睡眠流行病学、遗传学和神经生理学


波士顿哈佛医学院百翰女子医院

我们开发了几个免费的开源软件遗传分析软件包和网络工具最近,睡眠数据。

卢娜

用于分析睡眠信号数据的软件,目前重点是处理EDF文件中的EEG信号。包括一个R图书馆(卢纳)也可以作为Docker使用图像。

PLINK公司
A类单核苷酸多态性(SNP)和拷贝数工具集变异(CNV)全基因组关联研究。包括数据管理、质量控制、汇总统计、,关联分析与IBD/祖先推断(Purcell等人2007年).
GPC:遗传功率计算器

基于病例/对照和数量性状的基于家庭和基于人群的基本功率计算的Web服务关联研究和QTL连锁研究(Purcell等人,2003年Sham等人,2000年).

XHMM公司

旨在通过以下方法检测靶向测序研究中的拷贝数变异(CNV)读取深度数据的分析(Fromer等人,2012年).

印度

GWAS、CNV和其他病毒的基因集富集分析软件基于基因组、间隔的全基因组研究设计置换方案(Lee等人,2012年).

锁扣/序列
设计用于分析下一代测序研究(面向VCF)的变异数据,主要是外显子组测序研究。
BGIM公司
孪生分析入门在线教程,该网站提供了我在2001年创建的模块集合,旨在提供介绍一些基本的数量遗传学概念在双胞胎研究中。此外,对其他统计遗传学概念,如连锁不平衡和最大似然估计可以通过以下方法找到以上链接。
基因文库

Genebook旨在创建简单的基于web的数据库遗传研究的结果。把基因簿想象成一种互动典型期刊文章中补充表的版本。


冗余、不受支持的软件和脚本

这些主要是出于历史原因。