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几根原木就足以(几乎)建造所有的树。一、。 (英语) Zbl 0945.60004号

作者提出了一种新的基于k位点序列数据的物种系统发育树重建方法,即二进闭合法(DCM)。他们表明,为了在任何站点替换模型下以高概率重建树,对于任何重建方法,(k)的增长速度必须至少与(ln n)一样快。他们还表明,在i.i.d.模型下,有一种简单的重建方法,需要(k)至少与(n)一样快。对于DCM,他们表明,在一个简单的随机模型(Neyman 2-状态替代模型)下,假设突变率位于一个固定的区间,几乎所有树的(k)只需要增长为(ln n)的幂。对于这样的\(k)值,很有可能满足某个条件,并且证明该条件足以使DCM在顺序为\(n^{5}\ln n \)的时间内准确返回任何输入的未根标记树。这些结果表明,用实际长度的序列可以准确地重建系统发育树。

MSC公司:

60二氧化碳 组合概率
92D15型 与进化有关的问题
05二氧化碳
92D20型 蛋白质序列,DNA序列
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全文: 内政部

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