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引用CPTAC分析门户时，请包括以下声明
我们感谢美国国家癌症研究所临床蛋白质组肿瘤分析联盟（CPTAC）分析门户网站（assesss.Cancer.gov）用于开发分析并建立本出版物中所述分析的标准。

EPCAM公司

上次化验 下一步化验
可用分析

概述数据来源：UniProt

官方基因符号 其他别名
EPCAM公司 GA733-2、M1S2、M4S1、MIC18、TACSTD1、TROP1
序列长度（AA） 分子量（Da）
314 34932
蛋白质名称
上皮细胞粘附分子
来源
UniProt公司
磷化SitePlus®
基因卡 		人类蛋白质阿特拉斯

蛋白质序列悬停以查看完整序列

10 20 30 40 50
映射程序 LLLAAATATF公司 AAAQEECVCE公司 纽约（NYK）L（左）A类V（V）N个C类F类V（V） N个N个N个R（右）QCQCTS公司
60 70 80 90 100
VGAQNTVICS公司 KLAAKCLVMK公司 AEMNGSKLGR公司 R（右）A类K（K）P（P）E类G公司A类L（左）问N个 N个D类G公司L（左）Y（Y）D类P（P）D类C类D类
110 120 130 140 150
E类S公司G公司L（左）F类K（K）AKQC公司 NGTSMCWCVN公司 TAGVRRTDKD公司 TEITCSERVER公司 TYWIIIELKH公司
160 170 180 190 200
卡雷克比德斯克 SLRTALQKEI公司 TTRYQLDPKF公司 ITSILYENNV公司 ITIDLVQNSS公司
210 220 230 240 250
QKTQNDVDIA公司 DVAYYFEKDV公司 KGESLFHSKK公司 MDLTVNGEQL公司 dldpg数量性状
260 270 280 290 300
YVDEKAPEFS公司 MQGLKAGVIA公司 VIVVVIAVV AGIVVLVISR公司 KKRMAKYEKA公司
310 314
EIKEMGEMHR公司 ELNA公司

数据来源：UniProt

蛋白质图谱 折叠蛋白质图谱

靶向肽分析物相对于SNP、异构体和PTM的位置

Uniprot公司数据库登录 磷网站+®

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磷酸化 乙酰化 泛素化 其他

加载

装载机

CPTAC-503的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源：全景

官方基因符号
EPCAM公司
肽修饰顺序
AKPEGALQNNDGLYDPDC[+57.0]设计
修改类型
氨基甲基半胱氨酸
蛋白质-修饰位点
99
肽-修饰位点
18
肽开始
82
肽末端
106
CPTAC标识
CPTAC-503型
肽分子质量
2,752.2286
物种
人类 智者 （人类）
分析类型
直接MRM
矩阵
细胞系裂解液池
提交实验室
首尔国立大学/韩国科学技术学院和FHCRC
提交实验室PI
金永秀（Youngsoo Kim）

出版物

查看详细信息 （在新窗口中打开）

证明大规模开发标准化分析以量化人类蛋白质的可行性。Kennedy JJ、Abbatiello SE、Kim K、Yan P、Whiteaker JR、Lin C、Kim JS、Zhang Y、Wang X、Ivey RG、Zhao L、Min H、Lee Y、Yu MH、Yang EG、Lee C、Wang P、Rodriguez H、Kim Y、Carr SA、Paulovich AG。Nat方法2014年2月；11(2):149-55. doi:10.1038/nmeth.2763。Epub 2013年12月8日。PMID:24317253

首尔国立大学/韩国科学技术研究所获得的响应曲线。弗雷德·哈钦森癌症研究中心获得的重复性数据。

首尔国立大学/韩国科学技术研究所获得的响应曲线。弗雷德·哈钦森癌症研究中心获得的重复性数据。

分析参数 折叠分析参数

数据来源：全景

仪器
5500个QTRAP（ABSCIEX）
内部标准
肽
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
13摄氏度，15牛顿度
信用证
nanoLC-Ultra 2D，cHiPLC-nanoflex（Eksigent）
色谱柱填料
ChromXP C18-CL，3微米，120A
立柱尺寸
150 x 0.075毫米
流速
500 nL/分钟

色谱图

数据来源：全景

放大视图形象
放大视图形象
放大视图形象

响应曲线

数据来源：全景

放大视图形象
放大视图形象
看法放大图像

检索数据

装载机

可重复性

数据来源：全景

放大视图形象
  平均内部CV
（CV日内）		 平均批间CV
（日间CV）		 总CV
方程式		 n个=
碎片/过渡 低 医学 高 低 医学 高 低 医学 高 低 医学 高
y10（1+） 21.1 7.7 13.7 28.5 14.3 20.3 35.5 16.2 24.5 15 25 15
9岁（1+） 50.6 22.6 33.1 58.2 21.3 44.8 77.1 31.1 55.7 15 25 15
8岁（1+） 35.6 23 14.1 37 26.2 28.6 51.3 34.9 31.9 15 25 15
总和 22.6 8.4 11.5 28.6 14 20.2 36.5 16.3 23.2 15 25 15

其他资源和评论

资源
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在中查看肽展开图
查看蛋白质展开图
评论

CPTAC-502的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源：全景

官方基因符号
EPCAM公司
肽修饰顺序
LAVNC[+57.0]FVNNR（拉丁美洲国家标准）
修改类型
氨基甲基半胱氨酸
蛋白质-修饰位点
38
肽-修饰位点
5
肽开始
34
肽末端
44
CPTAC标识
CPTAC-502型
肽分子质量
1,319.6405
物种
人类 智者 （人类）
分析类型
直接MRM
矩阵
细胞系裂解液池
提交实验室
首尔国立大学/韩国科学技术学院和FHCRC
提交实验室PI
金英秀

出版物

查看详细信息 （在新窗口中打开）

证明大规模开发标准化分析以量化人类蛋白质的可行性。Kennedy JJ、Abbatiello SE、Kim K、Yan P、Whiteaker JR、Lin C、Kim JS、Zhang Y、Wang X、Ivey RG、Zhao L、Min H、Lee Y、Yu MH、Yang EG、Lee C、Wang P、Rodriguez H、Kim Y、Carr SA、Paulovich AG。Nat方法2014年2月；11(2):149-55. doi:10.1038/nmeth.2763。Epub 2013年12月8日。PMID:24317253

首尔国立大学/韩国科学技术研究所获得的响应曲线。弗雷德·哈钦森癌症研究中心获得的重复性数据。

首尔国立大学/韩国科学技术研究所获得的响应曲线。弗雷德·哈钦森癌症研究中心获得的重复性数据。

分析参数 折叠分析参数

数据来源：全景

仪器
5500个QTRAP（ABSCIEX）
内部标准
肽
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
13摄氏度，15牛顿度
信用证
nanoLC-Ultra 2D，cHiPLC-nanoflex（Eksigent）
色谱柱填料
ChromXP C18-CL，3微米，120A
立柱尺寸
150 x 0.075毫米
流速
500 nL/分钟

色谱图

数据来源：全景

放大视图形象
放大视图形象
放大视图形象

响应曲线

数据来源：全景

放大视图形象
放大视图形象
看法放大图像

检索数据

装载机

可重复性

数据来源：全景

放大视图形象
  平均内部CV
（CV日内）		 平均批间CV
（日间CV）		 总CV
方程式		 n个=
碎片/过渡 低 医学 高 低 医学 高 低 医学 高 低 医学 高
8岁（1+） 29 9.7 11.6 44.7 9.6 14.6 53.3 13.6 18.6 15 25 15
7岁（1+） 29.5 10.4 11.6 43.7 10.3 18.4 52.7 14.6 21.8 15 25 15
y6（1+） 28.1 11.9 8 69.1 22.1 10.1 74.6 25.1 12.9 15 25 15
总和 27.6 10.3 8.7 68 15 12.6 73.4 18.2 15.3 15 25 15

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