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纳撒尼尔·哈利南

广义时间变量重构了出生-死亡过程。 （英语） Zbl 1397.92494号

J.西奥。生物。 300, 265-276 (2012).
摘要：最近许多研究探讨了不同时间变量的出生-死亡过程对现存分类群系统发育中分支时间分布的影响。以前的工作已经说明了如何计算一个重建的恒速出生-死亡过程的谱系数和分支时间的分布，该过程在过去某个时间从一个或两个重建谱系开始，或在现在以一些谱系结束。在这里，我扩展了这项工作，以包括任何时间变量的出生-死亡过程，该过程以任何数量的重建谱系开始，并且/或者以任何时间的任何数量的重构谱系结束，我计算了该过程下的一些分布。我还探讨了离散时间出生-死亡过程，该过程可作为任何时间变量出生-死亡进程的有效和准确的数值解，并允许将采样和大规模灭绝进行分析合并。我描述了如何使用这些分布通过最大似然分析来比较不同的时间变量模型，并展示了如何在这些模型下模拟随机树。我还介绍了两种评估不同时间变量出生-死亡过程的可视化方法；这些方法通过绘制谱系数量和等待时间随时间的变化来说明分布的形状。

引用于5文件

MSC公司：

92D15型 与进化有关的问题
60J85型 分支过程的应用

关键词：

穿越时间的血统;多元化;模拟树
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\textit{N.Hallina}，J.Theor。生物300，265--276（2012；Zbl 1397.92494）
全文： 内政部

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