显示导航→
在引用CPTAC分析门户时，请包括以下声明
我们感谢美国国家癌症研究所临床蛋白质组肿瘤分析联盟（CPTAC）分析门户网站（assesss.Cancer.gov）用于开发分析并建立本出版物中所述分析的标准。

MSH6号机组

上次化验 下一步化验
可用分析

概述数据来源：UniProt

官方基因符号 其他别名
MSH6号机组 GTBP公司
序列长度（AA） 分子量（Da）
1360 152786
蛋白质名称
DNA错配修复蛋白Msh6
来源
UniProt公司
磷化SitePlus®
基因卡 		人类蛋白质阿特拉斯

蛋白质序列悬停以查看完整序列

10 20 30 40 50
MSRQSTLYSF公司 FPKSPALSDA公司 NKASARASRE公司 GGRAAAAAPGA公司 SPSPGGDAAW公司
60 70 80 90 100
SEAGPGPRPL公司 ARSASPPKAK公司 NLNGGLRR公司S公司V（V） A类P（P）A类A类P（P）T型S公司C类D类F类 S公司P（P）G公司D类L（左）V（V）W公司A类K（K）M（M）
110 120 130 140 150
埃及WWPCLV YNHPFDGTFI公司 REKGKSVRVH公司 VQFFDDSPTR公司 GWVSKRLLKP公司
160 170 180 190 200
YTGSKKEAQ公司 KGGHFYSAKP公司 EILRAMQRAD公司 伊伦克迪克 LELAVCDEPS公司
210 220 230 240 250
EPEEEEEMEV公司 GTTYVTDKSE公司 EDNEIESEEE公司 VQPKTQGSRR公司 SSRQIKKRRV公司
260 270 280 290 300
ISDSESDIGG公司 SDVEFKPDTK公司 EEGSSDEISS公司 GVGDSESEGL公司 NSPVKVARKR公司
310 320 330 340 350
KRMVTGNGSL公司 KRKSSRKETP公司 SATKQATSIS卫星 SETKNTLRAF公司 SAPQNSESQA公司
360 370 380 390 400
HVSGGGDDSS公司 RPTVWYHETL公司 EWLKEEKRRD公司 EHRRRPDHPD公司 FDASTLYVPE公司
410 420 430 440 450
DFLNSCTPGM公司 RKWWQIKSQN公司 FDLVICYKVG公司 KFYELYHMDA公司 LIGVSELGLV公司
460 470 480 490 500
FMKGNWAHSG公司 FPEIAFGRYS公司 DSLVQKGYKV ARVEQTETPE公司 MMEARCKMA公司
510 520 530 540 550
HISKYDRVVR公司 REICRIITKG公司 TQTYSVLEGD公司 PSENYSKYLL公司 SLKEEDSS公司
560 570 580 590 600
光线gvcf VDTSLGKFFI公司 GQFSDDRHCS公司 RFRTLVAHYP公司 PVQVLFEKGN公司
610 620 630 640 650
LSKETKTILK公司 SSLSCSLQEG公司 LIPGSQFWDA公司 SKTLRTLLEE公司 EYFREKLSDG公司
660 670 680 690 700
IGVMLPQVLK公司 GMTSESDSIG公司 LTPGEKSELA公司 LSALGGCVFY公司 LKKCLIDQEL公司
710 720 730 740 750
LSMANFEEYI公司 可编程逻辑控制器DTVSTT RSGAIFTKAY公司 QRMVLDAVTL公司 NNLEIFLNGT公司
760 770 780 790 800
NGSTEGTLLE公司 RVDTCHTPFG公司 KRLLKQWLCA公司 PLCNHYAIND公司 RLDAIEDLMV公司
810 820 830 840 850
VPDKISEVVE公司 LLKKLPDLER公司 LLSKIHNVGS公司 PLKSQNHPDS公司 RAIMYEETTY公司
860 870 880 890 900
SKKKIIDFLS公司 ALEGFKVMCK公司 IIGIMEEVAD公司 GFKSKILKQV公司 ISLQTKNPEG公司
910 920 930 940 950
RFPDL阀门 RWDTAFDHEK公司 ARKTGLITPK公司 AGFDSDYDQA公司 拉迪连克斯
960 970 980 990 1000
LLEYLEKQRN公司 刚性（RIGCTIVYW） GIGRNRYQLE公司 IPENFTTRNL公司 PEEYELKSTK公司
1010 1020 1030 1040 1050
KGCKRYWTKT公司 伊克兰林 AEERRDVSLK公司 DCMRRLFYNF公司 DKNYKDWQSA公司
1060 1070 1080 1090 1100
VECIAVLDVL公司 LCLANYSRGG公司 DGPMCRPVIL公司 LPEDTPPFLE公司 LKGSRHPCIT公司
1110 1120 1130 1140 1150
KTFFGDDFIP公司 NDILIGCEEE公司 EQENGKAYCV公司 LVTGPNMGGK公司 STLMRQAGLL公司
1160 1170 1180 1190 1200
AVMAQMGCYV公司 PAEVCRLTPI公司 DRVFTRLGAS公司 DRIMSGESTF公司 FVELSETASI公司
1210 1220 1230 1240 1250
LMHATAHSLV公司 LVDELGRGTA公司 TFDGTAIANA公司 VVKELAETIK公司 CRTLFSTHYH公司
1260 1270 1280 1290 1300
SLVEDYSQNV公司 AVRLGHMACM公司 VENECEDPSQ公司 ETITFLYKFI公司 KGACPKSYGF公司
1310 1320 1330 1340 1350
NAAR公司L（左）A类N个L（左）P（P）E类 E类V（V）我问K（K）GHRKA公司 REFEKMNQSL公司 RLFREVCLAS公司 前苏联
1360
HKLLTLIKEL公司

数据来源：UniProt

蛋白质图谱 折叠蛋白质图谱

靶向肽分析物相对于SNP、异构体和PTM的位置

Uniprot公司数据库登录 磷网站+®

单击节点上的点
查看下面的详细分析信息
所有其他点链接到 UniProt公司


磷酸化 乙酰化 泛素化 其他

装载

装载机

CPTAC-6060的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源：全景

官方基因符号
MSH6号机组
肽顺序
兰皮维克
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽开始
1305
肽末端
1315
CPTAC标识
CPTAC-6060型
肽分子质量
1,252.7027
物种
人类
化验类型
富集MRM
富集方法
不适用
矩阵
FFPE肺肿瘤组织裂解液池
提交实验室
弗雷德·哈钦森癌症研究中心
提交实验室PI
阿曼达·保罗维奇

出版物

查看详细信息 （在新窗口中打开）

Whiteaker JR、Zhao L、Schoenherr RM、Huang D、Lundeen RA、Voytovich U、Kennedy JJ、Ivey RG、Lin C、Murillo OD、Lorentzen TD、Colantonio S、Caceres TW、Roberts RR、Knotts JG、Reading JJ、Perry CD、Richardson CW、Garcia-Buntley SS、Bocik W、Hewitt SM、Chowdhury S、Vandermeer J、Smith SD、Gopal AK、Ramchurren N、Fling SP、Wang P、Paulovich AG。用于量化免疫调节蛋白的多重分析支持免疫治疗临床试验的相关研究。前Oncol。2023年5月2日；13:1168710. doi:10.3389/fonc.2023.1168710。PMID:37205196；PMCID:PMC10185886。

分析参数 折叠分析参数

数据来源：全景

仪器
QTRAP 5500号
内部标准
肽
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
C端子K处的13C和15N
信用证
Eksigent纳米LC 425
色谱柱填料
3µm ChromXP C18EP，120º
立柱尺寸
150 x 0.075毫米
流速
0.3微升/分钟

色谱图

数据来源：全景

放大视图形象
放大视图形象
放大视图形象

响应曲线

数据来源：全景

放大视图形象
放大视图形象
看法放大图像

检索数据

装载机

可重复性

数据来源：全景

放大视图形象
  平均内部CV
（CV日内）		 平均层间CV
（日间CV）		 总CV
方程式		 n个=
碎片/过渡 低 医学 高 低 医学 高 低 医学 高 低 医学 高
b4（1+） 15.9 8.1 9 20.4 8.5 11.5 25.9 11.7 14.6 15 15 15
b8（1+） 28.6 14.3 18 30.7 11.5 22.3 42 18.4 28.7 15 15 15
y3（1+） 10.9 16.2 11.3 13.8 12.5 13.6 17.6 20.5 17.7 15 15 15
y4（1+） 31.8 9.8 10.2 30.2 10.7 11.2 43.9 14.5 15.1 15 15 15
y6（1+） 20 10.8 9.5 18.6 12.3 14.6 27.3 16.4 17.4 15 15 15
7岁（1+） 17.8 11 4.8 18.7 9 8.3 25.8 14.2 9.6 15 15 15
8岁（1+） 31.9 13.7 9.5 52.7 13.4 28.1 61.6 19.2 29.7 15 15 15
总和 16.2 10 5.1 17.8 8.7 8.8 24.1 13.3 10.2 15 15 15

其他资源和评论

资源
下载SOP
在中查看肽展开图
查看蛋白质展开图
评论

CPTAC-544的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源：全景

官方基因符号
MSH6号机组
肽修饰顺序
SVAPAAPTSC[+57.0]DFSPGDLVWAK公司
修改类型
氨基甲基半胱氨酸
蛋白质-修饰位点
88
肽-修饰位点
10
肽开始
79
肽末端
99
CPTAC标识
CPTAC-544型
肽分子质量
2,175.0307
物种
人类 智者 （人类）
化验类型
直接MRM
矩阵
细胞系裂解液池
提交实验室
首尔国立大学/韩国科学技术学院和FHCRC
提交实验室PI
金永秀（Youngsoo Kim）

出版物

查看详细信息 （在新窗口中打开）

证明大规模开发标准化分析以量化人类蛋白质的可行性。Kennedy JJ、Abbatiello SE、Kim K、Yan P、Whiteaker JR、Lin C、Kim JS、Zhang Y、Wang X、Ivey RG、Zhao L、Min H、Lee Y、Yu MH、Yang EG、Lee C、Wang P、Rodriguez H、Kim Y、Carr SA、Paulovich AG。Nat方法2014年2月；11(2):149-55. doi:10.1038/nmeth.2763。Epub 2013年12月8日。PMID:24317253

首尔国立大学/韩国科学技术研究所获得的响应曲线。弗雷德·哈钦森癌症研究中心获得的重复性数据。

首尔国立大学/韩国科学技术研究所获得的响应曲线。弗雷德·哈钦森癌症研究中心获得的重复性数据。

分析参数 折叠分析参数

数据来源：全景

仪器
5500个QTRAP（ABSCIEX）
内部标准
肽
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
13摄氏度，15牛顿度
信用证
nanoLC-Ultra 2D，cHiPLC-nanoflex（Eksigent）
色谱柱填料
ChromXP C18-CL，3微米，120A
立柱尺寸
150 x 0.075毫米
流速
500 nL/分钟

色谱图

数据来源：全景

放大视图形象
放大视图形象
放大视图形象

响应曲线

数据来源：全景

放大视图形象
放大视图形象
看法放大图像

检索数据

装载机

可重复性

数据来源：全景

放大视图形象
  平均内部CV
（CV日内）		 平均层间CV
（日间CV）		 总CV
方程式		 n个=
碎片/过渡 低 医学 高 低 医学 高 低 医学 高 低 医学 高
y10（1+） 32 31.4 52 32.5 33.3 45.3 45.6 45.8 69 15 25 15
y18（2+） 15.4 13.9 14.1 18 15.7 20.3 23.7 21 24.7 15 25 15
y15（2+） 12.2 14.5 22.5 13 20.7 22.2 17.8 25.3 31.6 15 25 15
总和 9.8 11.7 15.7 13.9 15.4 19.7 17 19.3 25.2 15 25 15

其他资源和评论

资源
下载SOP
在中查看肽展开图
查看蛋白质展开图
评论