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在引用CPTAC分析门户时,请包括以下声明
我们感谢美国国家癌症研究所临床蛋白质组肿瘤分析联盟(CPTAC)分析门户网站(assesss.Cancer.gov)用于开发分析并建立本出版物中所述分析的标准。

概述数据来源:UniProt

官方基因符号 其他别名
自动取款机 不适用
序列长度(AA) 分子量(Da)
3056 350687
蛋白质名称
丝氨酸蛋白激酶ATM
来源
UniProt公司
磷化SitePlus®
基因卡
人类蛋白质阿特拉斯

蛋白质序列悬停以查看完整序列

10 20 30 40 50
MSLVLNDLLI公司 CCRQLEHDRA公司 TERKKEVEKF公司 KRLIRDPETI公司 KHLDRHSDSK公司
60 70 80 90 100
QGKYLNWDAV公司 FRFLQKYIQK公司 ETECLRIAKP公司 NVSASTQASR公司 QKKMQEISSL公司
110 120 130 140 150
VKYFIKCANR公司 RAPRLKCQEL公司 LNYIMDTVKD公司 SSNGAIYGAD公司 CSNILLKDIL公司
160 170 180 190 200
SVRKYWCEIS公司 QQQWLELFSV公司 YFRLYLKPSQ公司 DVHRVLVARI公司 IHAVTKGCCS公司
210 220 230 240 250
QTDGLNSKFL公司 DFFSKAIQCA公司 RQEKSSSGLN公司 HILAALTIFL公司 KTLAVNFRIR公司
260 270 280 290 300
VCELGDEILP公司 TLLYIWTQHR公司 LNDSLKEVII公司 ELFQLQIYIH公司 HPKGAKTQEK公司
310 320 330 340 350
GAYESTKWRS公司 ILYNLYDLLV公司 NEISHIGSRG公司 基什格夫尼亚 弗肯利尔马
360 370 380 390 400
DICHQVFNED标准 信托收据S公司L(左)E类S公司S公司Y(Y) T型T型T型R(右)埃斯迪 SVPCKRKKIE公司 LGWEVIKDHL公司
410 420 430 440 450
QKSQNDFDLV公司 普华永道(PWLQIATQLI) 高空跳伞 ELSPLLMILS公司 QLLPQQRHGE公司
460 470 480 490 500
RTPYVLRCLT公司 撤离QDKRS NLESSQKSDL公司 LKLWNKIWCI公司 TFRGISSEQI公司
510 520 530 540 550
卡恩FGLLGA IIQGSLVEVD公司 刷新(REFWKLFTGS) ACRPSCPAVC公司 CLTLALTTSI公司
560 570 580 590 600
VPGTVKMGIE公司 QNMCEVNRSF公司 SLKESIMKWL公司 LFYQLEGDLE公司 NSTEVPPILH公司
610 620 630 640 650
SNFPHLVLEK公司 ILVSLTMKNC公司 KAAMNFFQSV公司 PECEHHQKDK公司 EELSFSEVEE公司
660 670 680 690 700
LFLQTTFDKM公司 DFLTIVRECG公司 IEKHQSSIGF公司 SVHQNLKESL公司 DRCLLGLSEQ公司
710 720 730 740 750
LLNNYSSEIT公司 NSETLVRCSR公司 LLVGVLGCYC公司 基督教青年会 YKSELFQKAK公司
760 770 780 790 800
斯里兰卡 TLFKNKTNEE公司 冷量(毫米) QLCTRCLSNC公司 TKKSPNKIAS公司
810 820 830 840 850
GFFLRLLTSK公司 LMNDIADICK公司 SLASFIKKPF公司 DRGEVESMED公司 DTNGNLMEVE公司
860 870 880 890 900
DQSSMNLFND公司 YPDSSVSDAN公司 EPGESQSTIG公司 AINPLAEEYL公司 SK公司D类L(左)L(左)F类L(左)D类M(M)
910 920 930 940 950
L(左)K(K)FLCLCVTT公司 AQTNTVSFRA公司 ADIRRKLLML公司 IDSSTLEPTK公司 SLHLHMYLML公司
960 970 980 990 1000
LKELPGEEYP公司 LPMEDVLELL公司 KPLSNVCSLY公司 RRDQDVCKTI公司 LNHVLHVVVKN公司
1010 1020 1030 1040 1050
LGQSNMDSEN公司 TRDAQGQFLT公司 VIGAFWHLTK公司 ERKYIFSVRM公司 ALVNCLKTLL公司
1060 1070 1080 1090 1100
EADPYSKWAI公司 LNVMGKDFPV公司 NEVFTQFLAD公司 NHHQVRMLAA公司 环境影响评估
1110 1120 1130 1140 1150
KGDSSRLLKA公司 液化石油气L(左)T型一个F类 E类N个一个Y(Y)L(左)K(K)AQEG公司 EMSHSAEN先生 彼得戴因
1160 1170 1180 1190 1200
KSVLLTLIAV公司 VLSCSPICEK公司 QALFALCKSV公司 肯勒夫 KKVLEKVSET公司
1210 1220 1230 1240 1250
FGYRRLEDFM公司 阿什德利维尔 WLNLQDTEYN公司 LSSFPFILLN公司 YTNIEDFYRS公司
1260 1270 1280 1290 1300
CYKVLIPHLV公司 IRSHFDEVKS公司 IANQIQEDWK公司 SLLTDCFPKI公司 LVNILPYFAY公司
1310 1320 1330 1340 1350
EGTRDSGMAQ公司 QRETATKVYD公司 MLKSENLLGK公司 QIDHLFISNL公司 佩夫维尔姆
1360 1370 1380 1390 1400
LHEPANSSAS公司 QSTDLCDFSG公司 DLDPAPNPPH公司 FPSHVIKATF公司 阿伊斯奇克
1410 1420 1430 1440 1450
LKSILEILSK公司 SPDSYQKILL公司 艾切卡埃滕 NVYKKHRILK公司 IYHLFVSLLL公司
1460 1470 1480 1490 1500
KDIKSGLGGA公司 瓦夫勒德维 TLIHYINQRP公司 SCIMDVSLRS系统 FSLCCDLLSQ公司
1510 1520 1530 1540 1550
VCQTAVTYCK公司 戴伦赫维 VGTLIPLVYE公司 QVEVQKQVLD公司 LLKYLVIDNK公司
1560 1570 1580 1590 1600
DNENLYITIK公司 LLDPFPDHVV FKDLRITQQK公司 IKYSRGPFSL公司 LEEINHFLSV公司
1610 1620 1630 1640 1650
SVYDALPLTR公司 LEGLKDLRQ公司 LELHKDQMVD公司 IMRASQDNPQ公司 DGIMVKLVVN公司
1660 1670 1680 1690 1700
LLQLSKMAIN公司 HTGEKEVLEA公司 VGSCLGEVGP公司 IDFSTIAIGH公司 SKDASYTKAL公司
1710 1720 1730 1740 1750
KLFEDKELQW公司 TFIMLTYLNN公司 TLVEDCVKVR SAAVTCLKNI公司 LATKTGHSFW公司
1760 1770 1780 1790 1800
EIYKMTTDPM公司 铺设QPFRTS RKKFLEVPRF公司 DKENPFEGLD公司 DINLWIPLSE公司
1810 1820 1830 1840 1850
NHDIWIKTLT公司 CAFLDSGGTK公司 CEILQLLKPM公司 CEVKTDFCQT公司 VLPYLIHDIL公司
1860 1870 1880 1890 1900
LQDTNESWRN公司 LLSTHVQGFF公司 TSCLRHFSQT公司 SRSTTPANLD公司 SESEHFFRCC公司
1910 1920 1930 1940 1950
LDKKSQRTML公司 AVVDYMRRQK公司 RPSSGTIFND公司 AFWLDLNYLE公司 VAKVAQSCAA公司
1960 1970 1980 1990 2000
HFTALLYAEI公司 YADKKSMDDQ公司 EKRSLAFEEG公司 SQSTISSLS公司 EKSKETGIS公司
2010 2020 2030 2040 2050
LQDLLLEIYR公司 SIGEPDSLYG公司 CGGGKMLQPI公司 TRLRTYEHEA公司 MWGKALVTYD公司
2060 2070 2080 2090 2100
莱塔普斯特尔 QAGIIQALQN公司 LGLCHILSVY公司 LKGLDYENKD公司 WCPELEELHY公司
2110 2120 2130 2140 2150
QAAWRNMQWD公司 HCTSVSKEVE公司 GTSYHESLYN公司 ALQSLRDEF公司 STFYESLKYA公司
2160 2170 2180 2190 2200
RVKEVEEMCK公司 RSLESVYSLY公司 PTLSRLQAIG公司 ELESIGELFS公司 RSVTHRQLSE公司
2210 2220 2230 2240 2250
VYIKWQKHSQ公司 LLKDSDFSFQ公司 EPIMALRTVI公司 LEILMEKEMD公司 NSQRECIKDI公司
2260 2270 2280 2290 2300
LTKHLVELSI公司 LARTFKNTQL公司 佩雷菲奇克 YNSVSCGVSE公司 WQLEEAQVFW公司
2310 2320 2330 2340 2350
AKKEQSLALS公司 ILKQMIKK公司L(左)D类 一个S公司C类一个一个N个N个S公司L(左) K(K)LTYTECLRV公司 CGNWLAETL公司
2360 2370 2380 2390 2400
传染病 LEKAVEVAGN公司 YDGESSDELR公司 NGKMKAFLSL公司 ARFSDTQYQR公司
2410 2420 2430 2440 2450
IENYMKSSEF公司 ENKQALLKRA公司 KEEVGLLREH公司 KIQTNRYTVK公司 VQRELELDEL公司
2460 2470 2480 2490 2500
ALRALKEDRK公司 RFLCKAVENY公司 INCLLSGEEH公司 DMWVFRLCSL公司 WLENSGVSEV公司
2510 2520 2530 2540 2550
NGMMKRDGMK公司 IPTYKFLPLM公司 YQLAARMGTK公司 MMGGLGFHEV公司 LNNLISM公司
2560 2570 2580 2590 2600
DHPHHTLFII公司 拉兰南德 FLTKPEVARR公司 SRITKNVPKQ公司 SSQLDEDRTE公司
2610 2620 2630 2640 2650
AANRIICTIR公司 SRRPQMVRSV公司 EALCDAYIL公司 ANLDATQWKT公司 QRKGINIPAD公司
2660 2670 2680 2690 2700
QPITKLKNLE公司 DVVVPTMEIK公司 VDHTGEYGNL公司 VTIQSFKAEF公司 RLAGGVNLPK公司
2710 2720 2730 2740 2750
IIDCVGSDGK公司 ERRQLVKGRD公司 DLRQDAVMQQ公司 VFQMCNTLLQ公司 RNTETRKRKL公司
2760 2770 2780 2790 2800
TICTYKVVPL公司 SQRSGVLEWC公司 TGTVPIGEFL公司 VNNEDGAHKR公司 YRPNDFSAFQ公司
2810 2820 2830 2840 2850
CQKKMMEVQK公司 KSFEEKYEVF公司 MDVCQNFQPV公司 FRYFCMEKFL公司 DPAIWFEKRL公司
2860 2870 2880 2890 2900
AYTRSVATSS公司 IVGYILGLGD公司 RHVQNILINE公司 QSAELVHIDL公司 GVAFEQGKIL公司
2910 2920 2930 2940 2950
PTPETVPFRL公司 TRDIVDGMGI公司 TGVEGVFRRC公司 CEKTMEVMRN公司 SQETLLTIVE公司
2960 2970 2980 2990 3000
VLLYDPLFDW TMNPLKALYL公司 QQRPEDETEL公司 HPTLNADDQE公司 CKR公司N个L(左)S公司D类D类
3010 3020 3030 3040 3050
S公司F类N个K(K)VAERVL公司 MRLQEKLKGV公司 EEGTVLSVGG公司 QVNLLIQQAI公司 DPKNLSRLFP公司
3056
GWKAWV公司

数据来源:UniProt


蛋白质图谱 折叠蛋白图

靶向肽分析物相对于SNP、异构体和PTM的位置

Uniprot公司数据库登录 磷网站+®

单击节点上的点
查看下面的详细分析信息
所有其他点链接到 UniProt公司



磷酸化 乙酰化 泛素化 其他

加载

装载机

CPTAC-913的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
自动取款机
肽修饰序列
NLS[+80.0]DIDQSFNK(荷兰)
修改类型
磷(ST)
蛋白质-修饰位点
2996
肽-修饰位点
肽开始
2994
肽末端
3004
CPTAC标识
CPTAC-913型
肽分子质量
1,359.5708
物种
人类 智者 (人类)
分析类型
浓缩MRM
富集方法
肽免疫亲和力
矩阵
细胞裂解产物
提交实验室
弗雷德·哈钦森癌症研究中心
提交实验室PI
阿曼达·保罗维奇

出版物

查看详细信息 (在新窗口中打开)

Kennedy JJ、Yan P、Zhao L、Ivey RG、Voytovich U、Moore HD、Lin C、Pogosova-Agadjanyan EL、Stirewalt DL、Reding KW、Whiteaker JR、,Paulovich AG。固定化金属亲和色谱结合多重反应监测可实现重复定量磷酸-唾液酸。分子和细胞蛋白质组学。最大持续功率。O115.054940号


分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
QTrap 5500(Sciex)公司
内部标准
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
C端子K处的13C和15N
信用证
纳米LC-2D(Eksigent)
色谱柱填料
ChromXP C18-CL,3µm,120Å
立柱尺寸
75微米x 15厘米
流速
300 nL/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片离子/过渡 医学 医学 医学 医学
y5(1+) 30.8 15.8 14 53.4 15.1 24 61.6 21.9 27.8 15 24 15
y6(1+) 31.6 9.8 5.3 23.7 9.8 7.2 39.5 13.9 8.9 15 24 15
9岁(1+) 33.1 9.8 7.5 23.8 10.9 11.8 40.8 14.7 14 15 24 15
总和 21.9 10.2 7.2 21.7 10.4 11.5 30.8 14.6 13.6 15 24 15


其他资源和评论


CPTAC-3212的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
自动取款机
序列
NLSDIDQSFNK公司
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽开始
2994
肽末端
3004
CPTAC标识
CPTAC-3212型
肽分子质量
1279.6044美元
物种
人类 智者 (人类)
分析类型
浓缩MRM
富集方法
肽免疫亲和力
矩阵
细胞裂解产物
提交实验室
弗雷德·哈钦森癌症研究中心
提交实验室PI
阿曼达·保罗维奇

出版物

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一种基于多重质谱的分析方法,用于对DNA损伤响应的磷酸化进行稳健量化。Whiteaker JR、Zhao L、Saul R、Kaczmarczyk JA、Schoenherr RM、Moore HD、Jones-Weinert C、Ivey RG、Lin C、Hiltke T、Reding KW、Whiteley G、Wang P、Paulovich AG。辐射研究2018年2月23日。doi:10.1667/RR14963.1。[印刷前Epub]


分析参数 塌陷分析参数

数据来源:全景

仪器
6500个QTRAP(Sciex)
内部标准
合成肽
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
C端子K处的13C和15N
信用证
超纳米液晶2D+(Eksigent)
色谱柱填料
复制Sil-Pur C18-AQ 3um
立柱尺寸
100 x 0.075毫米
流速
300微升/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
y4(1+) 19.8 9.7 13.2 86.1 15 12.9 88.3 17.9 18.5 15 15 15
y5(1+) 26.4 13.9 14.8 75.1 17.6 16.7 79.6 22.4 22.3 15 15 15
y6(1+) 8.9 8.9 12.8 11 11.1 13.8 14.1 14.2 18.8 15 15 15
9岁(1+) 11.8 7.1 11.1 14 12 12 18.3 13.9 16.3 15 15 15
7岁(1+) 16.9 15.9 11.4 24 15.6 11.7 29.4 22.3 16.3 15 15 15
y8(1+) 12.6 10.5 9.8 16 16.5 10 20.4 19.6 14 15 15 15
总和 7.5 5.3 9.2 21 10.3 8.8 22.3 11.6 12.7 15 15 15


其他资源和评论


CPTAC-3213的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
自动取款机
肽修饰序列
NLS[+80.0]DIDQSFNK(荷兰)
修改类型
磷(ST)
蛋白质-修饰位点
2996
肽-修饰位点
肽开始
2994
肽末端
3004
CPTAC标识
CPTAC-3213型
肽分子质量
1,359.5708
物种
人类 智者 (人类)
化验类型
浓缩MRM
富集方法
肽免疫亲和力
矩阵
细胞裂解产物
提交实验室
弗雷德·哈钦森癌症研究中心
提交实验室PI
阿曼达·保罗维奇

出版物

查看详细信息 (在新窗口中打开)

一种基于多重质谱的分析方法,用于对DNA损伤响应的磷酸化进行稳健量化。Whiteaker JR、Zhao L、Saul R、Kaczmarczyk JA、Schoenherr RM、Moore HD、Jones-Weinert C、Ivey RG、Lin C、Hiltke T、Reding KW、Whiteley G、Wang P、Paulovich AG。辐射研究2018年2月23日。doi:10.1667/RR14963.1。[印刷前Epub]


分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
6500个QTRAP(Sciex)
内部标准
合成肽
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
C端子K处的13C和15N
信用证
超纳米液晶2D+(Eksigent)
色谱柱填料
复制Sil-Pur C18-AQ 3um
立柱尺寸
100 x 0.075毫米
流速
300微升/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均批内CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
年9-98(1+) 31.9 9.2 10.5 40.5 18 11.3 51.6 20.2 15.4 15 15 15
9岁(1+) 39.6 14 17.5 51.8 16.2 21.8 65.2 21.4 28 15 15 15
y6(1+) 19.2 12.6 11.8 50.8 17 17.1 54.3 21.2 20.8 15 15 15
8岁(1+) 27.9 12.3 13.1 59.3 25.9 16.3 65.5 28.7 20.9 15 15 15
7岁(1+) 41.5 23.5 24 96 29.8 32.6 104.6 38 40.5 15 15 15
总和 20.5 6.6 7.4 40.9 10.1 12.1 45.7 12.1 14.2 15 15 15


其他资源和意见


CPTAC-5978的含量测定细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
自动取款机
序列
NLSDIDQSFNK公司
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
4
肽开始
2994
肽末端
3004
CPTAC标识
CPTAC-5978型
肽分子质量
1,279.6044
物种
人类 智者 (人类)
分析类型
浓缩MRM
富集方法
肽免疫亲和力
矩阵
FFPE肿瘤组织裂解液池
提交实验室
弗雷德·哈钦森癌症研究中心
提交实验室PI
阿曼达·波洛维奇

出版物

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靶向质谱能够对临床生物样品中的免疫调节蛋白进行多重定量。Whiteaker JR、Lundeen RA、Zhao L、Schoenherr RM、Burian A、Huang D、Voytovich U、Wang T、Kennedy JJ、Ivey RG、Lin C、Murillo OD、Lorentzen TD、Thiagarajan M、Colantonio S、Caceres TW、Roberts RR、Knotts JG、Reading JJ、Kaczmarczyk JA、Richardson CW、Garcia-Buntley SS、Bocik W、Hewitt SM、Murray KE、Do N、Brophy M、Wilz SW、Yu H、Ajjarapu S、Boja E、,Hiltke T、Rodriguez H、Paulovich AG.Front Immunol公司。2021年11月11日;12:765898. doi:10.3389/fimmu.2021.765898。电子收款2021.PMID:34858420


分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
QTRAP 5500号
内部标准
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
C端子K处的13C和15N
信用证
Eksigent纳米LC 425
色谱柱填料
3µm ChromXP C18EP,120º
立柱尺寸
150 x 0.3毫米
流速
0.3微升/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(天内CV)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
9岁(1+) 41.4 5.7 9.9 75.8 94.1 80.5 86.4 94.3 81.1 13 25 14
8岁(1+) 48.4 9.8 10.3 74.8 92 77.3 89.1 92.5 78 13 25 14
y6(1+) 38.7 6 9.7 68.7 89.2 77.7 78.9 89.4 78.3 13 25 14
y5(1+) 48.4 9.9 9.7 63.9 89.2 77 80.2 89.7 77.6 13 25 14
y4(1+) 30.4 11.2 9.7 59 89.4 77.9 66.4 90.1 78.5 13 25 14
总和 38.5 5.5 9.7 71 92 78.6 80.8 92.2 79.2 13 25 14


其他资源和评论


CPTAC-5979的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
自动取款机
肽修饰序列
NLS[+79.966331]DIDQSFNK公司
修改类型
磷(ST)
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
4
肽开始
2994
肽末端
3004
CPTAC标识
CPTAC-5979型
肽分子质量
1,359.5708
物种
人类 智者 (人类)
分析类型
浓缩MRM
富集方法
肽免疫亲和力
矩阵
FFPE肿瘤组织裂解液池
提交实验室
弗雷德·哈钦森癌症研究中心
提交实验室PI
阿曼达·保罗维奇

出版物

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靶向质谱能够对临床生物样品中的免疫调节蛋白进行多重定量。Whiteaker JR、Lundeen RA、Zhao L、Schoenherr RM、Burian A、Huang D、Voytovich U、Wang T、Kennedy JJ、Ivey RG、Lin C、Murillo OD、Lorentzen TD、Thiagarajan M、Colantonio S、Caceres TW、Roberts RR、Knotts JG、Reading JJ、Kaczmarczyk JA、Richardson CW、Garcia-Buntley SS、Bocik W、Hewitt SM、Murray KE、Do N、Brophy M、Wilz SW、Yu H、Ajjarapu S、Boja E、,Hiltke T、Rodriguez H、Paulovich AG.Front Immunol公司。2021年11月11日;12:765898. doi:10.3389/fimmu.2021.765898。电子收款2021.PMID:34858420


分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
QTRAP 5500号
内部标准
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
C末端K处的13C和15N
信用证
Eksigent纳米LC 425
色谱柱填料
3µm ChromXP C18EP,120º
立柱尺寸
150 x 0.3毫米
流速
0.3微升/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
年9-98(1+) 48.8 11.6 11.8 68.7 96.3 81.8 84.3 97 82.6 13 25 14
8岁(1+) 58.6 12.3 14.7 77.1 93.9 82.8 96.8 94.7 84.1 13 25 14
7岁(1+) 46.8 12.9 15.5 74.2 93.2 83.1 87.7 94.1 84.5 13 25 14
9岁(1+) 51.8 12.5 16.1 82.4 97.3 83.1 97.3 98.1 84.6 13 25 14
总和 45.9 8.7 13.2 75.4 95.4 82.5 88.3 95.8 83.5 13 25 14


其他资源和评论


CPTAC-912的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
自动取款机
肽修饰序列
SLEIS[+80.0]QSYTTTQR公司
修改类型
磷(ST)
蛋白质-修饰位点
367
肽-修饰位点
5
肽开始
363
肽末端
375
CPTAC标识
CPTAC-912型
肽分子质量
1,592.7083
物种
人类 智者 (人类)
分析类型
浓缩MRM
富集方法
肽免疫亲和力
矩阵
细胞裂解产物
提交实验室
弗雷德·哈钦森癌症研究中心
提交实验室PI
阿曼达·保罗维奇

出版物

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Kennedy JJ、Yan P、Zhao L、Ivey RG、Voytovich U、Moore HD、Lin C、Pogosova-Agadjanyan EL、Stirewalt DL、Reding KW、Whiteaker JR、,Paulovich AG。固定化金属亲和色谱结合多重反应监测可实现重复定量磷酸-唾液酸。分子和细胞蛋白质组学。最大持续功率。2014年1月15日


分析参数 塌陷分析参数

数据来源:全景

仪器
QTrap 5500(Sciex)公司
内部标准
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
C端子R处的13C和15N
信用证
纳米LC-2D(Eksigent)
色谱柱填料
ChromXP C18-CL,3µm,120º
立柱尺寸
75微米x 15厘米
流速
300 nL/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
y6(1+) 46.1 33.2 35.8 48.7 25.8 59.5 67.1 42 69.4 13 23 15
7岁(1+) 36.2 11.6 13.6 35.9 14.4 12 51 18.5 18.1 13 23 15
y9(1+) 28.8 24.6 18.2 39.7 23.5 21.8 49 34 28.4 13 23 15
总和 26.5 11.2 9.1 26.2 11.9 16.1 37.3 16.3 18.5 13 23 15


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评论

CPTAC-3210的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
自动取款机
序列
SLEISQSYTTTQR公司
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽开始
363
肽末端
375
CPTAC标识
CPTAC-3210型
肽分子质量
1,512.7420
物种
人类 智者 (人类)
分析类型
浓缩MRM
富集方法
肽免疫亲和力
矩阵
细胞裂解产物
提交实验室
弗雷德·哈钦森癌症研究中心
提交实验室PI
阿曼达·保罗维奇

出版物

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一种基于多重质谱的分析方法,用于对DNA损伤响应的磷酸化进行稳健量化。Whiteaker JR、Zhao L、Saul R、Kaczmarczyk JA、Schoenherr RM、Moore HD、Jones-Weinert C、Ivey RG、Lin C、Hiltke T、Reding KW、Whiteley G、Wang P、Paulovich AG。辐射研究2018年2月23日。doi:10.1667/RR14963.1。[印刷前Epub]


分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
6500个QTRAP(Sciex)
内部标准
合成肽
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
C端子R处的13C和15N
信用证
超纳米液晶2D+(Eksigent)
色谱柱填料
复制Sil-Pur C18-AQ 3um
立柱尺寸
100 x 0.075毫米
流速
300微升/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
y4(1+) 35.7 12.6 16.5 36.2 12 12.9 50.8 17.4 20.9 15 15 15
y5(1+) 28.1 10.6 12.3 28.2 11.6 16.8 39.8 15.7 20.8 15 15 15
y6(1+) 32.4 10.7 15.8 28.4 14 14.8 43.1 17.6 21.6 15 15 15
7岁(1+) 25.8 13.4 8.9 37.2 10.2 9.8 45.3 16.8 13.2 15 15 15
8岁(1+) 24.1 10.4 7.8 29 13.2 14.1 37.7 16.8 16.1 15 15 15
9岁(1+) 16.4 10.9 10.3 15.6 13.6 5.6 22.6 17.4 11.7 15 15 15
y10(1+) 36.8 13.1 14.4 29.8 12.7 17.7 47.4 18.2 22.8 15 15 15
总和 13.7 5.1 5.9 17.7 6.3 7.2 22.4 8.1 9.3 15 15 15


其他资源和评论


CPTAC-3211的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
自动取款机
肽修饰序列
SLEIS[+80.0]QSYTTTQR公司
修改类型
磷酸(ST)
蛋白质-修饰位点
367
肽-修饰位点
5
肽开始
363
肽末端
375
CPTAC标识
CPTAC-3211型
肽分子质量
1,592.7083
物种
人类 智者 (人类)
分析类型
浓缩MRM
富集方法
肽免疫亲和力
矩阵
细胞裂解产物
提交实验室
弗雷德·哈钦森癌症研究中心
提交实验室PI
阿曼达·保罗维奇

出版物

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一种基于多重质谱的分析方法,用于对DNA损伤响应的磷酸化进行稳健量化。Whiteaker JR、Zhao L、Saul R、Kaczmarczyk JA、Schoenherr RM、Moore HD、Jones-Weinert C、Ivey RG、Lin C、Hiltke T、Reding KW、Whiteley G、Wang P、Paulovich AG。辐射研究2018年2月23日。doi:10.1667/RR14963.1。[印刷前Epub]


分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
6500个QTRAP(Sciex)
内部标准
合成肽
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
C端子R处的13C和15N
信用证
超纳米液晶2D+(Eksigent)
色谱柱填料
复制Sil-Pur C18-AQ 3um
立柱尺寸
100 x 0.075毫米
流速
300微升/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
9岁(1+) 59.3 15.2 12.7 66.3 17 15.8 89 22.8 20.3 15 15 15
y10-98(2+) 19.6 18.6 11.4 25.4 20 22.7 32.1 27.3 25.4 15 15 15
7岁(1+) 26.1 13.8 13.7 21.4 11.4 16.5 33.8 17.9 21.4 15 15 15
y6(1+) 47.3 10.9 19.5 56 12.1 20.2 73.3 16.3 28.1 15 15 15
y11-98(2+) 31 25.6 27.6 41.3 27.6 28.9 51.6 37.6 40 15 15 15
y5(1+) 42 19 19.5 50.9 20 16.3 66 27.6 25.4 15 15 15
y4(1+) 56.2 12.1 17.7 70.8 18 16.8 90.4 21.7 24.4 15 15 15
总和 14.2 5.7 10.8 20.2 7.7 10.7 24.7 9.6 15.2 15 15 15


其他资源和评论


CPTAC-5976的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
自动取款机
序列
SLEISQSYTTTQR公司
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
4
肽开始
363
肽末端
375
CPTAC标识
CPTAC-5976型
肽分子质量
1,512.7420
物种
人类 智者 (人类)
分析类型
浓缩MRM
富集方法
肽免疫亲和力
矩阵
FFPE肿瘤组织裂解液池
提交实验室
弗雷德·哈钦森癌症研究中心
提交实验室PI
阿曼达·波洛维奇

出版物

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靶向质谱能够对临床生物样品中的免疫调节蛋白进行多重定量。Whiteaker JR、Lundeen RA、Zhao L、Schoenherr RM、Burian A、Huang D、Voytovich U、Wang T、Kennedy JJ、Ivey RG、Lin C、Murillo OD、Lorentzen TD、Thiagarajan M、Colantonio S、Caceres TW、Roberts RR、Knotts JG、Reading JJ、Kaczmarczyk JA、Richardson CW、Garcia-Buntley SS、Bocik W、Hewitt SM、Murray KE、Do N、Brophy M、Wilz SW、Yu H、Ajjarapu S、Boja E、,Hiltke T、Rodriguez H、Paulovich AG.Front Immunol公司。2021年11月11日;12:765898. doi:10.3389/fimmu.2021.765898。电子收款2021.PMID:34858420


分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
QTRAP 5500号
内部标准
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
C端子R处的13C和15N
信用证
Eksigent纳米LC 425
色谱柱填料
3µm ChromXP C18EP,120Å
立柱尺寸
150 x 0.3毫米
流速
0.3微升/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片离子/过渡 医学 医学 医学 医学
8岁(1+) 12.8 8.6 3.3 17.5 11.7 9.7 21.7 14.5 10.2 13 25 14
9岁(1+) 10.6 4.7 3.3 14.3 13.7 12.8 17.8 14.5 13.2 13 25 14
y10(1+) 12.3 8.6 6 9.3 15.2 13.6 15.4 17.5 14.9 13 25 14
y4(1+) 14.5 7.7 4.7 16.6 14.8 16.8 22 16.7 17.4 13 25 14
y5(1+) 8.7 7.1 4.5 14.7 13.6 12.8 17.1 15.3 13.6 13 25 14
7岁(1+) 9.4 7 3.5 11.5 15.1 10.9 14.9 16.6 11.4 13 25 14
y6(1+) 13.2 7.8 4.6 12.8 13.5 13.4 18.4 15.6 14.2 13 25 14
总和 9.2 5.2 2.8 11.8 13.4 12.2 15 14.4 12.5 13 25 14


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CPTAC-5977的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
自动取款机
肽修饰序列
SLEIS[+79.966331]QSYTTTQR公司
修改类型
磷(ST)
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
4
肽开始
363
肽末端
375
CPTAC标识
CPTAC-5977型
肽分子质量
1,592.7083
物种
人类 智者 (人类)
分析类型
浓缩MRM
富集方法
肽免疫亲和力
矩阵
FFPE肿瘤组织裂解液池
提交实验室
弗雷德·哈钦森癌症研究中心
提交实验室PI
阿曼达·波洛维奇

出版物

查看详细信息 (在新窗口中打开)

靶向质谱能够对临床生物样品中的免疫调节蛋白进行多重定量。Whiteaker JR、Lundeen RA、Zhao L、Schoenherr RM、Burian A、Huang D、Voytovich U、Wang T、Kennedy JJ、Ivey RG、Lin C、Murillo OD、Lorentzen TD、Thiagarajan M、Colantonio S、Caceres TW、Roberts RR、Knotts JG、Reading JJ、Kaczmarczyk JA、Richardson CW、Garcia-Buntley SS、Bocik W、Hewitt SM、Murray KE、Do N、Brophy M、Wilz SW、Yu H、Ajjarapu S、Boja E、,Hiltke T、Rodriguez H、Paulovich AG.Front Immunol公司。2021年11月11日;12:765898. doi:10.3389/fimmu.2021.765898。电子收款2021.PMID:34858420


分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
QTRAP 5500号
内部标准
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
C端子R处的13C和15N
信用证
Eksigent纳米LC 425
色谱柱填料
3µm ChromXP C18EP,120Å
立柱尺寸
150 x 0.3毫米
流速
0.3微升/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片离子/过渡 医学 医学 医学 医学
y5(1+) 16.4 10.3 5.5 16.7 19.6 16.4 23.4 22.1 17.3 13 25 14
y6(1+) 6.9 8.7 6.8 15.3 20.1 14.8 16.8 21.9 16.3 13 25 14
7岁(1+) 12.4 9.6 4.9 21.6 21.7 16.1 24.9 23.7 16.8 13 25 14
9岁(1+) 18.9 12.5 6.7 17.8 22.4 13.5 26 25.7 15.1 13 25 14
y11-98(2+) 14.5 13.6 11.8 24.5 19.8 15.5 28.5 24 19.5 13 25 14
y10-98(2+) 7.2 9.5 5.5 17.2 18 17.5 18.6 20.4 18.3 13 25 14
总和 9.1 6.2 2.7 14.3 18.8 14.1 16.9 19.8 14.4 13 25 14


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CPTAC-2876的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
自动取款机
肽修饰序列
LDASC[+57.0]AANNPSLK公司
修改类型
氨基甲基(C)
蛋白质-修饰位点
2324
肽-修饰位点
5
肽开始
2319
肽末端
2331
CPTAC标识
CPTAC-2876型
肽分子质量
1,359.6453
物种
人类 智者
分析类型
直接MRM
矩阵
肿瘤消化
提交实验室
圣路易斯华盛顿大学
提交实验室PI
里德·汤森

分析参数 塌陷分析参数

数据来源:全景

仪器
赛默飞世尔,Q-Exactive
内部标准
柱上25 fmol
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
C端子K处的13C和15N
信用证
Easy-nLC 1000 Thermo Scientific公司
色谱柱填料
第18号
立柱尺寸
75微米x 50厘米
流速
300 nL/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
8岁(1+) 6.2 4.5 2.4 6.8 4.8 3.2 9.2 6.6 4 15 15 15
7岁(1+) 4.7 4.6 3.7 5 4.9 4.1 6.9 6.7 5.5 15 15 15
y4(1+) 5.8 2.9 2.1 6.5 3.3 2.9 8.7 4.4 3.6 15 15 15
总和 5.2 3.8 2.3 5.4 4 2.9 7.5 5.5 3.7 15 15 15


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评论

CPTAC-2875的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
自动取款机
序列
LQQTAFENAYLK公司
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽开始
1115
肽末端
1126
CPTAC标识
CPTAC-2875型
肽分子质量
1,424.7300
物种
人类 智者
分析类型
直接MRM
矩阵
肿瘤消化
提交实验室
圣路易斯华盛顿大学
提交实验室PI
里德·汤森

分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
赛默飞世尔,Q-Exactive
内部标准
柱上25 fmol
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
C端子K处的13C和15N
信用证
Easy-nLC 1000 Thermo Scientific公司
色谱柱填料
第18号
立柱尺寸
75微米x 50厘米
流速
300 nL/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均批内CV
(CV日内)
平均批间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
9岁(1+) 4.7 5.5 5.4 6 5.5 5.6 7.6 7.8 7.8 15 15 15
7岁(1+) 6 3.2 3.9 8.1 5.2 3.9 10.1 6.1 5.5 15 15 15
y10(1+) 5.9 4.4 5.5 9.3 5.1 7.8 11 6.7 9.5 15 15 15
总和 5 4.1 4.6 7 4.9 5.5 8.6 6.4 7.2 15 15 15


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CPTAC-2874的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
自动取款机
序列
QDLL FLDMLK公司
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽开始
893
肽末端
902
CPTAC标识
加拿大太平洋电力公司-2874
肽分子质量
12346.631美元
物种
人类 智者
分析类型
直接MRM
矩阵
肿瘤消化
提交实验室
圣路易斯华盛顿大学
提交实验室PI
里德·汤森

分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
赛默飞世尔,Q-Exactive
内部标准
柱上25 fmol
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
C端子K处的13C和15N
信用证
Easy-nLC 1000 Thermo Scientific公司
色谱柱填料
第18号
立柱尺寸
75微米x 50厘米
流速
300 nL/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均批间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
y3(1+) 5.7 7 5 10.1 11.4 12.7 11.6 13.4 13.6 15 15 15
y6(1+) 6.5 8.3 6 10.6 14 15.5 12.4 16.3 16.6 15 15 15
y4(1+) 6.7 7.5 5.8 11.5 12.5 13.8 13.3 14.6 15 15 15 15
总和 5.8 7.8 5.7 10.4 13.1 14.5 11.9 15.2 15.6 15 15 15


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