默Quantiva
内部标准
稳定同位素标记标准
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
C端子R处的13C和15N
信用证
Dionex旗舰版3000
色谱柱填料
C18肽映射100
立柱尺寸
75微米ID x 25厘米长
流速
300 nL/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均批内CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
7岁(1+) 6.3 7.9 8.6 16.4 21.8 16.7 17.6 23.2 18.8 16 15 16
y16(2+) 7.6 7.1 9.2 19.9 20.9 16.3 21.3 22.1 18.7 16 15 16
总和 6.5 7.5 8.3 17.7 21.4 15.7 18.9 22.7 17.8 16 15 16


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CPTAC-5811的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
地图1
顺序
VADPDHDHTGFLTEYVATR公司
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
肽开始
173
肽末端
191
CPTAC标识
CPTAC-5811型
肽分子质量
2,142.9970
物种
人类 智者 (人类)
化验类型
富集PRM
富集方法
不适用
矩阵
细胞裂解液
提交实验室
Fred Hutchinson癌症研究中心、H.Lee Moffitt癌症中心和研究所、Broad Institute
提交实验室PI
阿曼达·保罗维奇(Amanda Paulovich)、约翰·库门(John Koomen)、史蒂文·卡尔(Steven A.Carr)

出版物

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基于靶向质谱的分析能够对受体酪氨酸激酶、MAP激酶和AKT信号进行多重量化。Whiteaker JR、Sharma K、Hoffman MA、Kuhn E、Zhao L、Cocco AR、Schoenherr RM、Kennedy JJ、Voytovich U、Lin C、Fang B、Bowers K、Whiteley G、Colantonio S、Bocik W、Roberts R、Hiltke T、Boja E、Rodriguez H、McCormick F、Holderfield M、Carr SA、Koomen JM、Paulovich AG。细胞报告方法doi:10.1016/j.crmeth.2021.100015。


分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
SCIEX 5500/Thermo Quantiva公司
内部标准
稳定同位素标记标准
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
C端子R处的13C和15N
信用证
Dionex终极版3000
色谱柱填料
C18肽映射100
立柱尺寸
75微米ID x 25厘米长
流速
300 nL/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
7岁(1+) 21.4 6.9 10.7 23.8 28.6 17.6 32 29.4 20.6 16 15 17
y16(2+) 25.4 7.2 10.2 32.3 26.4 17.9 41.1 27.4 20.6 16 15 17
总和 21.8 6.7 10.5 26.6 27.6 17.7 34.4 28.4 20.6 16 15 17


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CPTAC-5812的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
地图1
肽修饰顺序
VADPDHDHTGFLT[+79.966331]安永[+79.9 66331]VATR
修改类型
磷(Y)
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
肽开始
173
肽末端
191
CPTAC标识
CPTAC-5812型
肽分子质量
2,302.9297
物种
人类 智者 (人类)
分析类型
浓缩PRM
富集方法
不适用
矩阵
细胞裂解液
提交实验室
Fred Hutchinson癌症研究中心、H.Lee Moffitt癌症中心和研究所、Broad Institute
提交实验室PI
阿曼达·保罗维奇(Amanda Paulovich)、约翰·库门(John Koomen)、史蒂文·卡尔(Steven A.Carr)

出版物

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基于靶向质谱的分析能够对受体酪氨酸激酶、MAP激酶和AKT信号进行多重量化。Whiteaker JR、Sharma K、Hoffman MA、Kuhn E、Zhao L、Cocco AR、Schoenhrr RM、Kennedy JJ、Voytovich U、Lin C、Fang B、Bowers K、Whiteley G、Colantonio S、Bocik W、Roberts R、Hiltke T、Boja E、Rodriguez H、McCormick F、Holderfield M、Carr SA、Koomen JM、Paulovich AG。细胞报告方法doi:10.1016/j.crmeth.2021.100015。


分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
SCIEX 5500/Thermo Quantiva公司
内部标准
稳定同位素标记标准
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
C端子R处的13C和15N
信用证
Dionex旗舰版3000
色谱柱填料
C18肽映射100
立柱尺寸
75微米ID x 25厘米长
流速
300 nL/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
y15(2+) 12.1 15.4 14.5 19.8 21.5 18.5 23.2 26.4 23.5 16 15 16
y15(3+) 15.8 11.6 11.9 20.9 21.5 16.8 26.2 24.4 20.6 16 15 16
总和 13.9 12.6 11.8 19.9 21.2 17.1 24.3 24.7 20.8 16 15 16


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非CPTAC-5406的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
地图1
顺序
VADPDHDHTGFLTEYVATR公司
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽开始
173
肽末端
191
CPTAC标识
非CPTAC-5406
肽分子质量
2,142.9970
物种
人类 智者 (人类)
分析类型
直接PRM
矩阵
细胞裂解液
提交实验室
莫菲特癌症中心
提交实验室PI
约翰·库门

出版物

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基于靶向质谱的分析能够对受体酪氨酸激酶、MAP激酶和AKT信号进行多重量化。Whiteaker JR、Sharma K、Hoffman MA、Kuhn E、Zhao L、Cocco AR、Schoenherr RM、Kennedy JJ、Voytovich U、Lin C、Fang B、Bowers K、Whiteley G、Colantonio S、Bocik W、Roberts R、Hiltke T、Boja E、Rodriguez H、McCormick F、Holderfield M、Carr SA、Koomen JM、Paulovich AG。细胞报告方法doi:10.1016/j.crmeth.2021.100015。


分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
RSLCnano和Quantiva
内部标准
稳定同位素标记标准
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
C端子R处的13C和15N
信用证
RSLC纳米
色谱柱填料
C18肽映射100
立柱尺寸
75微米ID x 25厘米长
流速
300 nl/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片离子/过渡 医学 医学 医学 医学
y4(1+) 18.2 5.4 2.5 19.1 4.3 3.5 26.4 6.9 4.3 15 15 15
y5(1+) 13 3.5 3.1 11.2 4.2 4.5 17.2 5.5 5.5 15 15 15
y6(1+) 19.9 6.2 2.1 21.3 6.3 3.2 29.1 8.8 3.8 15 15 15
7岁(1+) 8.9 4.9 2 9.2 5.9 2.9 12.8 7.7 3.5 15 15 15
y10(1+) 40.9 8.3 4.7 39.6 10.3 4.9 56.9 13.2 6.8 15 15 15
总和 4.8 1.7 1.3 6.8 2.4 2.8 8.3 2.9 3.1 15 15 15


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非CPTAC-5721的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
地图1
肽修饰顺序
VADPDHDHTGFLT[+79.966331]眼罩
修改类型
磷(ST)
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
肽开始
173
肽末端
191
CPTAC标识
非CPTAC-5721
肽分子质量
2,222.9634
物种
人类 智者 (人类)
化验类型
富集PRM
富集方法
不适用
矩阵
细胞裂解液
提交实验室
莫菲特癌症中心
提交实验室PI
约翰·库门

出版物

查看详细信息 (在新窗口中打开)

基于靶向质谱的分析能够对受体酪氨酸激酶、MAP激酶和AKT信号进行多重量化。Whiteaker JR、Sharma K、Hoffman MA、Kuhn E、Zhao L、Cocco AR、Schoenherr RM、Kennedy JJ、Voytovich U、Lin C、Fang B、Bowers K、Whiteley G、Colantonio S、Bocik W、Roberts R、Hiltke T、Boja E、Rodriguez H、McCormick F、Holderfield M、Carr SA、Koomen JM、Paulovich AG。细胞报告方法doi:10.1016/j.crmeth.2021.100015。


分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
Thermo Quantiva公司
内部标准
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
C端子R处的13C和15N
信用证
Dionex Ultimate 3000 RSLCnano
色谱柱填料
Pepmap 100公司
立柱尺寸
75微米x 25厘米
流速
300 nL/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片离子/过渡 医学 医学 医学 医学
y10-98(1+) 9.3 4.3 5.5 11 6.8 6.1 14.4 8 8.2 15 15 15
7-98岁(1+) 4.1 2.1 3.5 4 2 2.4 5.7 2.9 4.2 15 15 15
y6(1+) 3.9 3.7 2.3 4 4.5 5.6 5.8 3.8 15 15 15
y5(1+) 3.6 3.4 1.7 3.4 3.2 1.6 5 4.7 2.3 15 15 15
y4(1+) 4.3 1.4 4.2 3.1 1.9 6 4.3 2.4 15 15 15
总和 1.3 1.2 2.6 1.5 1.5 4 2 1.9 15 15 15


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非CPTAC-5722的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
地图1
肽修饰顺序
VADPDHDHTGFLTEY[+79.966331]增值税
修改类型
磷(Y)
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
肽开始
173
肽末端
191
CPTAC标识
非CPTAC-5722
肽分子质量
2,222.9634
物种
人类 智者 (人类)
分析类型
浓缩PRM
富集方法
不适用
矩阵
细胞裂解液
提交实验室
莫菲特癌症中心
提交实验室PI
约翰·库门

出版物

查看详细信息 (在新窗口中打开)

基于靶向质谱的测定能够对受体酪氨酸激酶、MAP激酶和AKT信号进行多重定量。Whiteaker JR、Sharma K、Hoffman MA、Kuhn E、Zhao L、Cocco AR、Schoenherr RM、Kennedy JJ、Voytovich U、Lin C、Fang B、Bowers K、Whiteley G、Colantonio S、Bocik W、Roberts R、Hiltke T、Boja E、Rodriguez H、McCormick F、Holderfield M、Carr SA、Koomen JM、Paulovich AG。细胞报告方法doi:10.1016/j.crmeth.2021.100015。


分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
Thermo Quantiva公司
内部标准
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
C端子R处的13C和15N
信用证
Dionex Ultimate 3000 RSLCnano
色谱柱填料
Pepmap 100公司
立柱尺寸
75微米x 25厘米
流速
300 nL/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
8岁(1+) 5.8 3.4 3.3 4.8 4.2 4.7 7.5 5.4 5.7 15 15 15
7岁(1+) 2 2.5 4.5 3.2 4.1 5.4 3.8 4.8 15 15 15
y6(1+) 3.5 3.5 2.5 5.2 3.9 4.6 6.3 5.2 5.2 15 15 15
y5(1+) 4.8 2.7 2.7 5.4 3.5 4.2 7.2 4.4 5 15 15 15
b11(2+) 2.2 3.2 3.5 4.9 3.7 4.6 5.9 15 15 15
总和 2.2 1.7 2.3 3.5 4.1 4.1 3.4 4.7 15 15 15


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非CPTAC-5723的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
地图1
肽修饰顺序
VADPDHDHTGFLT[+79.966331]安永[+79.9 66331]VATR
修改类型
磷(Y)
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
肽开始
173
肽末端
191
CPTAC标识
非CPTAC-5723
肽分子质量
2,302.9297
物种
人类 智者 (人类)
分析类型
浓缩PRM
富集方法
不适用
矩阵
细胞裂解液
提交实验室
莫菲特癌症中心
提交实验室PI
约翰·库门

出版物

查看详细信息 (在新窗口中打开)

基于靶向质谱的分析能够对受体酪氨酸激酶、MAP激酶和AKT信号进行多重量化。Whiteaker JR、Sharma K、Hoffman MA、Kuhn E、Zhao L、Cocco AR、Schoenherr RM、Kennedy JJ、Voytovich U、Lin C、Fang B、Bowers K、Whiteley G、Colantonio S、Bocik W、Roberts R、Hiltke T、Boja E、Rodriguez H、McCormick F、Holderfield M、Carr SA、Koomen JM、Paulovich AG。细胞报告方法doi:10.1016/j.crmeth.2021.100015。


分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
Thermo Quantiva公司
内部标准
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
C末端R的13C和15N
信用证
Dionex Ultimate 3000 RSLCnano
色谱柱填料
Pepmap 100公司
立柱尺寸
75微米x 25厘米
流速
300 nL/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
y16-98(3+) 7.3 5.2 3.3 7.7 5.4 3.9 10.6 7.5 5.1 15 15 15
7-98岁(1+) 9.2 3.9 2.5 16.4 4.7 3.5 18.8 6.1 4.3 15 15 15
y5(1+) 8.7 2.8 9.7 2.8 3.5 13 4 4.6 15 15 15
总和 3.7 2.3 1.7 7.5 2 2.1 8.4 2.7 15 15 15


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CPTAC-1541的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
地图1
顺序
VADPDHDHTGFLTEYVATR公司
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽开始
173
肽末端
191
CPTAC标识
CPTAC-1541型
肽分子质量
2,142.9970
物种
人类 智者 (人类)
分析类型
直接PRM
矩阵
卵巢癌肿瘤组织裂解物
提交实验室
太平洋西北国家实验室
提交实验室PI
刘涛(Tao Liu)

分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
TSQ华帝
内部标准
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
C端子R处的13C和15N
信用证
Waters nanoACQUITY(零件号176016000)
色谱柱填料
Waters BEH C18,1.7 um 130º(零件号186007485)
立柱尺寸
100微米x 100毫米
流速
0.5微升/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(天内CV)
平均批间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
y10(1+) 30.8 11.8 6.1 27.8 11 11.9 41.5 16.1 13.4 15 15 15
8岁(1+) 23.2 13.2 9.2 23.1 11.3 13.4 32.7 17.4 16.3 15 15 15
7岁(1+) 16.6 5.8 3.7 15.4 6.1 9.1 22.6 8.4 9.8 15 15 15
y6(1+) 12.5 5.1 5.7 19.8 5.9 8.4 23.4 7.8 10.2 15 15 15
y5(1+) 10.2 5.6 4.6 17.6 6.4 7.6 20.3 8.5 8.9 15 15 15
总和 6.9 5.1 1.8 11.5 4.9 7.4 13.4 7.1 7.6 15 15 15


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CPTAC-870的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
地图1
顺序
AAAAAA GAGPEMVR
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽起始
2
肽末端
15
CPTAC标识
CPTAC-870型
肽分子质量
1,241.6187
物种
人类 智者 (人类)
分析类型
直接PRM
矩阵
汇集患者来源异种乳腺肿瘤消化物
提交实验室
圣路易斯华盛顿大学
提交实验室PI
里德·汤森

分析参数 塌陷分析参数

数据来源:全景

仪器
三重TOF 5600+(SCIEX)
内部标准
肽标准纯度
原油
肽标准标签类型
C端子R处的13C和15N
信用证
2DPlus纳米液晶(Eksigent)
色谱柱填料
ChromXP C18-CL,3µm,120º
立柱尺寸
200微米x 15厘米
流速
800 nL/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均批间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
y3(1+) 22.5 14.6 10.1 28.3 11.3 9.4 36.2 18.5 13.8 15 15 15
y5(1+) 13.4 9.9 11.9 14.1 11.2 16.3 19.5 14.9 20.2 15 15 15
y6(1+) 13.9 5 5.3 16 9 6.6 21.2 10.3 8.5 15 15 15
7岁(1+) 10.2 9 11.5 17.4 10.8 12.4 20.2 14.1 16.9 15 15 15
8岁(1+) 14.4 4.5 6.9 12.1 6.3 9.3 18.8 7.7 11.6 15 15 15
9岁(1+) 8.3 4.6 8.1 9.6 9.1 8.8 12.7 10.2 12 15 15 15
y10(1+) 10 4.7 4.9 11.4 6.5 7.4 15.2 8 8.9 15 15 15
y11(1+) 18.1 12 10.5 21.3 13.2 11.2 28 17.8 15.4 15 15 15
b6(2+) 8.1 7.6 8.5 13.4 10.4 9.4 15.7 12.9 12.7 15 15 15
b5(1+) 22.7 13.7 15.1 26.3 16.1 17.6 34.7 21.1 23.2 15 15 15
b4(1+) 14.6 11 11.2 17.2 13 11.8 22.6 17 16.3 15 15 15
总和 4 3.6 6.2 6 6.1 7.4 6.7 7.1 15 15 15


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CPTAC-871的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
地图1
顺序
ELIFEETAR公司
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽开始
345
肽末端
353
CPTAC标识
CPTAC-871型
肽分子质量
1,106.5608
物种
人类 智者 (人类)
化验类型
直接PRM
矩阵
汇集患者来源异种乳腺肿瘤消化物
提交实验室
圣路易斯华盛顿大学
提交实验室PI
里德·汤森

分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
三重TOF 5600+(SCIEX)
内部标准
肽标准纯度
原油
肽标准标签类型
C端子R处的13C和15N
信用证
2DPlus纳米液晶(Eksigent)
色谱柱填料
ChromXP C18-CL,3µm,120º
立柱尺寸
200微米x 15厘米
流速
800 nL/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
y3(1+) 15 6.7 6.3 14 7.2 7.1 20.5 9.8 9.5 15 15 15
y4(1+) 8.3 5.1 4.8 8.4 7.1 6.2 11.8 8.7 7.8 15 15 15
y5(1+) 6.2 3.5 2.3 8 4.8 4.4 10.1 5.9 5 15 15 15
y6(1+) 4.6 1.8 2.6 6.9 3.3 3.1 8.3 3.8 4 15 15 15
7岁(1+) 5 5.7 4.2 7.3 4.7 3.9 8.8 7.4 5.7 15 15 15
总和 3.8 1.5 1.7 5.9 3.5 2.8 7 3.8 3.3 15 15 15


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CPTAC-3200的含量测定细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
地图1
顺序
VADPDHDHTGFLTEYVATR公司
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽开始
173
肽末端
191
CPTAC标识
CPTAC-3200型
肽分子质量
2,142.9970
物种
人类 智者
分析类型
直接PRM
矩阵
肿瘤消化
提交实验室
圣路易斯华盛顿大学
提交实验室PI
里德·汤森

化验参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
赛默飞世尔,Q-Exactive
内部标准
柱上25 fmol
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
C端子R处的13C和15N
信用证
Easy-nLC 1000 Thermo Scientific公司
色谱柱填料
第18号
立柱尺寸
75微米x 50厘米
流速
300 nL/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
y4(1+) 28.5 6.8 7.9 42.5 6.5 7.9 51.2 9.4 11.2 15 15 15
b11(2+) 45.3 10.4 5.6 47.6 6.9 5.8 65.7 12.5 8.1 15 15 15
y3(1+) 8.3 8.6 6.3 12.1 8.2 6.8 14.7 11.9 9.3 15 15 15
总和 13.1 8.1 6.5 21.7 7.1 6.8 25.3 10.8 9.4 15 15 15


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