MetaQUAST公司 swMATH ID: 43126 软件作者： Alla Mikheenko、Vladislav Saveliev、Alexey Gurevich 描述： MetaQUAST：元基因组集合的评估。在过去几年中，我们见证了新的宏基因组组装方法的快速发展。虽然有许多为单基因组组装设计的基准实用程序，但没有公认的宏基因组特异性类似物评估和比较工具。在这篇文章中，我们介绍了MetaQUAST，它是QUAST的一种改进，是一种最先进的基于参考比对的基因组组装评估工具。MetaQUAST解决了这样的宏基因组数据集的特征，如（i）通过检测和下载参考序列来确定未知物种的含量，（ii）通过提供多个基因组的综合报告来实现巨大的多样性，以及（iii）通过检测嵌合体连接来发现高度相关物种。我们通过在一个模拟数据集和两个实际数据集上比较几个主要的汇编程序来演示MetaQUAST的性能。 主页： http://quast.sourceforge.net/metaquast.html 源代码： https://github.com/ablab/quast/ 相关软件： 最小值2;metaSPAdes（元SPAdes）;卡努;SPAdes系列;metaFlye公司;剪影;UMAP公司;快速;琥珀色;离心机;序列2Vec;LR宾纳;金属BCC LR;MaxBin（最大箱子）;MetaBAT公司;OGRE公司;扁圆;hdbs扫描;SimLoRD公司;github 引用于： 2文件 更多出版物： http://quast.sourceforge.net/publications.html 3位作者引用 1 林，于 1 罗润鹏 1 Wickramarachchi，Anuradha S。 0连载引用 在1个字段中引用 2 生物学和其他自然科学（92-XX） 按年份列出的引文