Seungchul Baek先生;朴俊永 估算物种丰富度和稀少度曲线的计算效率方法。 （英语） Zbl 1505.62045号 计算。斯达。 37，第4期，1919-1941（2022）. 摘要：在生态和教育研究中，基于经验样本的物种总数和稀少曲线的估计是重要的工具。我们提出了一种基于现成的数值方法（如二次优化）来估计稀疏曲线和物种数量的新方法。开发该算法的关键思想是基于非参数经验Bayes估计，通过基于（g）建模的线性约束二次优化，将插值稀疏曲线纳入[B.埃夫隆，统计科学。29，第2期，285–301（2014年；Zbl 1332.62031号)]. 我们提出的算法易于实现，在计算速度和精度方面表现出比现有方法更好的性能。此外，我们还提供了估计过程中选择一些调整参数的模型选择准则，以及基于渐近理论而非重采样方法的置信区间思想。我们给出了估计量的一些渐近结果，从理论上验证了估计量的有效性。还进行了广泛的数值研究，包括模拟和实际数据示例，并将其产生的增益与现有方法进行了比较。 MSC公司： 62-08 统计问题的计算方法 62G05型 非参数估计 62C12号机组 经验决策程序；经验贝叶斯过程 62页第10页 统计学在生物学和医学中的应用；元分析 关键词：非参数经验贝叶斯;二次优化;稀疏曲线;物种丰富度 引文：Zbl 1332.62031号 软件：物种 PDF格式BibTeX公司 XML格式引用 \textit{S.Baek}和\textit{J.Park}，计算。Stat.37，No.4，1919--1941（2022；Zbl 1505.62045） 全文： 内政部 参考文献： [1] Acinas，新加坡；Klepac-Ceraj，V.公司。；亨特，DE；Pharino，C。；塞拉吉，I。；Distel，DL；Polz，MF，复杂细菌群落的精细系统发育结构，《自然》，430，6999，551（2004）·doi:10.1038/nature02649 [2] Baayen，RH，词频分布（2002），柏林：施普林格出版社，柏林·Zbl 0989.68146号 [3] 巴格尔，K。；Bunge，J.，物种数量的客观贝叶斯估计，贝叶斯分析，5，4，765-785（2010）·Zbl 1330.62110号 ·doi:10.1214/10-BA527 [4] Ben-Hamou，A。；Boucheron，S。；Ohannessian，MI，《占用数量和缺失质量无限urn方案中的浓度不等式及其应用》，Bernoulli，23，1，249-287（2017）·Zbl 1366.60016号 ·doi:10.3150/15-BEJ743 [5] Bertram，D.，《棉鼠丝虫病传播的研究：I.载体liponyssus bacoti个体感染强度的变异性，其原因及其对定量传播问题的影响》，Ann Trop Med Parasitol，43，3-4，313-332（1949）·doi:10.1080/0034983.1949.11685416 [6] Böhning，D.，关于泊松过度分散测试的注释，生物统计学，81，2，418-419（1994）·Zbl 0825.62459号 ·doi:10.2307/2336974 [7] Böhning，D.，混合物的计算机辅助分析和应用：荟萃分析、疾病绘图和其他（1999），剑桥：CRC出版社，剑桥·Zbl 0951.62088号 [8] Böhning，D。；Schön，D.，基于计数分布的人口规模的非参数最大似然估计，J R Stat Soci Ser C（Appl Stat），54，4，721-737（2005）·兹比尔1379.62096 ·文件编号：10.1111/j.1467-9876.2005324.x [9] 邦吉，J。；Fitzpatrick，M.，《物种数量估算：综述》，《美国统计学会杂志》，88，421，364-373（1993） [10] 芝士，CS；Wang，Y.，使用离散k单调分布进行物种丰富度的非参数估计，《计算统计数据分析》，93，107-118（2016）·Zbl 1468.62036号 ·doi:10.1016/j.csda.2014.10.021 [11] 科威尔，RK；JA Coddington，通过外推估算陆地生物多样性，Philos Trans R Soc Lond B Biol Sci，345，1311，101-118（1994）·doi:10.1098/rstb.1994.0091 [12] 科威尔，RK；赵，A。；新泽西州哥泰利；林，SY；毛，CX；查兹登，RL；Longino，JT，《将基于个体和基于样本的稀少联系起来的模型和估计器，集合的外推和比较》，《植物生态学杂志》，5，1，3-21（2012）·doi:10.1093/jpe/rtr044 [13] Efron，B.，《经验贝叶斯估计的两种建模策略》，《统计科学》，29，285-301（2014）·Zbl 1332.62031号 ·doi:10.1214/13-STS455 [14] 埃夫隆，B。；Thisted，R.，估算看不见物种的数量：莎士比亚知道多少单词？，《生物特征》，63、3、435-447（1976）·Zbl 0344.62088号 [15] 格尼丁，A。；Hansen，B。；Pitman，J.，关于无限多箱占用问题的注记：一般渐近和幂律，Probab Surv，4146-171（2007）·Zbl 1189.60050号 ·doi:10.1214/07-PS092 [16] 很好，我。；Toulmin，G.，当样本增加时，新物种的数量和种群覆盖率的增加，Biometrika，43，1-2，45-63（1956）·Zbl 0070.14403号 ·doi:10.1093/生物技术/43-1-2.45 [17] Greenshtein，E。；Itskov，T.，非参数经验贝叶斯在无反应治疗中的应用，Stat Sin，282189-2208（2018）·Zbl 1406.62014年 [18] Greenshtein，E。；Ritov，Y.，高维线性预测器选择的持续性和超参数化的优点，Bernoulli，10，6，971-988（2004）·Zbl 1055.62078号 ·doi:10.350/bj/1106314846 [19] Hasselblad，V.，指数族分布的有限混合估计，美国统计协会杂志，64，328，1459-1471（1969）·doi:10.1080/01621459.1969.10501071 [20] 霍尔，AE；Kennard，RW，Ridge回归：非正交问题的有偏估计，技术计量学，12，1，55-67（1970）·Zbl 0202.17205号 ·网址：10.1080/00401706.1970.10488634 [21] Hurlbert，SH，《物种多样性的非概念：批判和替代参数》，生态学，52，4，577-586（1971）·doi:10.2307/1934145 [22] 蒋伟（Jiang，W.）。；Zhang，CH，正态均值的一般最大似然经验贝叶斯估计，Ann Stat，37，4，1647-1684（2009）·Zbl 1168.62005号 ·doi:10.1214/08-AOS638 [23] Mao，CX，估算物种积累曲线和多样性指数，Stat Sin，17，761-774（2007）·Zbl 1144.62108号 [24] 毛，CX；科尔维尔，RK，《物种丰富度估算：混合模型、稀有物种的作用和推断挑战》，生态学，86，5，1143-1153（2005）·doi:10.1890/04-1078 [25] 毛，XC；科威尔，RK；Chang，J.，使用混合物估算物种累积曲线，生物计量学，61，2，433-441（2005）·Zbl 1077.62125号 ·文件编号：10.1111/j.1541-0420.2005.00316.x [26] 诺里斯，JL；Pollock，KH，两种异质性封闭捕获-再捕获模型下的非参数MLE，生物统计学，52，639-649（1996）·Zbl 0875.62536号 ·doi:10.2307/2532902 [27] 诺里斯，JL；Pollock，KH，考虑物种间异质性的泊松物种丰度模型的非参数MLE，《环境生态统计》，5，4，391-402（1998）·doi:10.1023/A:1009659922745 [28] 奥利茨基，A。；苏雷什，AT；Wu，Y.，《未发现物种数量的最优预测》，国家科学院学报，113，47，13283-13288（2016）·Zbl 1407.62409号 ·doi:10.1073/pnas.1607774113 [29] Palmer，MW，《通过外推估算物种丰富度》，生态学，71，3，1195-1198（1990）·doi:10.2307/1937387 [30] Portnoy，S.，当（p^2/n）较大时回归参数的（m）-估计量的渐近行为。I.一致性，Ann Stat，12，4，1298-1309（1984）·Zbl 0584.62050号 ·doi:10.1214操作系统/1176346793 [31] Sanders，HL，《海洋底栖生物多样性：比较研究》，Am Nat，102，925，243-282（1968）·doi:10.1086/282541 [32] 沈，TJ；赵，A。；Lin，CF，在进一步分类取样中预测新物种的数量，生态学，84，3，798-804（2003）·doi:10.1890/0012-9658（2003）084[0798:PTNONS]2.0.CO；2 [33] Simar，L.，复合泊松过程的最大似然估计，Ann Stat，4，6，1200-1209（1976）·兹比尔0362.62095 ·doi:10.1214/aos/1176343651 [34] Smith，W。；Grassle，JF，多样性测量家族的取样特性，生物统计学，33，283-292（1977）·Zbl 0357.92026号 ·doi:10.2307/2529778 [35] Spevack M（1968）与莎士比亚作品的完整而系统的一致性，第1-6卷。希尔德斯海姆：乔治·奥尔姆斯 [36] 乌克兰，KI；格雷，JS；Ellingsen，KE，物种积累曲线和物种丰富度估计，动物生态学杂志，72，5888-897（2003）·网址：10.1046/j.1365-2656.2003.00748.x [37] Wang，JP，通过泊松复合伽马模型估算物种丰富度，Biometrika，97，3，727-740（2010）·Zbl 1195.62167号 ·doi:10.1093/biomet/asq026 [38] 王，JPZ；Lindsay，BG，物种丰富度估算的惩罚非参数最大似然法，美国统计协会，100471942-959（2005）·Zbl 1117.62439号 ·doi:10.1198/0162145000002005 [39] Wang，JP，SPECIES:物种丰富度估算的R包，J Stat Softw，40，9，1-15（2011）·doi:10.18637/jss.v040.2009 此参考列表基于出版商或数字数学图书馆提供的信息。其项与zbMATH标识符进行启发式匹配，可能包含数据转换错误。在某些情况下，zbMATH Open的数据对这些数据进行了补充/增强。这试图尽可能准确地反映原始论文中列出的参考文献，而不要求完整或完全匹配。