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基于详细HP模型及其多重分形和相关分析的蛋白质序列的混沌博弈表示。 (英语) Zbl 1439.92148号

摘要:类似于由H.J.杰弗里【“基因结构的混沌博弈表示”,《核酸研究》18,第8期,2163-2170(1990;doi:10.1093/nar/18.8.2163)]基于详细的HP模型,提出了一种新的蛋白质序列CGR。对基于全基因组蛋白质序列CGR的测度进行了多重分形和相关分析。所研究的所有生物体的(D_q)光谱都是多重分形的,并且足够平滑,因此(C_q)曲线是有意义的。细菌的C_q曲线在临界点处类似于经典相变。为了构建更精确的细菌系统发育树,还提出了基于蛋白质序列CGR的差异度量与其分形背景之间的相关距离。

MSC公司:

92D20型 蛋白质序列,DNA序列
91A80型 博弈论的应用
28A80型 分形
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