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霍华德·莱文。;尼尔森·汉密尔顿，马里特

SELEX的数学分析。 （英语） Zbl 1124.92015年

计算。生物化学。 31，第1期，11-35（2007）.
摘要：通过指数富集（SELEX）对配体进行系统进化是一种程序，通过该程序，序列不同的核酸混合物可以分离成纯组分，目的是分离出具有特定生化活性的组分。其基本思想是将混合物与特定的靶分子结合，然后分离靶分子-由此产生的反应产生的NA络合物。目标-然后用机械方法（例如过滤）分离NA复合物，然后从复合物中洗脱NA，用聚合酶链反应（PCR）扩增，重复该过程。经过几轮之后，应该会留下一个[NA]池，其中大部分是原始池中最能与目标结合的物种。签署人D.欧文等[SELEXION，《通过指数富集和非线性分析综合优化核酸的系统进化》，《分子生物学杂志》222739–761（1991）]对这一过程进行了数学分析。
我们重温了Irvine等人。通过重写SELEX过程的方程式，我们大大减少了计算核酸组分逐轮分布的工作量。我们还为SELEX过程建立了必要和充分的条件，使其收敛到一个仅由最佳结合核酸与固定靶点组成的池中，从而使结合靶点的百分比最大化。假设靶上有一个单一的核酸结合位点，允许不超过一个核酸占据。我们分析了没有背景损失的情况（没有支持损失，支持上没有剩余的[NA]）。然后，我们检查存在此类损失的情况。该分析的意义在于，它为Irvine等人定义的SELEX过程提供了一种实验方法，即收敛到一个由单一最佳结合核酸组成的池中，而无需依赖关于结合常数性质或单个核酸片段分布的任何先验信息。

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引用于5文件

理学硕士：

92C40型 生物化学、分子生物学
92C45型 生物化学问题动力学（药代动力学、酶动力学等）
37N25号 生物学中的动力系统
92-08 生物学相关问题的计算方法

关键词：

阿普塔默
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\textit{H.A.Levine}和\textit{M.Nilsen-Hamilton}，计算。生物化学。31，第1号，第11--35条（2007；Zbl 1124.92015）
全文： 内政部 链接

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