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引用CPTAC化验门户时,请包括以下声明
我们感谢美国国家癌症研究所临床蛋白质组肿瘤分析联盟(CPTAC)分析门户网站(assesss.Cancer.gov)用于开发分析并建立本出版物中所述分析的标准。

概述数据来源:UniProt

官方基因符号 其他别名
SDHA公司 SDH2、SDHF
序列长度(AA) 分子量(Da)
664 72692
蛋白质名称
琥珀酸脱氢酶[泛醌]黄素蛋白亚基,线粒体
来源
UniProt公司
磷化SitePlus®
基因卡
人类蛋白质阿特拉斯

蛋白质序列悬停以查看完整序列

10 20 30 40 50
MSGVRGLSRL公司 LSARRLALAK公司 AWPTVLQTGT公司 RGFHFTVDGN公司 KRASAKVSDS公司
60 70 80 90 100
ISAQYPVVDH公司 EFDAVVGAG公司 GAGLR公司A类A类F类G公司L(左) S公司E类A类G公司F类N个T型A类C类 T型K(K)LFPTRSHT公司
110 120 130 140 150
瓦格吉纳 LGNMEEDNWR公司 WHFYDTVKGS公司 DWLGDQDAIH公司 YMTEQAPAAV公司
160 170 180 190 200
VELENYGMPF公司 SRTEDGKIYQ公司 RAFGGQSLKF公司 GKGGQAHRCC公司 CVADRTGHSL公司
210 220 230 240 250
LHTLYGRSLR公司 YDTSYFVEYF年 ALDLLMENGE公司 CRGVIALCIE公司 DGSIHRIRAK公司
260 270 280 290 300
NTVVATGGYG公司 RTYFSCTSAH公司 TSTGDGTAMI公司 TRAGLPCQDL公司 EFVQFHPTGI公司
310 320 330 340 350
YGAGCLITEG公司 CRGEGGILIN公司 SQGERFMERY公司 无功半导体激光器 DVVSR模块
360 370 380 390 400
IREGRGCGPE公司 KDHVYLQLHH公司 LPPEQLATRL公司 PGISETAMIF公司 AGVDVTKEPI公司
410 420 430 440 450
PVLPTVHYNM公司 GGIPTNYKGQ公司 VLRHVNGQDQ公司 IVPGLYACGE公司 亚卡什甘
460 470 480 490 500
RLGANSLLDL公司 VVFGRACALS公司 IEESCRPGDK公司 VPPIKPNAGE公司 ESVMNLDKLR公司
510 520 530 540 550
FADGSIRTSE公司 LRLSMQKSMQ系列 NHAAVFRVGS公司 VLQEGCGKIS公司 KLYGDLKHLK公司
560 570 580 590 600
TFDRGMVWNT公司 DLVETLELQN公司 LMLCALQTIY公司 GAEARKESRG公司 AHAREDYKVR公司
610 620 630 640 650
IDEYDYSKPI公司 QGQQKKPFEE公司 HWRKHTLSYV公司 DVGTGKVTLE公司 YRPVIDKTLN公司
660 664
EADCATVPPA公司 IRSY公司

数据来源:UniProt


蛋白质图谱 折叠蛋白图

靶向肽分析物相对于SNP、异构体和PTM的位置

Uniprot公司数据库登录 磷网站+®

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查看下面的详细分析信息
所有其他点链接到 UniProt公司



磷酸化 乙酰化作用 泛素化 其他

加载

装载机

CPTAC-440的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
SDHA公司
肽修饰顺序
美国食品药品监督管理局[+57.0]美国食品药品监督管理局
修改类型
氨基甲基半胱氨酸
蛋白质-修饰位点
89
肽-修饰位点
14
肽开始
76
肽末端
92
CPTAC标识
CPTAC-440型
肽分子质量
1,742.8298
物种
人类 智者 (人类)
分析类型
直接MRM
矩阵
细胞系裂解液池
提交实验室
布罗德研究所和FHCRC
提交实验室PI
史提夫卡爾

出版物

查看详细信息 (在新窗口中打开)

证明大规模开发标准化分析以量化人类蛋白质的可行性。Kennedy JJ、Abbatiello SE、Kim K、Yan P、Whiteaker JR、Lin C、Kim JS、Zhang Y、Wang X、Ivey RG、Zhao L、Min H、Lee Y、Yu MH、Yang EG、Lee C、Wang P、Rodriguez H、Kim Y、Carr SA、Paulovich AG。Nat方法2014年2月;11(2):149-55. doi:10.1038/nmeth.2763。Epub 2013年12月8日。PMID:24317253


Broad Institute获得的响应曲线。弗雷德·哈钦森癌症研究中心获得的重复性数据。


Broad Institute获得的响应曲线。弗雷德·哈钦森癌症研究中心获得的重复性数据。


分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
5500个QTRAP(ABSCIEX)
内部标准
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
13摄氏度,15牛顿度
信用证
nanoLC-Ultra 2D,cHiPLC-nanoflex(Eksigent)
色谱柱填料
ChromXP C18-CL,3微米,120A
立柱尺寸
150 x 0.075毫米
流速
500 nL/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间简历)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
y11(1+) 21.6 11.8 5.8 21 10 8.4 30.1 15.5 10.2 15 25 15
y10(1+) 10.3 9.8 10.2 17.1 10.8 15.8 20 14.6 18.8 15 25 15
9岁(1+) 14.2 13 9.5 15.8 12.7 14.8 21.2 18.2 17.6 15 25 15
总和 10.1 9.4 3.7 14 8.7 11 17.3 12.8 11.6 15 25 15


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