metaFlye公司 swMATH ID: 43302 软件作者： 米哈伊尔·科尔莫戈罗夫（Mikhail Kolmogorov）、米哈伊尔雷科（Mikhail Rayko 描述： metaFlye：使用重复图的可扩展长读元基因组组装。与使用短读技术产生的片段组装相比，长读测序技术大大改进了许多分离细菌基因组的组装。然而，即使对于最先进的长读汇编程序来说，组装复杂的宏基因组数据集仍然是一个挑战。为了解决这个问题，我们提出了metaFlye汇编程序，并证明它可以生成高度连续和精确的元基因组汇编。与通常无法重建全长16S RNA基因的短读本宏基因组汇编程序不同，metaFlye在长连续序列中捕获了许多16S RNA的基因，从而为分析微生物“生命暗物质”提供了新的机会。我们还证明，与短读汇编器相比，长读元基因组汇编器显著改善了全长质粒和病毒的重建，并揭示了许多新的质粒和病毒。 主页： https://www.biorxiv.org/content/10.101/1637637v1.full 源代码： https://github.com/fenderglass/Flye 相关软件： 琥珀色;离心机;MaxBin（最大箱子）;MetaBAT公司;扁圆;最小值2;剪影;UMAP公司;快速;MetaQUAST公司;序列2Vec;LR宾纳;金属BCC LR;OGRE公司;hdbs扫描;SimLoRD公司;github;PyTorch公司;克拉克;MetaProb公司 引用于： 2文件 3位作者引用 2 林，于 1 Mallawaarachi，维吉尼G。 1 Wickramarachchi，Anuradha S。 0连载引用 在1个字段中引用 2 生物学和其他自然科学（92-XX） 按年份列出的引文