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引用CPTAC分析门户时,请包括以下声明
我们感谢美国国家癌症研究所临床蛋白质组肿瘤分析联盟(CPTAC)分析门户网站(assesss.Cancer.gov)用于开发分析并建立本出版物中所述分析的标准。

HADHA(二十二碳六烯酸)

概述数据来源:UniProt

官方基因符号 其他别名
HADHA(二十二碳六烯酸) HADH公司
序列长度(AA) 分子量(Da)
763 83000
蛋白质名称
线粒体三功能酶亚单位α
来源
UniProt公司
磷化SitePlus®
基因卡
人类蛋白质阿特拉斯

蛋白质序列悬停以查看完整序列

10 20 30 40 50
MVACRAGIL公司 SRFSAFRILR公司 SRGYICRNFT公司 GSSALLTRTH公司 INYGVKGDVA公司
60 70 80 90 100
VVRINSPNSK公司 VNTLSKELHS公司 EFSEVMNEIW公司 ASDQIRSAVL公司 ISSKPGCFIA公司
110 120 130 140 150
GADINMLAAC公司 K(K)T型L(左)E类V(V)T型L(左)S公司 E类A类R(右)IVEKL公司 EKSTKPIVAA公司 INGSCLGGL公司
160 170 180 190 200
EVAISCQYRI公司 ATKDRKTVLG公司 TPEVLLGALP公司 GAGGTQRLPK公司 MVGVPAALDM公司
210 220 230 240 250
MLTGRSIRAD公司 RAKKMGLVDQ公司 LVEPLGPGLK公司 PPEERTIEYL公司 EEVAITFAKG公司
260 270 280 290 300
LADKKISPKR公司 DKGLVEKLTA公司 YAMTIPFVRQ公司 QVYKKVEEKV公司 RKQTKGLYPA公司
310 320 330 340 350
PLKIIDVVK公司T型 G公司E类G公司S公司D类A类G公司Y(Y) L(左)C类E类S公司K(K)FGEL公司 VMTKESKALM公司 GLYHGQVLCK公司
360 370 380 390 400
KNKFGAPQKD公司 VKHLAILGAG公司 LMGAGIAQVS公司 VDKGLKTILK公司 数据标签图
410 420 430 440 450
QQQVFKGLND公司 KVKKKALTSF公司 erdsfsnlt公司 GQLDYQGFEK公司 管理员
460 470 480 490 500
DLSLKHRVLK公司 EVEAVIPDHC公司 IFASNTSALP公司 ISEIAAVSKR公司 PEKVIGMHYF公司
510 520 530 540 550
SPVDKMQLLE公司 IITTEKTSKD公司 TSASAVAGL公司 KQGKVIIVHK公司 DGPGFYTTRC公司
560 570 580 590 600
LAPMMSEVIR公司 ILQEGVDPKK公司 LDSLTTSFGF公司 PVGAATLVDE公司 VGVDVAKHVA公司
610 620 630 640 650
EDLGKVFGER公司 FGGGNPELLT公司 QMVSKGFLGR公司 KSGKGFYIYQ公司 EGVKRKDLNS公司
660 670 680 690 700
DMDSILASLK公司 LPPKSEVSSD公司 EDIQFRLVTR软件 FVNEAVMCLQ公司 EGILATPAEG公司
710 720 730 740 750
DIGAVFGLGF公司 PPCLGGPFRF公司 VDLYGAQKIV公司 DRLKYEAAY公司 GKQFTPCQLL公司
760 763
ADHANSPNKK公司 财政季度

数据来源:UniProt


蛋白质图谱 折叠蛋白质图谱

靶向肽分析物相对于SNP、异构体和PTM的位置

Uniprot公司数据库登录 磷网站+®

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查看下面的详细分析信息
所有其他点链接到 UniProt公司



磷酸化 乙酰化 泛素化 其他

加载

装载机

CPTAC-215的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
HADHA(二十二碳六烯酸)
肽修饰顺序
TGIEQGSDAGYLC[+57.0]ESQK公司
修改类型
氨基甲基半胱氨酸
蛋白质-修饰位点
322
肽-修饰位点
13
肽开始
310
肽末端
326
CPTAC标识
CPTAC-215型
肽分子质量
1,841.8102
物种
人类 智者 (人类)
分析类型
直接MRM
矩阵
细胞系裂解液池
提交实验室
弗雷德·哈钦森癌症研究中心
提交实验室PI
阿曼达·保罗维奇

出版物

查看详细信息 (在新窗口中打开)

证明大规模开发标准化分析以量化人类蛋白质的可行性。Kennedy JJ、Abbatiello SE、Kim K、Yan P、Whiteaker JR、Lin C、Kim JS、Zhang Y、Wang X、Ivey RG、Zhao L、Min H、Lee Y、Yu MH、Yang EG、Lee C、Wang P、Rodriguez H、Kim Y、Carr SA、Paulovich AG。Nat方法2014年2月;11(2):149-55. doi:10.1038/nmeth.2763。Epub 2013年12月8日。PMID:24317253


分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
5500个QTRAP(ABSCIEX)
内部标准
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
13摄氏度,15牛顿度
信用证
nanoLC-Ultra 2D,cHiPLC-nanoflex(Eksigent)
色谱柱填料
ChromXP C18-CL,3微米,120A
立柱尺寸
150 x 0.075毫米
流速
500 nL/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均批间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
y10(1+) 7.7 9 12.7 9.5 11 10.1 12.2 14.2 16.2 15 25 15
9岁(1+) 10.4 9 9.7 9.8 10.3 9.8 14.3 13.7 13.8 15 25 15
8岁(1+) 7.1 7.6 8.6 7.6 9.3 7.6 10.4 12 11.5 15 25 15
总和 4.7 6.8 9 5 8.6 7.7 6.9 11 11.8 15 25 15


其他资源和评论

评论

CPTAC-214的含量测定细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
HADHA(二十二碳六烯酸)
顺序
TLQEVTQLSQEAQR公司
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽开始
112
肽末端
125
CPTAC标识
CPTAC-214型
肽分子质量
1629.8322美元
物种
人类 智者 (人类)
分析类型
直接MRM
矩阵
细胞系裂解液池
提交实验室
弗雷德·哈钦森癌症研究中心
提交实验室PI
阿曼达·保罗维奇

出版物

查看详细信息 (在新窗口中打开)

证明大规模开发标准化分析以量化人类蛋白质的可行性。Kennedy JJ、Abbatiello SE、Kim K、Yan P、Whiteaker JR、Lin C、Kim JS、Zhang Y、Wang X、Ivey RG、Zhao L、Min H、Lee Y、Yu MH、Yang EG、Lee C、Wang P、Rodriguez H、Kim Y、Carr SA、Paulovich AG。Nat方法2014年2月;11(2):149-55. doi:10.1038/nmeth.2763。Epub 2013年12月8日。PMID:24317253


分析参数 塌陷分析参数

数据来源:全景

仪器
5500个QTRAP(ABSCIEX)
内部标准
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
13摄氏度,15牛顿度
信用证
nanoLC超2D,cHiPLC纳米柔性(Eksigent)
色谱柱填料
ChromXP C18-CL,3微米,120A
立柱尺寸
150 x 0.075毫米
流速
500 nL/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
9岁(1+) 7.4 9.9 8.4 11.3 15.8 11.4 13.5 18.6 14.2 15 25 15
8岁(1+) 14.9 12.5 6.3 21.1 14.4 9 25.8 19.1 11 15 25 15
7岁(1+) 11 10.7 9.9 18.7 14.7 11.6 21.7 18.2 15.3 15 25 15
总和 6.6 8.6 7 14.1 14 10 15.6 16.4 12.2 15 25 15


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