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从加权四元组生成平面分裂网络的QNet算法的一致性。 (英语) Zbl 1182.92056号

概述:系统发育网络是进化树或系统发育树的泛化,允许在单个图表中表示冲突信号或替代进化历史。最近引入了四元网或“QNet”方法,这是一种从一组加权四元树(即具有4个叶子的系统发育树)中计算一种特殊类型的系统发育网络(称为分裂网络)的方法。这可以看作是基于距离的邻域网(NNet)方法的四重模拟,用于构建外部标记的平面分裂网络。我们证明了QNet是一个一致的方法,也就是说,如果QNet被应用于一个由循环分裂权重函数产生的加权四元数集合,那么它将精确地返回这个函数。QNet的这一关键特性不仅确保了当输入与树对应时可以保证生成树,当输入与这样的网络对应时可以生成外标平面分裂网络,而且还为该方法的设计提供了主要指导原则。

MSC公司:

92D15型 与进化有关的问题
05C90年 图论的应用
68周25 近似算法
05C85号 图形算法(图形理论方面)
2008年9月 生物学问题的计算方法
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全文: 内政部

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